陈沛全

作品数：14被引量：28H指数：4
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供职机构：南开大学更多>>
发文主题：杯[4]吡咯氢键构象密度泛函理论研究分子动力学更多>>
发文领域：理学化学工程农业科学更多>>
发文期刊：《高等学校化学学报》《化学学报》更多>>
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KARI酶抑制剂的虚拟筛选、合成及生物活性研究
《中国科技论文在线》2009年第9期638-643,共6页王宝雷 陈沛全 刘幸海 李永红 李正名 
高等学校博士学科点专项科研基金(20070055044);天津市应用基础及前沿技术研究计划(008JCYBJC00800);国家重点基础研究发展计划项目(2003CB114406)
在菠菜KARI酶复合物0.165 nm高分辨率晶体结构基础上,利用分子对接方法对ZINC/drug-like小分子三维数据库进行虚拟筛选,得到了1 000个与KARI酶结合能较低的小分子结构信息,并从中选取部分小分子化合物进行合成或购买,进而测试其除草生...
关键词：酮醇酸还原异构酶 虚拟筛选 生物活性 
β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯与阴离子相互作用的密度泛函理论研究被引量：2
《化学学报》2008年第1期31-38,共8页王腾 李琼 陈沛全 孙宏伟 陈兰 沈荣欣 赖城明 
国家高技术研究发展专项经费(No.2006AA10A213);南开大学"南开之星"高性能计算资助项目
采用密度泛函B3LYP方法对β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯主体分子及其与阴离子(F-,Cl-,CH3COO-,H2PO4-)形成的复合物进行研究.结果表明,β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯可与阴离子以分子间氢键相互作用形成复合物,并且其与阴离子结合能力大小...
关键词：吡咯 阴离子识别 主-客体相互作用 氢键 
酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用的分子模拟研究被引量：1
《化学学报》2007年第16期1693-1701,共9页陈沛全 刘幸海 孙宏伟 王宝雷 李正名 赖城明 
国家973计划(No.2003CB114406);国家自然科学基金重点项目(No.20432010);天津市科委高性能计算(No.043185111-5)资助项目.
采用MCCE,Autodock及密度泛函方法对酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用进行了研究.计算结果表明,KARI活性位点中的Mg2+在活性位点残基的离子化状态、活性位点的静电性质以及与抑制剂结合等方面起重要的作用;同时,抑制剂在结...
关键词：酮醇酸还原异构酶(KARI) 抑制剂 Possion-Boltzmann方程 分子对接 密度泛函理论 
酵母AHAS酶与磺酰脲类抑制剂作用模型的分子对接研究被引量：4
《高等学校化学学报》2007年第8期1552-1555,共4页李琼 陈沛全 陈兰 孙宏伟 沈荣欣 赖城明 李正名 
国家'八六三'计划(批准号:2006AA10A213);南开大学'南开之星'高性能计算项目资助
基于酵母乙酰羟酸合成酶(AHAS)与磺酰脲类抑制剂复合物的晶体结构,用分子对接方法对AHAS与5个磺酰脲类抑制剂相互作用的方式进行了系统的分子对接研究.晶体复合物对接和假复合物对接两种模式对接的结果基本相同,并与实验结果吻合.在进...
关键词：酵母乙酰羟酸合成酶(AHAS) 对接 磺酰脲 作用模型 
单嘧磺隆晶体-活性构象转换的分子动力学模拟被引量：2
《高等学校化学学报》2007年第2期278-282,共5页陈沛全 孙宏伟 李正名 王建国 马翼 赖城明 
国家'九七三'计划项目(批准号:2003CB114406);国家自然科学基金重点项目(批准号:20432010);天津市科委高性能计算项目(批准号:043185111-5)资助
应用分子动力学模拟方法对单嘧磺隆在水、正辛醇和正辛烷3种不同溶剂中的构象行为、单嘧磺隆与3种溶剂之间的相互作用能及氢键相互作用进行了计算研究.计算结果表明,在3种不同的溶剂中,单嘧磺隆的优势构象不同;其构象转换过程,特别是转...
