叶绿体基因组

作品数:739被引量:1433H指数:32
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点地梅属10种植物叶绿体基因组密码子偏好性分析
《中草药》2025年第4期1355-1365,共11页郭玉朋 史明伟 马虎 马彦军 姚步青 
青海民族大学研究生专业示范思政课程建设项目(SK-2022-09)。
目的研究点地梅属Androsace L.物种叶绿体基因组蛋白编码基因密码子的偏好性及其影响因素。方法测序了点地梅属1个物种(西藏点地梅)的叶绿体基因组,其他9物种的序列从NCBI下载。根据序列筛选条件,共得到41条共有序列。用CodonW 1.4.2计...
关键词:点地梅属 密码子偏性 最优密码子 突变压 自然选择 
广丰千金薯叶绿体基因组序列特征及密码子使用偏好性分析
《中草药》2024年第21期7444-7461,共18页尹明华 范馨月 付悦欣 胡慧玲 
国家自然科学基金资助项目(31960079);江西省科技厅重点研发计划一般项目(20202BBG73010);江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ201704);江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-13-赣东站);上饶市科技局平台载体建设项目(2020J001)。
目的 解析广丰千金薯Dioscorea opposite叶绿体基因组信息序列特征和确定其在薯蓣属的系统位置。方法 利用高通量测序技术对广丰千金薯叶片进行核基因组重测序,并利用生物信息学相关工具对组装得到的叶绿体基因组进行注释、序列特征和...
关键词:广丰千金薯 叶绿体基因组 序列特征 系统发育分析 野脚板薯 
富民枳叶绿体基因组密码子偏好性分析
《中草药》2024年第20期7093-7100,共8页徐荣 宋文政 乔振升 张晓琳 于国栋 何承忠 纵丹 
昆明市第七批博士后工作扶持站(992223004)
目的 分析药用植物富民枳Poncirus polyandra叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素。方法 以富民枳叶绿体基因组53个蛋白编码基因为材料,利用CodonW软件、CUSP在线程序和R语言等整理并分析基因密码子使用偏性参数和核苷酸...
关键词:富民枳 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 有效密码子数 
苹婆叶绿体全基因组序列特征及苹婆属系统发育分析
《中草药》2024年第19期6721-6729,共9页梁莹莹 吴文如 彭晓祺 张雨薇 陆亚茹 邹何元 
中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302);广州中医药大学大学生创新创业训练计划项目(202310572342);2020年度广东省科技特派员项目(KTP20200137)
目的 分析苹婆Sterculia monosperma的叶绿体基因组结构信息,以及苹婆属的种间亲缘关系,为苹婆属的系统发育和物种鉴定研究提供参考。方法 基于DNBSEQ测序平台,对苹婆叶绿体基因组进行测序,利用生物信息学手段进行组装、注释和结构分析...
关键词:苹婆 假苹婆 苹婆属 叶绿体基因组 系统发育 
角蒿属药用植物叶绿体基因组比较及系统发育分析
《中草药》2024年第17期5972-5981,共10页马海霞 张亚颖 张玉婉 益西卓玛 梁焯森 李欣冉 郭云涛 封烁 
青海省“帅才科学家”负责制项目(2024-SF-102);青海大学农牧学院大学生科研训练项目(NKX202304)。
目的研究角蒿属Incarvillea Juss.药用植物叶绿体基因组特征、变异程度及系统发育关系,为角蒿属物种分子鉴定、系统发育及药用植物资源保护等研究提供参考。方法以5种角蒿属药用植物为研究对象,通过高通量测序获取密生波罗花叶绿体基因...
