CHIP-SEQ

作品数：67被引量：103H指数：5
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p65通过调控脂代谢影响HepG2细胞增殖研究
《实用肝脏病杂志》2025年第2期173-177,共5页李全维 高明慧 寇卜心 柴梦音 霍云飞 豆双双 庞丽君 石英 刘晓霓 
国家自然科学基金资助项目(编号:82003200);北京市属医学科研院所公益发展改革试点项目(编号:京医研2021-10);北京市自然科学基金资助项目(编号:7192084);首都卫生发展科研专项基金资助项目(编号:2020-2-1152)。
目的p65作为NF-κB家族重要的转录因子,在肝细胞癌进展过程中发挥着重要作用。本研究旨在探索p65对HepG2细胞脂代谢调控的影响。方法应用数据库分析p65表达与HCC患者预后的关系。采用ChIP-seq和RNA-seq技术,采用生物信息学分析探究HepG...
关键词：肝细胞癌 P65 CHIP-SEQ RNA-SEQ 细胞增殖 脂代谢 体外 
HiTIP-seq profiles epigenomic reprogramming of patient-derived diffuse midline glioma stem cells to epigenetic therapy
《hLife》2024年第9期471-487,共17页Zhongyao Chen Qiang Gao Yukui Shang Behzad Nasiri Ahmadabadi Yawei Hu Wei Zhang Peng Liu 
supported by grants from the National Science Foundation of China(No.22127804);the National Natural Science Foundation of China(No.81771931 and 31971325);Institute of Biomedicine,the Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences,and the Clinical Medicine Development Fund of Tsinghua University(No.10001020510);the National Key Research and Development Program of China(No.2016YFC0900200).
Diffuse midline glioma(DMG),H3K27-altered,is lethal pediatric-type,high-grade,localized to the midline region of the central nervous system.Effective treatment guidelines are absent,and clinical trials are preferred f...
关键词：diffuse midline glioma high-throughput chromatin immunoprecipitation sequencing(ChIP-seq) epigenetic therapy histone modification 
叶酸缺乏影响胚胎干细胞H3K9巴豆酰化和神经发育相关基因表达被引量：1
《陆军军医大学学报》2024年第14期1666-1675,共10页陈晨 何学佳 王珊 
国家自然科学基金面上项目(82071690);首都儿科研究所所级基金(FX-2020-05,CXYJ-2-21-09)。
目的采用染色质免疫共沉淀测序技术(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-seq)分析叶酸正常小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESCs)与叶酸缺乏mESCs组蛋白H3K9巴豆酰化(H3K9cr)修饰的全基因图谱,以期探究叶酸缺...
关键词：叶酸缺乏 组蛋白巴豆酰化 CHIP-SEQ 神经发育 
基因组转录调控元件内单核苷酸多态性调控基因表达介导扩张型心肌病
《中国分子心脏病学杂志》2024年第2期5986-5995,共10页王珍婷 曹唱唱 
中国医学科学院医学与健康科技创新工程(重大协同创新项目,项目编号:2021-1-I2M-019)。
目的探究人类基因组转录调控元件区域单核苷酸多态性与扩张型心肌病发病之间的关联及潜在的致病机制。方法利用心脏组织表达数量性状基因座(expression quantitative trait locus,eQTL)数据与50例扩张型心肌病患者的H3K27ac组蛋白修饰的...
关键词：扩张型心肌病 CHIP-SEQ EQTL 启动子 增强子 
玉米热激转录因子ZmHsf06的耐热功能及其调控通路研究被引量：1
《农业生物技术学报》2024年第3期505-517,共13页李冉 马贞玉 张世昌 李国良 孟祥照 段硕楠 刘子会 吕爱枝 郭秀林 张华宁 
河北省自然科学基金(C2021301038);河北省农林科学院基本科研业务费(2021110301)。
玉米(Zea mays)不同生育期遭遇高温热浪渐成常态,严重影响产量和品质。热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)能够激活下游多种耐热途径,调控耐热相关基因表达从而提高植株耐热性。本研究在前期对玉米HsfA1亚族基因ZmHsf0...
