曾文锋

作品数：5被引量：11H指数：2
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供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
发文主题：肽段蛋白质组学串联质谱谱图谱峰更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术理学文化科学更多>>
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蛋白质组学肽段鉴定可信度评价方法
《生物化学与生物物理进展》2023年第1期109-125,共17页周文婧 曾文锋 迟浩 贺思敏 
国家重点研发计划重点专项(2016YFA0501300);国家自然科学基金优秀青年科学基金(32022046)资助项目。
蛋白质组学基于质谱数据鉴定肽段和蛋白质,从而给出基因表达的直接证据,帮助解析蛋白质的结构和功能,研究蛋白质与疾病的关系,提供靶向治疗方案,而这些都取决于鉴定的肽段和蛋白质的准确性。蛋白质组学常采用目标-诱饵库方法 (target-de...
关键词：蛋白质组学 质谱分析 目标-诱饵库方法 假发现率 可信度评价方法 
肽段的理论串联质谱图预测方法研究进展被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2019年第2期169-180,共12页周撷璇 任睿 高婉铃 黄运有 曾文锋 孔德飞 郝天舒 张知非 詹剑锋 
国家重点研究发展计划(2016YFB1000605)资助项目~~
基于串联质谱技术的蛋白质组学已经成为生命科学领域的重要工具,其中肽段的理论串联质谱图(通常也被称为二级谱图)预测问题在近年来广受关注.大量高质量质谱数据的积累和计算技术的发展为此问题的解决提供了有效途径.肽段的理论二级谱...
关键词：质谱 蛋白质组学 移动质子模型 机器学习 深度学习 
N-糖肽的规模化质谱解析方法进展被引量：6
《生物化学与生物物理进展》2016年第6期550-562,共13页曾文锋 张扬 刘铭琪 吴建强 张晓今 杨皓 刘超 迟浩 张昆 孙瑞祥 杨芃原 贺思敏 
国家自然科学基金(21227805,31300680);国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB911203,2012CB910602,2010CB912701,2011CB910600);国家高技术研究发展计划(863)(2014AA020901;2014AA020902;2012AA020203)资助项目~~
蛋白质糖基化修饰的鉴定是蛋白质翻译后修饰分析中最具挑战性的任务之一,近几年尤其受到关注.快速发展的质谱技术为规模化的蛋白质糖基化修饰研究提供了有效的手段.与其他基于质谱技术的翻译后修饰鉴定相比,糖基化鉴定的难点在于糖链是...
关键词：糖蛋白质组学 糖肽 糖基化 质谱 
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组被引量：4
《生物化学与生物物理进展》2013年第4期297-308,共12页张昆 王乐珩 迟浩 卜德超 袁作飞 刘超 樊盛博 陈海丰 曾文锋 罗海涛 孙瑞祥 贺思敏 谢鹭 赵屹 
国家重点基础研究发展计划(973)(2010CB912701;2010CB912702);中国科学院知识创新计划(KGCX1-YW-13)资助项目~~
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多...
关键词：蛋白质基因组学 基因组注释 蛋白质组学 质谱技术 
规模化蛋白质鉴定中母离子的准确检测技术研究被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2013年第1期80-92,共13页袁作飞 邬龙 刘超 迟浩 樊盛博 张昆 曾文锋 孙瑞祥 贺思敏 
国家重点基础研究发展计划(973)(2010CB912701,2012CB910602);中国科学院知识创新计划(KGGX1-YW-13);国家自然科学基金(30900262);国家高技术研究发展计划(863)(2007AA02Z315,2008AA02Z309)资助项目~~
蛋白质组学的基础研究之一是蛋白质鉴定.规模化的蛋白质鉴定通常采用"鸟枪法",即选择一些酶切肽段(母离子)碎裂生成二级谱图,通过二级谱图及其母离子质量鉴定肽段,再推断对应的蛋白质.在鉴定过程中,母离子质量是一个关键参数.母离子是...
关键词：蛋白质组学 蛋白质鉴定 母离子 单同位素峰 系统误差 
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