关键词:角蒿属 密生波罗花 两头毛 黄波罗花 藏波罗花 角蒿 叶绿体基因组 变异 进化 系统发育 
基于文献计量学的中药DNA条形码研究态势分析
《中草药》2024年第15期5201-5211,共11页刘晓轩 陈思雅 蔡煜涵 胡玉婷 柯怡岚 张喜利 刘文龙 
国家自然科学基金项目(82174069);湖南省重点领域研发计划(2023SK2046);湖南省自然科学基金项目(2023JJ60474);湖南省卫生健康高层次人才重大科研专项(R2023139);长沙市自然科学基金项目(kq2208191);湖南创新型省份建设专项(2023NK4110);湖南省科技创新计划项目(2023NK4144);湖南省研究生创新项目(CX20230829);校级创新项目(2023CX145,2023CX105,202210541071,S202210541077)。
目的基于文献计量学对国内外中药DNA条形码的相关研究进行分析,进而了解此领域研究现状,揭示研究热点和趋势以及提供参考和指导。方法收集整理Web of Science核心合集数据库和中国知网(CNKI)数据库中2000年至2023年12月31日中药DNA条形...
关键词:DNA条形码 中药 文献计量学 叶绿体基因组 物种鉴定 质量控制 
牛茄子叶绿体全基因组特征及系统发育分析被引量:2
《中草药》2024年第12期4150-4158,共9页龚秋怡 董姝洁 许琴 葛宇清 
国家自然科学基金面上项目(82074071);浙江中医药大学校级科研项目(2021JKGJYY004)。
目的以牛茄子Solanum capsicoides新鲜叶片为材料,对叶绿体基因组序列进行组装、注释和分析,探究牛茄子的序列特征和同属其他物种的系统发育关系。方法基于Illumina HiSeq高通量测序,获得牛茄子完整叶绿体基因组序列,利用生物信息学方...
关键词:牛茄子 茄属 叶绿体基因组 序列特征 密码子偏好性 系统发育分析 
百合属药用植物叶绿体基因组密码子偏好性及系统发育研究
《中草药》2024年第11期3835-3844,共10页代国娜 尚明越 王嘉乐 郑加梅 廖彬彬 刘颖琳 段宝忠 
云南省生物医药重大专项(202002AA100007);云南省兴滇英才支持计划(YNWR-QNBJ-2020251)。
目的探究百合属Lilium药用植物叶绿体基因组密码子使用偏性及影响因素,为百合属药用植物育种提供理论参考。方法使用CodonW1.4.2、CUSP、SPSS等软件分析9种百合属药用植物的密码子偏好性。结果9种百合属植物密码子不同位点的GC含量均小...
关键词:百合属 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 自然选择 
忍冬属囊管组植物叶绿体基因组进化分析被引量:2
《中草药》2024年第9期3085-3097,共13页张晶晶 袁庆 魏瑶 刘欢 郑雪梅 王英芳 刘海瑞 
青海省自然科学基金资助项目(2024-ZJ-723);西宁植物多样性资源调查与种质资源圃建设(2023-Z-13);生态环境工程学院研究生三江源一流学科建设科技创新项目(2023-stxy-Y21)。
目的揭示忍冬属囊管组16种植物叶绿体基因组特征及系统发育关系。方法以16种囊管组植物为研究材料,利用CodonW、EMBOSS、Excel等软件分析其叶绿体基因组密码子使用偏好性;利用IRscope、mVISTA、DNAsp进行叶绿体基因组比较分析;利用Phylo...
关键词:忍冬属 囊管组 叶绿体基因组 密码子偏好性 系统进化 
蒙古黄芪叶绿体全基因组特征解析及亲缘性分析被引量:2
《中草药》2024年第7期2366-2374,共9页李俊霖 郭淑红 张强 张丽君 田洪岭 张琼 
国家重点研发专项(2019YFC1710800);国家中药材产业技术体系浑源综合试验站(CARS-21-03);山西农业大学校育种工程(YZGC056);山西省现代农业产业技术体系建设专项资金资助(2021-11)。
目的以蒙古黄芪Astragalus membranaceus var.mongholicus为材料,解析其叶绿体基因组的序列特征,并进行系统发育分析。方法利用Illumina NovaSeq测序平台对蒙古黄芪叶绿体全基因组进行测序,完成其组装、注释、特征分析,构建系统发育树...
关键词:蒙古黄芪 叶绿体基因组 序列比对 IRLC 系统发育 
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