关键词：玉米 热激转录因子 耐热性 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq) 
The virulence regulator AbsR in avian pathogenic Escherichia coli has pleiotropic effects on bacterial physiology
《Journal of Integrative Agriculture》2024年第2期649-668,共20页Dongfang Zhao Haobo Zhang Xinyang Zhang Fengwei Jiang Yijing Li Wentong Cai Ganwu Li 
supported by the National Natural Science Foundation of China Young Scholars Project(31902242);the Agricultural Science and Technology Innovation Program(ASTIP)of Chinese Academy of Agricultural Sciences(2017–2020)。
Avian pathogenic Escherichia coli(APEC)belonging to extraintestinal pathogenic E.coli(ExPEC)can cause severe infections in extraintestinal tissues in birds and humans,such as the lungs and blood.MprA(microcin producti...
关键词：avian pathogenic Escherichia coli(APEC) extraintestinal pathogenic Escherichia coli(ExPEC) AbsR RNA-SEQ CHIP-SEQ gene regulation 
Protein Lactylation and Metabolic Regulation of the Zoonotic Parasite Toxoplasma gondii被引量：2
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2023年第6期1163-1181,共19页Deqi Yin Ning Jiang Chang Cheng Xiaoyu Sang Ying Feng Ran Chen Qijun Chen 
supported by grants from the National Key R&D Program of China(Grant Nos.2017YFD0500400 and 2017YFD0501200);the National Natural Science Foundation of China(Grant Nos.31972702 and 81772219);the CAMS Innovation Fund for Medical Sciences(CIFMS)(Grant No.2019-I2M-5-042).
The biology of Toxoplasma gondii,the causative pathogen of one of the most widespread parasitic diseases(toxoplasmosis),remains poorly understood.Lactate,which is derived from glucose metabolism,is not only an energy ...
关键词：Toxoplasmagondit Lactylation Proteinpost-translational modification METABOLISM CHIP-SEQ 
The CCT transcriptional activator Ghd2 constantly delays the heading date by upregulating CO3 in rice被引量：1
《Journal of Genetics and Genomics》2023年第10期755-764,共10页Xiaowei Fan Pengfei Wang Feixiang Qi Yong Hu Shuangle Li Jia Zhang Liwen Liang Zhanyi Zhang Juhong Liu Lizhong Xiong Yongzhong Xing 
supported by the Natural Science Foundation of China(U20A2031);the Earmarked Fund for China Agricultural Research System(CARS-01).
CONSTANS,CO-like,and TOC1(CCT)family genes play important roles in regulating heading date,which exerts a large impact on the regional and seasonal adaptation of rice.Previous studies have shown that Grain number,plan...
关键词：Heading date CCT family gene CHIP-SEQ Constant repressor Rice(Oryza sativa L.) 
基于ChIP-seq技术分析心肌成纤维细胞中KDM5A调控的下游靶基因网络
《中华全科医学》2023年第9期1474-1477,共4页魏婷 亓先杰 张旭 王亚涛 姜亦瑶 施超 
国家自然科学基金青年基金项目(81800214);蚌埠医学院2021年度研究生科研创新项目(Byycx21077)。
目的 探讨KDM5A调控心肌成纤维细胞生物学功能的潜在机制。方法 获取2019年1月—2020年3月于蚌埠医学院第一附属医院心脏外科就诊的扩张型心肌病患者的心室肌组织。分离培养心肌纤维化患者的心肌成纤维细胞,采用染色质免疫共沉降测序(Ch...
关键词：KDM5A 心肌成纤维细胞 染色质免疫共沉降测序 生物信息学分析 
人NPTX1相关H3K27ac富集的非保守性增强子鉴定
《复旦学报（医学版）》2023年第4期487-493,501,共8页陈旭东 张琦 张颖蓝 林佳 王凤 桂怡婷 刘婷 李强 
国家自然科学基金(81771632,81271509);上海市自然科学基金(21ZR1410100)。
目的探索和鉴定人NPTX1相关H3K27ac富集的非保守性的增强子,完善NPTX1相关调控区的注释,为NPTX1相关疾病及非编码区突变的研究提供相应的理论基础。方法从CistromeDB数据库下载和分析涉及7种组织的39个H3K27ac ChIP-seq数据,选择NPTX1两...
关键词：NPTX1 增强子 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq) H3K27ac 
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