病毒基因组

作品数：564被引量：1871H指数：16
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基于贪心策略的多毒株病毒全长参考基因组组装算法
《青岛大学学报(自然科学版)》2025年第1期24-29,共6页高梓煜 赵瑾 
国家自然科学基金(批准号:62202251)资助;山东省自然科学基金(批准号:ZR2022QF133)资助。
病毒基因组具有高度遗传异质性,传统组装方法的拼装结果存在片段化问题。为此,提出了一种基于贪心策略的方法(RK-Virus),通过k-mer提取、选取种子、序列扩展等步骤构建全长参考基因组。实验结果表明,RK-Virus拼装出的Contig数量始终为1...
关键词：参考基因组组装 病毒基因组 计算生物学 
我国东北地区发现对人类感染的新型蜱传病毒
《中华实验和临床病毒学杂志》2025年第1期101-101,共1页梁国栋(翻译) 
2025年1月9日(新英格兰医学杂志)刊登我国科学家利用分子生物学检测方法在我国东北地区的哨点医院发热患者血清标本检测到一种新型蜱虫传播病毒。文章报道2023年5—7月间在我国东北地区采集到252例发热患者血清标本,对采集到的标本开展...
关键词：病毒分离 病毒形态 细胞病变 病毒基因组 未知病毒 发热患者 遗传进化分析 转录组测序 
新型蜱传病毒感染患者的发现:主动监测和病毒基因组分析
《中华实验和临床病毒学杂志》2025年第1期40-40,共1页梁国栋(翻译) 
2024年11月柳叶刀-传染病杂志(Lancet Infect Dis)报道我国科学家在黑龙江省牡丹江林业中心医院开展疾病的主动监测并利用病毒基因序列分析方法在当地发现一系列叶佐病毒(Yezo virus,YEZV)感染患者的临床表现和实验室检测结果等。鉴于...
关键词：病毒基因组 病毒感染 主动监测 柳叶刀 中心医院 专家评论 牡丹江 
一种基于T7核酸内切酶I纠错的病毒基因组高效组装方法
《生物工程学报》2025年第1期385-396,共12页张绪伟 文斌 王飞 王学军 刘丽艳 王淑美 王升启 
国家重点研发计划(2018YFA0902300)。
基因合成技术是支撑合成生物学发展的使能技术。现有的基因从头合成技术存在操作步骤多、效率低、错误率高且长度有限等问题,难以支撑合成生物学日益拓展的庞大需求。其中DNA片段的组装和纠错是基因合成的关键环节。本研究首先通过平衡...
关键词：基因组装 从头合成 纠错 T7核酸内切酶I 
猪流行性腹泻病毒基因组和诊断方法研究进展
《河南农业科学》2024年第10期12-20,共9页张玉杨 
河南省工程中心项目(豫科2015-175-151)。
猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED),是一种急性、高度接触性、高发病率和高致死率的猪肠道传染病,给全球养猪业造成了巨大的经济损失。深入了解PEDV的基因组...
关键词：猪流行性腹泻病毒 猪流行性腹泻 基因组 诊断 
环球30日
《环球财经》2024年第9期124-125,共2页
全球首份土壤病毒图谱绘成一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟,成功绘制出了首份全球土壤病毒(GSV)图谱。图谱综合了来自全球2953种土壤的基因组信息,其中包括以前无法获得的1552个样本,以及616935...
关键词：病毒基因组 生物地球化学过程 基因组信息 国际联盟 图谱 实验室 微生物 
江苏省23例猴痘病例病毒基因组特征分析
《新发传染病电子杂志》2024年第4期12-17,共6页赵康辰 朱小娟 乔乔 陈银 吴涛 崔舟 崔仑标 葛以跃 
江苏省自然科学基金(BK20231374,BK20221413);国家重点研发计划(2023YFC2605100,2023YFC2605104)。
目的分析2023年6月至9月江苏省23例猴痘病例病毒全基因组序列并研究其分子进化特征。方法收集猴痘病例口咽拭子、痘疱液、痘疱渗出物拭子等样本,以实时定量PCR进行病毒核酸检测,利用扩增子测序技术捕获猴痘样本中病毒全基因组,通过Mini...
关键词：猴痘病毒 高通量测序 基因组特征 单核苷酸多态性 
四川省首例猴痘病例病毒基因组特征分析
《疾病监测》2024年第8期989-994,共6页曹冉冉 刘晨霞 罗灿 徐朝花 刘李 潘明 
四川省科技厅重点研发项目(No.2022YFS0637,No.2023YFS0501,No.2023YFS0502)。
目的 分析四川省首例猴痘病例感染病毒全基因组特征,为猴痘防控工作提供基础资料。方法 采集病例咽拭子和疱疹液拭子提取核酸,用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行初筛,确认阳性后用纳米孔测序进行全基因组测序。测序数据用Minimap2 v2.1...
关键词：猴痘 猴痘病毒 全基因组测序 纳米孔测序 
云南大花蕙兰复合感染的ORSV和CyCMV病毒基因组序列特征分析被引量：1
《园艺学报》2024年第8期1844-1852,共9页金晓香 姚俊汐 尹跃艳 李婷婷 郭淼 钟静 和寿星 陈越 和家卫 鄢波 丁铭 
国家自然科学基金地区基金项目(32360644);云南省种子种业联合实验室项目(202205AR070001-02);云南省乡村振兴科技专项(200202A);云南省重大科技专项计划项目(202302AE090005);云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所开放项目(2023005)。
从云南丽江采集了40个大花蕙兰(Cymbidium hybridum)感病样品,利用高通量转录组测序对其中的病毒种类进行分析,Blastn N比对发现样品中存在建兰花叶病毒(cymbidium mosaic virus,Cym MV)、齿兰环斑病毒(odontoglossum ringspot virus,OR...
关键词：大花蕙兰 齿兰环斑病毒 建兰褪绿花叶病毒 基因组序列特征 复合侵染 
瘟病毒反向遗传技术的研究进展及应用
《中南农业科技》2024年第7期230-234,共5页韩鹏 张亮 王伟 王明成 郭亚男 
宁夏回族自治区重点研发项目(2022BBF03024)。
瘟病毒属于黄病毒科(Flaviviridae),核酸为单股正链RNA,基因组长12.3 kb。反向遗传技术是研究病毒蛋白功能的有力工具,已经成为研究瘟病毒属的有效途径。介绍了瘟病毒的基本特征,概述了瘟病毒反向遗传操作技术的建立和发展过程,综述了...
关键词：瘟病毒 反向遗传技术 牛病毒腹泻病毒(BVDV) 猪瘟病毒(CSFV) 病毒基因组 
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