端木慧子

作品数：7被引量：52H指数：5
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供职机构：东北农业大学更多>>
发文主题：大豆编码基因生物信息学分析生物信息学相关蛋白更多>>
发文领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
发文期刊：《作物学报》《东北农业大学学报》《大豆科学》《分子植物育种》更多>>
所获基金：黑龙江省高校科技创新团队建设计划项目国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项国家基础科学人才培养基金更多>>
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大豆MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析被引量：17
《大豆科学》2016年第1期52-57,共6页成舒飞 端木慧子 陈超 刘艾林 肖佳雷 朱延明 
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002);国家自然科学基金(31171578);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055);国家基础科学人才培养基金项目(J1210069)
MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程。MYB转录因子在其N端含有其特有的DNA结合基序(MYB-binding domain),能够与DNA分子大沟结合而调控基因表达。本研究通过生物信息学手段,在全基因组...
关键词：大豆 MYB 转录因子 生物信息学 
大豆CML家族基因的生物信息学分析被引量：12
《大豆科学》2015年第6期957-963,共7页陈超 端木慧子 朱丹 刘艾林 肖佳雷 朱延明 
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002);国家自然科学基金(31171578);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055);国家基础科学人才培养基金(J1210069)
CMLs蛋白是一类具有Ca2＋结合的EF-hand保守结构域蛋白,广泛参与钙依赖的信号传导途径,在植物生长发育及生物胁迫与非生物胁迫响应中起着重要的作用。通过NCBI和植物基因组注释数据库等筛选并获得了68个大豆GmCML蛋白;分析了所有蛋白的...
关键词：大豆 CMLs EF-HAND 生物信息学 进化分析 
野生大豆叶片蛋白质组双向电泳技术体系的优化研究被引量：5
《大豆科学》2015年第5期874-880,共7页张宁 孙晓丽 端木慧子 于洋 纪巍 朱延明 
国家自然科学基金(31171578);国家转基因重大专项(2011ZX08004);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055)
为给野生大豆蛋白质组学分析提供技术支撑,以耐盐碱野生大豆叶片为材料,对Tris-饱和酚法、Tris-HCl法和TCA-丙酮法3种蛋白质提取方法进行了比较,并对蛋白上样量、等电聚焦参数及凝胶浓度进行了优化。结果表明:使用Tris-饱和酚法提取蛋白...
关键词：野生大豆 叶片 蛋白质提取 双向电泳 蛋白组学 
野生大豆碳酸盐胁迫应答基因GsMIPS2的克隆及功能分析被引量：3
《作物学报》2015年第9期1343-1352,共10页陈晨 孙晓丽 刘艾林 端木慧子 于洋 肖佳雷 朱延明 
国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002);国家自然科学基金项目(31171578);黑龙江省高校科技创新团队建设计划项目(2011TD055);国家基础科学人才培养基金项目(J1210069)资助
为挖掘野生大豆(Glycine soja L.G07256)耐碳酸盐关键功能基因,利用前期高通量转录组测序数据,从构建的碳酸盐胁迫基因表达谱中,选取了一个碳酸盐胁迫下显著上调表达的肌醇-1-磷酸合酶类基因。采用同源克隆的方法,获得该基因的全长cDNA...
关键词：野生大豆 GsMIPS2基因 肌醇-1-磷酸合成酶 碳酸盐胁迫 
大豆GmUGD基因家族生物信息学分析被引量：5
《东北农业大学学报》2015年第9期23-29,共7页朱延明 朱毅 端木慧子 肖佳雷 于洋 刘艾林 
国家自然科学基金项目(31171578);转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055)
尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGD)是多糖合成中的一个关键酶,广泛参与植物生长发育与非生物胁迫响应过程。采用生物信息学方法,在全基因组水平预测出10个大豆Gm UGD基因;序列分析结果显示,Gm UGD基因均具有UDP-葡萄糖/GDP-甘露糖脱氢酶家族...
关键词：GmUGD基因 大豆 生物信息学 序列分析 表达分析 
大豆基因组GmSRK及其同源基因的生物信息学分析
《大豆科学》2014年第4期497-501,共5页钱雪 孙晓丽 端木慧子 成舒飞 才华 纪巍 赵超越 朱延明 
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002);国家自然科学基金(31171578);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055)
以野生大豆GsSRK氨基酸序列为检索序列,在Phytozome数据库中查找大豆基因组中其同源基因GmSRK。利用Phytozome数据库以及MEGA5.0,ClustalX等软件挖掘大豆基因组GmSRK同源基因,最终确定同源性较高的2个基因Glyma12g21640和Glyma08g06550...
关键词：大豆 GmSRK 类受体蛋白激酶 生物信息学 
大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达被引量：13
《分子植物育种》2013年第5期465-475,共11页江董丽 才华 端木慧子 朱延明 
国家自然科学基金项目(31171578);国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08004002-002);黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD005)共同资助
利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成...
关键词：GST家族 全基因组筛选 分类分析 差异表达基因 
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