王乐珩

作品数：5被引量：24H指数：3
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供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
发文主题：蛋白质鉴定蛋白质序列肽谱索引文件白质更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>
发文期刊：《计算机工程与设计》《色谱》《生物化学与生物物理进展》《微电子学与计算机》更多>>
所获基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家科技重大专项国家科技攻关计划更多>>
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蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组被引量：4
《生物化学与生物物理进展》2013年第4期297-308,共12页张昆 王乐珩 迟浩 卜德超 袁作飞 刘超 樊盛博 陈海丰 曾文锋 罗海涛 孙瑞祥 贺思敏 谢鹭 赵屹 
国家重点基础研究发展计划(973)(2010CB912701;2010CB912702);中国科学院知识创新计划(KGCX1-YW-13)资助项目~~
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多...
关键词：蛋白质基因组学 基因组注释 蛋白质组学 质谱技术 
肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用被引量：3
《色谱》2010年第6期529-534,共6页刘超 王海鹏 付岩 袁作飞 迟浩 王乐珩 孙瑞祥 贺思敏 
国家"863"计划项目(No.2008AA02Z309和No.2007AA02Z315);国家"973"计划项目(No.2010CB912701);中国科学院知识创新计划项目(No.KGGX1-YW-13)
液相色谱-质谱(LC-MS)联用是当今规模化蛋白质鉴定的主流技术。肽段在反相液相色谱(RPLC)中的保留时间主要是由肽段的理化性质和LC条件(固定相、流动相)决定的。可以通过分析肽段的理化性质,并量化它们对肽段色谱行为的影响来预测保留...
关键词：反相液相色谱-质谱联用 保留系数 机器学习 保留时间 预测 蛋白质 肽 鉴定 
基于电子捕获裂解/电子转运裂解串联质谱技术的蛋白质组学研究被引量：15
《生物化学与生物物理进展》2010年第1期94-102,共9页孙瑞祥 董梦秋 迟浩 杨兵 秀丽蕴 王乐珩 付岩 贺思敏 
国家高技术研究发展计划(863)(2008AA02Z309;2007AA02Z315;2007AA02Z1A7);国家重点基础研究发展计划(973)(2010CB912701);中国科学院知识创新计划(KGGX1-YW-13)资助项目~~
蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度.最近10年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术——电子捕获裂解(electron capture dissociation,ECD)与电子转运裂解(electron trans...
关键词：电子捕获裂解 电子转运裂解 碰撞诱导裂解 串联质谱技术 计算蛋白质组学 
pPre_ITMS:基于机器学习方法的串联质谱数据预处理系统
《计算机工程与设计》2007年第9期2111-2113,2133,共4页邹翠 付岩 孙瑞祥 王乐珩 赵德斌 
国家973重点基础研究发展计划基金项目(2002CB713807);国家科技攻关计划基金项目(2004BA711A21)
串联质谱技术被广泛应用于高通量的蛋白质鉴定。质谱中噪音峰和同位素峰的存在会降低蛋白质鉴定的准确性,同时增加计算负担。pPre_ITMS系统是针对离子阱数据,利用机器学习中的最大期望方法和决策树方法分别识别出质谱中的噪音基线和同...
关键词：机器学习 串联质谱 预处理 
AproPhos:基于AdaBoost方法的蛋白质磷酸化修饰预测系统被引量：2
《微电子学与计算机》2007年第7期35-39,共5页蔡津津 赵杰煜 王乐珩 
国家"973"计划课题(2002CB713807);国家重大专项(2004BA711A21);中国科学院计算技术研究所领域前沿青年创新基金
磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化修饰数据不断积累,利用已有数据进行蛋白质磷酸化修饰位点预测的条件日益成熟。利用修饰位点附近氨基酸性质取代氨基酸种类作为特征,对现有516种氨基酸性质做了详细分析和筛选,...
关键词：磷酸化 预测 氨基酸性质 ADABOOST 
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