关键词：单嘧磺隆 分子动力学模拟 溶液 构象 氢键 
单嘧磺隆除草剂的晶体构象-活性构象转换的密度泛函理论研究被引量：5
《化学学报》2006年第13期1341-1348,共8页陈沛全 孙宏伟 李正名 王建国 马翼 赖城明 
国家973计划(No.2003CB114406);国家自然科学基金重点项目(No.20432010);天津市科委高性能计算(No.043185111-5)资助项目.
应用密度泛函理论在B3LYP/6-31G(d)水平上对新型除草剂单嘧磺隆绕脲桥部分两个C—N键的内旋转势能面进行计算,然后对势能面上的驻点进行构型优化和过渡态搜索,得到单嘧磺隆4种稳定构象和构象转换过程所涉及的8个过渡态结构.研究结果表明...
关键词：单嘧磺隆 构象 内旋转 密度泛函理论 氢键 
吡唑衍生物与碘甲烷反应的密度泛函理论研究
《高等学校化学学报》2006年第11期2175-2178,共4页沈福刚 段文勇 孙宏伟 陈兰 陈沛全 赖城明 李正名 
天津市科委高性能计算基金(批准号:043185111-5);南开大学'南开之星'高性能计算项目资助
采用密度泛函方法对3-甲硫基-4氰-基-5-氨基吡唑与碘甲烷反应的机理进行了研究.提出了两种可能的反应途径:反应途径Ⅰ为反应物先脱去吡唑上的质子,生成阴离子中间物,然后碘甲烷分别进攻中间物吡唑环上的2个氮原子,生成两种异构产物;反...
关键词：密度泛函理论 过渡态 吡唑衍生物 反应途径 
带状修饰的杯[4]吡咯对卤素阴离子识别的研究被引量：1
《高等学校化学学报》2006年第2期336-339,共4页赵培莉 孙宏伟 陈兰 沈荣欣 陈沛全 袁静 袁满雪 赖城明 
国家自然科学重点基金(批准号:29832050);教育部高等学校骨干教师资助计划;天津市科委'南开之星'高性能计算项目基金(批准号:043185111-5)资助
应用分子力学/分子动力学模拟方法研究了4种带状修饰的杯[4]吡咯对卤素阴离子的识别作用.模拟结果表明,加入带状修饰链和调节链长可以增强对某种特殊卤素阴离子的识别,在这个过程中,卤素阴离子与杯[4]吡咯NH上的氢形成的多氢键使主体分...
关键词：吡咯 分子力学 分子动力学 阴离子识别 
杯[4]二吡咯与卤素阴离子相互作用的密度泛函理论研究被引量：5
《高等学校化学学报》2006年第2期332-335,共4页陈东辉 陈沛全 孙宏伟 陈兰 沈荣欣 袁静 袁满雪 赖城明 李正名 
国家自然科学重点基金(批准号:29832050);教育部高等学校骨干教师资助计划;天津市科委高性能计算基金(批准号:043185111-5)资助
采用密度泛函B3LYP方法,在6-31G*/LANL2DZ水平上对杯[4]二吡咯主体分子及其与卤素阴离子形成的复合物进行研究.结果表明,杯[4]二吡咯可与卤素阴离子相互作用形成具有较高对称性的复合物,其8个吡咯NH基团上的H原子均可以和卤素阴离子形...
关键词：密度泛函(DKT) 二吡咯 卤素阴离子 主客体相互作用 氢键 
二酰胺吡啶修饰杯[4]芳烃与脂肪二羧酸主客体相互作用的理论研究
《高等学校化学学报》2006年第1期153-155,共3页陈东辉 孙宏伟 陈兰 沈荣欣 袁静 陈沛全 袁满雪 赖城明 
国家自然科学重点基金(批准号:29832050);教育部高等学校骨干教师资助计划;天津市科委高性能计算基金(批准号:043185111-5);南开大学'南开之星'高性能计算项目资助
The interest in calixarenes has been related to their ability as receptors for neutral molecules.In the present paper,molecular mechanics and molecular dynamics simulations were used to investigate the molecular recog...
关键词：分子力学 分子动力学 杯[4]芳烃 脂肪二羧酸 主客体相互作用 
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