分组重量编码

作品数:7被引量:7H指数:1
导出分析报告
相关领域:生物学更多>>
相关作者:张振慧王正华王勇献王秀鹤南重汉更多>>
相关机构:国防科学技术大学湖南大学国防科技大学解放军第3医院更多>>
相关期刊:《计算机工程与应用》《生物物理学报》《生物信息学》《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》更多>>
相关基金:国家自然科学基金重庆市自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
-

检索结果分析

结果分析中...
条 记 录,以下是1-7
视图:
排序:
基于分组重量编码和特征选择技术预测外膜蛋白
《第三军医大学学报》2013年第13期1366-1370,共5页南重汉 邹凌云 
重庆市自然科学基金(2010BB5172);第三军医大学科研创新基金(2010XQN05)~~
目的建立新的机器学习模型,从蛋白质数据集或全基因组蛋白质序列中预测外膜蛋白。方法采用分组重量编码和氨基酸组成计算蛋白质序列特征,采用F-score方法反向选择特征,采用支持向量机算法建立分类模型,在1 087条蛋白质序列构成的数据集...
关键词:外膜蛋白 分组重量编码 特征选择 支持向量机 
基于功能域和分组重量编码为特征参数的蛋白酶预测
《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》2011年第2期116-122,共7页樊玉才 胡秀珍 
内蒙古自然科学基金资助项目(2009MS0111);国家自然科学基金项目(30960090)
基于功能域组分和分组重量编码特征提取预测参数,采用支持向量机的识别算法,在Jackknife检验下,蛋白酶的预测结果为89.9%,蛋白酶的6个类别的总预测结果为94.0%。预测结果表明,该方法是预测蛋白酶及其类别的有效工具。
关键词:蛋白酶 功能域 分组重量编码 支持向量机 
加权K近邻算法在蛋白质功能预测中的应用
《微计算机信息》2010年第36期172-173,共2页贾伟峰 廖波 李希 
基金申请人:廖波;项目名称:蛋白质组信息分析及应用算法研究;基金颁发部门:国家自然科学基金委(60973082);基金申请人:廖波;项目名称:肿瘤蛋白质组学方法研究;基金颁发部门:湖南省科技厅(2009FJ3195)
针对蛋白质序列与所属类别往往是多对多的关系,提出了一种新的基于加权K近邻(KNN)的蛋白质功能预测算法。该算法从蛋白质序列出发,与分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记为EBGW)相结合,并为未知蛋白质序列的近邻赋予一...
关键词:数据挖掘 分组重量编码 K近邻 权重 
基于分组重量编码的蛋白质同源寡聚体分类研究
《国防科技大学学报》2007年第2期91-93,共3页张振慧 王正华 王勇献 
基于一种新的特征提取方法——分组重量编码(Encoding on the basis of Grouped Weight,简记为EBGW),采用组分耦合算法作为分类器,从蛋白质一级序列出发对四类同源寡聚体蛋白进行分类研究。结果表明,在Jackknife检验下,基于分组重量编...
关键词:分组重量编码 同源寡聚体 组分耦合算法 
蛋白质的分组重量编码及在结构型预测的应用被引量:1
《计算机工程与应用》2007年第7期38-40,89,共4页张振慧 王正华 王勇献 
从氨基酸的物化特性出发,利用物理学中“粗粒化”思想,提出了一种蛋白质序列的分组重量编码方法(Encoding Basedon Grouped Weight,简记为EBGW),并结合组分耦联算法进行结构型预测的研究。对标准集T359中359个蛋白质的Resubstitution检...
关键词:蛋白质序列 特征序列 组分耦联算法 结构型 
基于分组重量编码的蛋白质功能预测被引量:1
《生物信息学》2007年第1期25-27,共3页王秀鹤 王正华 王勇献 张振慧 
国家自然科学基金资助项目(NO.60603054)
从蛋白质序列出发,采用分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记EBGW),并结合最近邻居算法对蛋白质功能进行预测。对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的1826条序列进行预测,整体预测准确率与其他基于序列信息的蛋白质...
关键词:分组重量编码 蛋白质功能预测 特征序列 最近邻居算法 
利用分组重量编码预测细胞凋亡蛋白的亚细胞定位被引量:5
《生物物理学报》2006年第4期275-282,共8页张振慧 王正华 王勇献 
从氨基酸的物化特性出发,利用物理学中“粗粒化”和“分组”的思想,提出了一种新的蛋白质序列特征提取方法——分组重量编码方法。采用组分耦合算法作为分类器,从蛋白质一级序列出发对细胞凋亡蛋白的亚细胞定位进行研究。针对Zhou和Doc...
关键词:分组重量编码 凋亡蛋白 组分耦合算法 
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部