计算机虚拟筛选

作品数:27被引量:129H指数:8
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相关作者:朱伟阮新民陈哲史海龙刘述更多>>
相关机构:广东省中医院中国科学院上海生命科学研究院中国海洋大学中国中医科学院西苑医院更多>>
相关期刊:《中国药房》《中国药理学通报》《上海中医药大学学报》《时珍国医国药》更多>>
相关基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划广东省中医药局建设中医药强省科研课题更多>>
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基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂
《国际医药卫生导报》2022年第9期1204-1208,共5页刘治国 崔文强 魏叶 朱心瑶 杨雪 
江苏省“六大人才高峰”项目(WSN-342);江苏省青年医学重点人才项目(QNRC2016480);宿迁市科技计划项目(S201720)。
目的采用分子对接技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂。方法研究时间为2021年1月至9月。基于过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)的PDB晶型结构(PDBCode:6md4),构建虚拟靶标模型,以天然产物数据库中的1680个化合物为配体筛选对象,以6md...
关键词:2型糖尿病 PPARΓ 计算机虚拟筛选 分子对接 
基于中医方剂的活性组分筛选的研究策略与思考
《中医学报》2021年第10期2045-2050,共6页任周新 李君 刘海军 
国家中医临床研究基地业务建设第二批科研专项项目(JDZX2015l56)。
目的:基于中医方剂的活性,研究方剂组分筛选的策略。方法:通过对当前方剂有效组分筛选的流程进行回顾,从方剂信息的获取、数据挖掘和方剂组分的筛选模式等角度对方剂组分筛选的研究策略进行了阐释,重点介绍了计算机辅助虚拟筛选的应用...
关键词:方剂 活性 组分筛选 计算机虚拟筛选 
源于天然的酶抑制剂高效发现及评价新技术:进展与展望被引量:4
《上海中医药大学学报》2021年第1期1-11,19,共12页赵东方 何荣景 侯旭东 纪东瑞 张庆华 王平 葛广波 
国家自然科学基金资助项目(81922070,81973286,81773687);国家重点研发计划基金资助项目(2017YFC1700200,2017YFC1702000);上海市优秀学术带头人计划资助项目(18XD1403600).
从自然界广泛存在的药用资源中发现活性天然产物,进而作为先导化合物是创新药物研发的重要途径。然而,如何从成分复杂多样的动植物或微生物提取物中高效发现对目标酶具有强效抑制作用的天然产物,一直是酶抑制剂类药物研发领域面临的一...
关键词:药物发现 酶抑制剂 高通量筛选 计算机虚拟筛选 蛋白芯片 
湖北道地药材中潜在抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性成分的计算机虚拟筛选被引量:1
《中国医院药学杂志》2020年第17期1799-1804,共6页王静 梅之南 袁桥玉 宋炜 胡贝 刘新桥 
湖北省新型肺炎应急科技攻关项目(编号:2020FCA042);国家重点研发计划课题(编号:2018YFC1708004)。
目的:运用计算机虚拟筛选技术寻找湖北道地药材中抗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的小分子抑制剂。方法:以药材名为关键词,在知网和PubMed数据库中搜索湖北道地药材的主要化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构,以新型冠状病毒3CL水...
关键词:湖北道地药材 新型冠状病毒 分子对接 活性成分 
基于分子对接的计算机虚拟筛选技术在新药发现中的应用进展被引量:17
《化学工程师》2020年第2期59-63,共5页刘玉甜 赵诗雨 吕邵娃 
黑龙江中医药大学校基金新药临床前研究基金项目(2018xy04).
基因组学和蛋白质组学的迅速发展,促进了计算机虚拟筛选技术在药物开发中的应用。结合文献及前期工作,本文全面的阐述了基于分子对接的计算机虚拟筛选技术在新型药物发现中应用的过程,对近年来有关计算机虚拟筛选技术在医药领城中的应...
