串联重复序列

作品数：282被引量：709H指数：11
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相关机构：天昊生物医药科技(苏州)有限公司中国疾病预防控制中心传染病预防控制所四川农业大学中国海洋大学更多>>
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蜱螨线粒体基因组串联重复序列DNA的分布与进化特征分析
《应用昆虫学报》2024年第3期569-581,共13页祝银 李一 蒋诗蝶 王进军 魏丹丹 
国家自然科学基金(32272525,31972276);“十四五”柑橘产业体系-树体虫害防控。
【目的】本研究旨在明确蜱螨线粒体基因组(mtDNA)串联重复序列(微卫星和长串联重复DNA)的分布规律和进化特征,为开发蜱螨分子标记和研究线粒体微卫星的功能提供基础数据。【方法】采用Microsatellite identification tool(MISA)和Tandem...
关键词：真螨目 寄螨目 微卫星 基因组进化 线粒体复合体 
串联重复序列在琴叶拟南芥基因组中的特征探究
《基因组学与应用生物学》2021年第3期1289-1299,共11页赵志新 王葳蕤 李春鑫 
陕西省教育厅2018年度专项科学研究计划项目(18JK0251);河南省自然科学基金项目(182300410041)共同资助。
串联重复序列广泛存在于真核生物的基因组中,它通过影响染色质的空间结构及基因表达从而影响生物的遗传与进化。本研究以琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)基因组为材料,分析了1~50 bp重复单元的串联重复序列特征。研究发现串联重复序列...
关键词：琴叶拟南芥 基因组 串联重复序列 特征 
低能离子注入介导的异常汉逊酵母菌基因组重复序列的突变研究
《新疆大学学报（自然科学版）》2018年第4期479-486,共8页张寒玉 王婷 唐朝 冯光文 钱卫东 蔡长龙 毛培宏 
国家自然科学基金(11575149,31760016);陕西科技大学博士科研项目(126021759)资助
重复序列是真核生物基因组的重要组成部分,对生物的系统发育与进化、基因表达与调控有重要作用.为了进一步认识低能离子注入对酵母菌基因组结构的辐射效应,在全基因组de novo测序的基础上,本研究利用生物信息学方法,对低能离子注入前后...
关键词：离子注入 异常汉逊酵母菌 基因组 串联重复序列 散在重复序列 
串联重复序列在玉米基因组中的特征及分布被引量：1
《分子植物育种》2018年第18期5876-5883,共8页赵志新 高利敏 
商洛市科技局计划项目(SK-2014-01-19);商洛学院科研基金项目(14SKY028)共同资助
串联重复序列(tandem repeats, TRs)在玉米基因组中广泛存在,对维持染色体结构和调节基因表达起到重要作用。从Phytozome (http://www.phytozome.net/)下载玉米全基因组序列和基因注解(Gene annotation)数据,然后使用串联重复序列分析工...
关键词：串联重复序列 玉米 密度 分布 
串联重复序列在克莱门柚基因组中的特征研究被引量：1
《西南农业学报》2018年第8期1571-1577,共7页赵志新 张蒙 
商洛学院科研基金项目(14SKY028)
【目的】串联重复序列存在于大多数真核生物基因组中,对于生物基因表达调控具有重要意义。本研究从基因组角度探究串联重复序列在克莱门柚基因不同区域的模体特征,为重复序列在基因调控中的作用提供提供参考。【方法】从Phytozome数据...
关键词：克莱门柚 串联重复序列 密度 基因组 
串联重复序列在高粱基因组中的特征及分布被引量：3
《河南农业科学》2018年第7期33-42,共10页赵志新 李春鑫 李雨娇 
商洛学院科研基金项目(14SKY028)
以高粱全基因组及基因中不同结构区域为研究对象,从Phytozome数据库中下载高粱基因组数据及基因注解数据,利用重复序列分析工具(Phobos v3.3.12),检测串联重复序列在不同区域的密度变化、模体类型及其在基因内与基因间的位置分布情况。...
关键词：高粱 基因组 串联重复序列 密度 分布 
大黑毛肩长蝽(半翅目：异翅亚目：地长蝽科)线粒体基因组及地长蝽科系统发育地位探讨被引量：3
《环境昆虫学报》2017年第2期314-331,共18页郭鹏磊 吴燕卓 王艳会 吴昊阳 李腾 李俊兰 卜文俊 谢强 
国家自然科学基金(31572242)
为了更加深入地了解地长蝽科的基因组水平特征,测序并分析了大黑毛肩长蝽Neolethaeus assamensis(半翅目:异翅亚目:地长蝽科:毛肩族)的线粒体基因组序列。大黑毛肩长蝽线粒体基因组是双链共价环状DNA分子,长度为17097 bp,编码13个蛋白...
关键词：线粒体基因组 大黑毛肩长蝽 串联重复序列 重组 系统发育 
大蹼铃蟾的线粒体基因组D-loop区序列分析
《巢湖学院学报》2013年第6期71-75,共5页张雁 韩毛振 罗学才 王晶晶 
安徽省高校省级自然科学基金项目(项目编号:KJ2011Z314);合肥师范学院自然科学研究项目(项目编号:2011KJ11)
脊椎动物的线粒体DNA(mtDNA)是一段长度约为15-22Kb的环形片段,具有相对的保守性。D-loop区是线粒体基因组中的非编码区域的一部分,具有控制和调节的功能。本文采用LA-PCR和生物信息学的方法,研究了大蹼铃蟾的线粒体基因组D-loop区序列,...
关键词：大蹼铃蟾 线粒体基因组 D—loop 串联重复序列 
牦牛基因组串联重复序列(AC)n/(GT)n的分离被引量：1
《中国兽医学报》2012年第9期1289-1294,共6页蔡欣 泽让东科 张修月 贾小东 岳碧松 
中国博士后科学基金资助项目(20090461336);中国博士后科学基金特别资助项目(201003703)
采用Dynal磁珠-生物素标记的(AC)12探针和牦牛基因组MboⅠ酶切片段杂交,富集牦牛基因组(AC)n/(GT)n串联重复序列并构建基因文库,阳性克隆率达到61.1%。通过对176个阳性克隆的测序获得含有(AC)n/(GT)n重复的序列92条,其中连续型重复序列4...
关键词：牦牛 简单串联重复 磁珠分离 
大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析被引量：16
《昆虫学报》2011年第5期555-565,共11页夏靖 胡静 朱国萍 朱朝东 郝家胜 
安徽省高校省级自然科学研究重点项目(KJ2010A142);安徽省优秀青年科技基金(08040106811);安徽省"重要生物资源保护与利用"重点实验室及中青年学术与技术带头人专项基金(590620);北京市自然科学基金重点项目(6081002)
目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列,同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示：其基因组全长为15 267 bp（G...
关键词：鳞翅目 大卫绢蛱蝶 线粒体基因组 tRNA二级结构 串联重复序列 
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