密码子使用

作品数：200被引量：714H指数：19
导出分析报告
相关领域：生物学更多>>
相关作者：张伟张宇宏刘波续晨顾万君更多>>
相关机构：东南大学中国科学院中国农业大学中国农业科学院生物技术研究所更多>>
相关期刊：更多>>
相关基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
-
在结果中检索

检索结果分析

结果分析中...
共 条 记 录，以下是1-10
全选清除导出
参考文献引证文献引用追踪
视图：
排序：
“红阳”猕猴桃叶绿体基因组密码子使用偏性分析
《西南林业大学学报（自然科学）》2024年第6期81-88,共8页罗秦欢 段炼 赵月梅 
贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教技[2022]248号)资助;贵州师范学院博士科研启动项目(2022BS015)资助。
为了解中华猕猴桃优良品种“红阳”猕猴桃的叶绿体基因组密码子的偏好性,利用Codon W和在线CUSP软件对“红阳”猕猴桃叶绿体基因组中的51条编码序列的密码子进行中性绘图、ENC−plot和PR2−plot分析。结果表明:“红阳”猕猴桃密码子不同...
关键词：“红阳”猕猴桃 叶绿体 基因组 密码子偏性 
BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
《江苏农业学报》2024年第11期2111-2121,共11页杨宣叶 高明阳 胡欣妍 王进千 王慧慧 丁玉林 曹小安 马晓霞 
甘肃省自然科学基金项目(23JRRA715)。
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使...
关键词：牛病毒性腹泻病毒 BVDV-2d 病理变化 同义密码子 遗传 
板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性分析
《江苏农业科学》2024年第21期40-46,共7页杨涌 付丽枝 王萌 王旋 刘静 于立洋 王东升 路艺 张海娥 
国家重点研发计划(编号:2022YFD2200400);河北省重点研发计划(编号:21326304D);河北科技师范学院博士启动基金(编号:2023YB026)。
为明确板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性及其形成原因,利用CodonW与EMBOSS软件对从板栗叶绿体基因组密码子中筛选出来的52条蛋白编码序列进行分析。结果显示,板栗叶绿体基因组密码子中同义密码子相对使用频率超过1的有31个,并且多以A或...
关键词：板栗 叶绿体基因组 密码子 使用偏好性 最优密码子 
广丰千金薯叶绿体基因组序列特征及密码子使用偏好性分析
《中草药》2024年第21期7444-7461,共18页尹明华 范馨月 付悦欣 胡慧玲 
国家自然科学基金资助项目(31960079);江西省科技厅重点研发计划一般项目(20202BBG73010);江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ201704);江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-13-赣东站);上饶市科技局平台载体建设项目(2020J001)。
目的 解析广丰千金薯Dioscorea opposite叶绿体基因组信息序列特征和确定其在薯蓣属的系统位置。方法 利用高通量测序技术对广丰千金薯叶片进行核基因组重测序,并利用生物信息学相关工具对组装得到的叶绿体基因组进行注释、序列特征和...
关键词：广丰千金薯 叶绿体基因组 序列特征 系统发育分析 野脚板薯 
基于转录组数据的湿地松密码子使用偏好性分析
《江苏农业科学》2024年第18期50-59,共10页胡蓉 赖猛 张露 陈婷萱 黄文丁 易敏 
江西省重点研发计划一般项目(编号:20203BBFL63058);江西省自然科学基金青年基金(编号:20212BAB215013);国家自然科学基金(编号:32160385);江西省林业厅林业科技创新专项(编号:202311)。
研究湿地松转录组编码序列的密码子使用偏好性,明确密码子使用频率,探究湿地松异源表达受体的最佳选择,为湿地松分子育种奠定基础。以筛选到的13932条湿地松转录组编码序列(coding sequence,CDS)为研究对象,利用CodonW 1.4.2、EMBOSS在...
关键词：湿地松 转录组 最优密码子 密码子使用偏好性 
西南牡蒿叶绿体基因组特征及系统发育分析被引量：1
《广西植物》2024年第9期1732-1745,共14页李志芳 陈丽玲 罗淑洁 刘天猛 
云南省基础研究专项青年项目(202001AU070017);大理大学博士科研启动费项目(KY2096107540)。
为探究西南牡蒿(Artemisia parviflora)的叶绿体基因组结构特征及其系统位置,该研究利用高通量测序技术对其进行测序,并借助生物信息学工具进行分析。结果表明:(1)西南牡蒿叶绿体基因组长151 047 bp,呈现为由4部分组成的环状双链结构,G...
关键词：西南牡蒿 叶绿体基因组 密码子使用偏性 分子标记 系统发育分析 
普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子使用特征对比被引量：2
《江苏农业学报》2024年第8期1507-1520,共14页朱艳 韩长志 
云南省研究生导师团队建设项目(2022100);云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(YNWR-QNBJ-2020-188)。
本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利...
关键词：普通核桃 深纹核桃 叶绿体 基因组 同义密码子 偏好性 
基于转录组数据的红三叶密码子使用偏好性分析
《草地学报》2024年第6期1752-1759,共8页花梅 吕丽娟 穆赢通 张晓明 郝宁 王俊杰 刘媛 
内蒙古农业大学动植物育种专项“抗寒型白三叶品种选育”(YZGC2017009);内蒙古自治区科技计划“草地多功能兼用型草种高效繁育与加工利用技术集成”(2022YFDZ0025);内蒙古自治区科技计划“小秦艽野生栽培驯化及种子繁育关键技术研究”(2023YFHH011302);内蒙古自治区教育科学“十四五”规划课题(NGJGH2023405);内蒙古自治区高校中(蒙)药材生态种植工程研究中心(培育)项目资助。
研究红三叶(Trifolium pratense L.)叶片的密码子使用偏好性,可为优化密码子组成奠定基础。研究通过CodonW,R,CUSP等软件对红三叶叶片转录组中5 513条编码序列进行密码子使用模式和偏好性分析。研究发现,GC3与GC12相关性较弱,表明选择...
关键词：红三叶叶片 密码子偏好性 转录组 编码序列 
2种楠属植物叶绿体基因组特征及系统发育
《东北林业大学学报》2024年第6期58-63,84,共7页戴前莉 朱恒星 魏卓 卢敏 黄飞逸 陈本文 
重庆市科技兴林重点项目(ZD2022-2)。
应用Illumina Novaseq 6000高通量测序平台进行测序,组装了完整的崖楠(Phoebe yaiensis)和红毛山楠(Phoebe hungmoensis)叶绿体基因组,并对其基因组特征、基因构成、序列重复、边界收缩、密码子偏好性及系统发育进行分析。结果表明:崖...
关键词：崖楠 红毛山楠 叶绿体基因组 SSR 密码子使用偏性 系统发育 
辽细辛叶绿体基因组密码子使用偏好性分析被引量：1
《分子植物育种》2024年第9期2864-2872,共9页孙英新 李靖 艾强 吕泽良 刘翠晶 杨利民 
国家重点研发计划项目(2019YFC1710700);财政部、农业农村部:国家现代农业产业技术体系项目(CARS-21);吉林省科技发展计划项目(20210204184YY)共同资助。
确定中草药辽细辛叶绿体基因组密码子使用偏好性及其成因。密码子使用特性利用CodonW 1.4.2软件和CUSP程序分析50条经筛选的CDS序列,结合中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析,最终确定最优密码子。结果显示,叶绿体基因组密码子不同位置碱...
关键词：辽细辛(A.heterotropoides) 叶绿体基因组 密码子偏性 最优密码子 
全选清除导出
共20页<12345678910>
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部