王端青

作品数:2被引量:4H指数:1
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供职机构:苏州大学电子信息学院更多>>
发文主题:数据识别可变剪接RNA编辑黑猩猩转录组测序更多>>
发文领域:生物学更多>>
发文期刊:《中国科学:生命科学》《生物化学与生物物理进展》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
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基于转录组测序数据识别黑猩猩RNA编辑位点
《生物化学与生物物理进展》2012年第3期282-293,共12页王端青 何涛 汪莉 王玉民 邵卫东 
国家自然科学基金资助项目(30800644);国家高技术研究发展计划(863)(2007AA022204);国家科技重大新药创制专项(2008ZXJ09007-001)资助~~
使用转录组测序(RNA-Seq)数据识别黑猩猩RNA编辑位点,探索了RNA编辑的识别机制以及潜在的功能影响.基于黑猩猩RNA-Seq数据与基因组序列的比对信息发现RNA-DNA错配位点,并构建编辑位点候选集.从中滤除基因组或转录组测序质量低的位点,其...
关键词:黑猩猩 RNA编辑 转录组测序 计算识别 
基于RNA-Seq数据识别果蝇剪接位点和可变剪接事件被引量:4
《中国科学:生命科学》2011年第10期1016-1023,共8页何涛 王端青 胡亚欧 张颖 邵卫东 汪莉 王玉民 
国家自然科学基金(批准号:30800644);国家高技术研究发展计划(批准号:2007AA022204);国家"重大新药创制"科技重大专项(批准号:2008ZXJ09007-001)资助项目
完整基因结构的预测是当前生命科学研究的一个重要基础课题,其中一个关键环节是剪接位点和各种可变剪接事件的精确识别.基于转录组测序(RNA-seq)数据,识别剪接位点和可变剪接事件是近几年随着新一代测序技术发展起来的新技术策略和方法...
关键词:剪接位点 可变剪接 黑腹果蝇 RNA-SEQ 
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