测序分型

作品数：119被引量：380H指数：10
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应用Q-PCR定性检测KIR基因有无方法的建立
《中国输血杂志》2024年第6期660-665,共6页李宇楠 甄建新 梁爽 喻琼 邓志辉 
国家自然科学基金青年科学基金项目(82203291);广东省基础与应用基础研究基金委员会项目(2022A1515011045);深圳市科技创新委员会基础研究项目(JCYJ20190806152001762);深圳市医学重点学科(SZXK070)。
目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性...
关键词：杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR) KIR基因有无 实时荧光定量-PCR 序列特异性引物-PCR 测序分型 
基于测序分型方法开发日本沼虾微卫星分子标记
《渔业研究》2023年第6期537-543,共7页刘凯 谢楠 王宇希 刘新轶 
杭州市农科院创新基金项目(2022HNCT-01)。
利用无参考基因组SSR开发方法筛选微卫星序列并结合测序分型方法对分离的微卫星序列进行基因分型。利用两个样本的全基因组测序数据,通过ebwt2InDel软件从这两个样本的测序数据中寻找包含InDel标记的序列。基于包含InDel标记的序列,利用...
关键词：日本沼虾 微卫星 测序分型 多态性 
胎儿弯曲菌龟亚种中国分离株的种群结构、毒力基因及耐药性分析
《中华微生物学和免疫学杂志》2023年第8期582-588,共7页陈富 陈燕 陈晓慰 李启伟 许振杰 陈茶 李顺光 屈平华 李松 
广东省基础与应用基础科学基金(2021A1515110857)。
目的:了解胎儿弯曲菌龟亚种( Campylobacter fetus subsp. testudinum, Cft)的分子流行病学特征。 方法:对本实验室2010—2022年收集的15株胎儿弯曲菌龟亚种进行全基因组测序,结合GenBank公布的全球 Cft基因组数据进行流行病学分析;MLST...
关键词：基因组测序分型 分子流行病学 毒力基因 
Flow-rSSO及PCR-SBT方法检测KIR基因有无的对比研究被引量：1
《中国输血杂志》2023年第7期563-566,共4页钟福玲 杨智超 陈浩 邓志辉 
广东省基础与应用基础研究基金委员会项目(2022A1515011045);深圳市科技创新委员会基础研究项目(JCYJ20190806152001762);深圳市医学重点学科(SZXK070)。
目的研究流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交及测序分型(PCR-SBT)方法鉴定KIR基因有无的一致性。方法对131例汉族人群的DNA标本采用Flow-rSSO方法鉴定全部16种KIR基因的有无,并采用本实验室建立的PCR-SBT方法对14种功能性KI...
关键词：KIR基因 测序分型 流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针 序列特异性引物-PCR 
中国北方汉族人群HLA-DQA1、-DQB1和HLA-DPA1、-DPB1等位基因多态性分析被引量：1
《北京医学》2023年第6期544-547,共4页王丽君 王东梅 刘娜 张丹 敬媛媛 贾延军 
目的 调查中国北方汉族人群HLA-DQA1、-DQB1、 HLA-DPA1、-DPB1等位基因多态性。方法 选取2016年中华骨髓库造血干细胞志愿者1 004人的外周血样,采用第2代测序方法(next generation sequence,NGS)进行HLA-DQA1、-DQB1、HLA-DPA1、-DPB1...
关键词：人类白细胞抗原 第2代测序分型 多态性 等位基因 
贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因遗传特征分析
《中国基层医药》2023年第5期692-698,共7页郑勤妮 任丽娟 庄丽 付成忠 万永虎 
贵州省科技计划基金(黔科合基础[2020]1Y360);贵州省卫生和计划生育委员会科研基金(gzwjkj2017-1-052)。
目的分析贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因特征,了解变异规律。方法由贵州省10家网络实验室分离的H3N2亚型流感毒株中随机选取20株提取RNA,进行逆转录酶聚合酶链反应和测序,采用生物信息软件分析。结果20株毒株HA基因核苷酸同...
关键词：流感病毒A型 H3N2亚型 RNA 病毒 逆转录聚合酶链反应 多位点测序分型 序列同源性 核酸 遗传 序列标记位点 血凝素类 病毒 
HLA新等位基因B*46:30序列分析及其编码MHC蛋白分子结构预测与表型鉴定
《中国免疫学杂志》2023年第1期152-156,161,共6页聂向民 朱传福 朱海峰 张毅 乔文本 刘艳 邵静茹 
山东省自然科学基金项目(ZR2014HM095);山东省医药卫生科技发展计划项目(2014WS0389);山东省血液中心科研项目(2020KY02)。
目的:鉴定分析HLA新等位基因B*46:30序列,对其MHC蛋白分子三级结构及氨基酸残基改变对蛋白结构的可能影响进行模拟分析,并对其血清学表型进行鉴定。方法:应用Luminex SSOP流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对HLA序列进行序列鉴定。应...
关键词：人类白细胞抗原 测序分型 新等位基因 结构预测 
B族链球菌规律成簇间隔短回文重复序列与基因分型及耐药基因的关系
《中华围产医学杂志》2022年第12期898-903,共6页白宇茜 康文娟 张新华 郭超 徐丽君 孟晋华 张莉 
山西省基础研究计划(20210302123360)。
目的:探讨孕晚期孕妇生殖道定植及侵袭性感染患儿的B族链球菌(group B Streptococcus,GBS)规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)分布及其与多位点序列分型(multilocus sequen...
关键词：B族链球菌 CRISPR相关蛋白质类 抗药性 细菌 规律成簇间隔短回文重复序列 多位点测序分型 链球菌感染 传染性疾病传播 垂直 妊娠并发症 感染性 
新发CHD7基因突变致CHARGE综合征的诊断分析被引量：2
《临床小儿外科杂志》2022年第9期850-854,共5页吴逊 宋洁 唐幂 
湖南省自然科学基金(2022JJ30840,2020JJ5831)。
目的分析3例新发CHD7(OMIM#214800)基因突变致CHARGE综合征(PMID:10590394)患儿的临床特点和遗传学特征,探讨靶向测序在CHARGE综合征研究中的应用。方法以中南大学湘雅二医院心血管外科收治的3例综合征型先天性心脏病(简称先心病)患儿...
关键词：心脏病/先天性 多位点测序分型 CHARGE综合征/诊断 突变/遗传学 
糖原累积病Ⅱ型一例临床特点及基因分析
《中国基层医药》2022年第9期1355-1358,共4页张湘云 王亚洲 张笃飞 
目的探讨糖原累积病Ⅱ型(GSDⅡ)的诊治要点。方法对海南省儿童医院2017年5月7日收治的GSDⅡ患儿1例的临床资料进行回顾性分析。结果患儿以肺炎起病,伴有肌无力,肌酶升高,临床表现不典型。全基因测序检测提示该例患儿的酸性α-葡萄糖苷酶...
关键词：糖原贮积病Ⅱ型 病人病情 基因检测 多位点测序分型 突变 遗传 误诊 诊断 鉴别 儿童 
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