关键词:计算机虚拟筛选 新药 分子对接 
娑罗子中抗炎活性成分的计算机虚拟筛选被引量:3
《绿色科技》2020年第2期180-184,共5页宋炜 袁桥玉 王静 胡贝 李竣 刘新桥 
国家重点研发计划项目(编号:2017YFC1701004);湖北省技术创新专项重大项目(编号:2O18ACA126)。
利用计算机辅助药物设计探究了植物娑罗子中抗炎的活性成分。在TCMSP数据库中利用里宾斯基五规则筛选出娑罗子的化学成分,用SYBYL软件对小分子与抗炎作用相关的16个蛋白靶点进行分子对接,通过对接打分函数(Total Score≥7)筛选出活性成...
关键词:娑罗子 计算机辅助药物设计 分子对接 ADMET预测 
以非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X为靶点的海洋药物计算机虚拟筛选被引量:8
《中国海洋药物》2018年第6期1-7,共7页王卓亚 李阳阳 徐锡明 于日磊 魏志强 杨金波 
国家自然科学基金项目(31700755);海洋国家实验室"鳌山人才"卓越科学家专项(2017ASTCP-OS11);江苏省自然科学基金青年项目(BK20170312);海洋化合物三维数据库构建与抗肿瘤蛋白靶标虚拟筛选研究项目(QNLM201709)资助
目的从天然产物中高效快速地筛选出一批有效针对非洲猪瘟病毒的药物苗头化合物,为寻找能抑制猪瘟蔓延的生物饲料提供线索。方法利用计算机辅助药物设计技术,以非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X的DNA结合区为靶点,进行虚拟筛选,在陆生和海洋天然...
关键词:非洲猪瘟病毒 天然产物 海洋化合物 非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X 虚拟筛选 
基于计算机虚拟筛选技术寻找NDM-1抑制剂被引量:5
《国外医药(抗生素分册)》2018年第2期111-115,共5页冯迪 刘湲 孙影 郑珩 
β-内酰胺类抗生素的广泛使用,使得越来越多的细菌产生由β-内酰胺酶介导的耐药性,针对丝氨酸β-内酰胺酶,目前已有克拉维酸、舒巴坦等抑制剂与临床常用抗生素配伍使用,但尚无金属β-内酰胺酶的有效抑制剂,因此,寻找金属β-内酰胺酶尤...
关键词:NDM-1酶 抑制剂 计算机虚拟筛选 
传统中药数据库中HIV-1蛋白酶抑制剂计算机虚拟筛选被引量:4
《辽宁中医药大学学报》2016年第10期73-78,共6页史海龙 赵云飞 陈哲 
国家级大学生创新创业训练计划项目(201410716001)
目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCMSP)中快速搜索HIV-1蛋白酶(Protease,PR)的中药小分子抑制剂。方法:采用Scripps研究所的Auto Dock Vina软件,对蛋白质晶体结构数据库PDB中PR与小分子抑制剂沙奎那韦(Saquinavir)形成的...
关键词:HIV-1蛋白酶抑制剂 虚拟筛选 传统中药 
传统中药中H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂的计算机虚拟筛选被引量:2
《时珍国医国药》2016年第3期762-765,共4页史海龙 李军 魏敏慧 肖磊 李贤杨 陈哲 
陕西省自然科学基础研究计划项目(No.2013JK0779;No.2013JK0772);陕西省教育厅重点实验室科学研究计划项目(No.13JS033);国家级大学生创新创业训练计划项目(No.201310716002)
目的用分子对接方法从传统中药数据库(TCM Database@Taiwan)中筛选H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂。方法流感病毒中神经氨酸酶作为一个已经被证明的抗流感药物靶点,从蛋白晶体结果数据库(Protein Data Bank,PDB)中提取晶体结构文件,对其三维...
关键词:H7N9流感病毒 神经氨酸酶 计算机虚拟筛选 传统中药 
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