王海鹏

作品数：2被引量：5H指数：2
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供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
发文主题：串联质谱同位素蛋白质鉴定蛋白质组学蛋白质组更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>
发文期刊：《色谱》《计算机研究与发展》更多>>
所获基金：国家重点基础研究发展计划国家科技攻关计划国家高技术研究发展计划更多>>
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肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用被引量：3
《色谱》2010年第6期529-534,共6页刘超 王海鹏 付岩 袁作飞 迟浩 王乐珩 孙瑞祥 贺思敏 
国家"863"计划项目(No.2008AA02Z309和No.2007AA02Z315);国家"973"计划项目(No.2010CB912701);中国科学院知识创新计划项目(No.KGGX1-YW-13)
液相色谱-质谱(LC-MS)联用是当今规模化蛋白质鉴定的主流技术。肽段在反相液相色谱(RPLC)中的保留时间主要是由肽段的理化性质和LC条件(固定相、流动相)决定的。可以通过分析肽段的理化性质,并量化它们对肽段色谱行为的影响来预测保留...
关键词：反相液相色谱-质谱联用 保留系数 机器学习 保留时间 预测 蛋白质 肽 鉴定 
pepReap:基于支持向量机的肽鉴定算法被引量：2
《计算机研究与发展》2005年第9期1511-1518,共8页王海鹏 付岩 孙瑞祥 贺思敏 曾嵘 高文 
国家"九七三"重点基础研究发展规划基金项目(2002CB713807);国家科技攻关计划基金项目(2004BA711A21)~~
利用生物质谱技术进行肽蛋白质鉴定是蛋白质组学研究中的关键问题.提出了一种基于支持向量机(SVM)的肽鉴定算法pepReap.算法由粗细两层打分体系构成,粗打分利用匹配谱峰总强度和数目及肽长度等信息得到候选肽序列的列表,细打分通过SVM...
关键词：支持向量机 分类 蛋白质组学 肽鉴定 不平衡数据集 参数选择 
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