董程玲

作品数:2被引量:4H指数:1
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供职机构:南京林业大学信息科学技术学院更多>>
发文主题:LCS最长公共子序列生物信息学遗传连锁图谱并行计算更多>>
发文领域:自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《计算机应用研究》《计算机工程》更多>>
所获基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
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分子标记多位点排序的并行计算
《计算机应用研究》2015年第1期75-79,84,共6页蒋安纳 徐逸卿 董程玲 童春发 
为了对一组连锁的分子标记位点获得正确的排序进而构建生物遗传连锁图谱,提出了并行算法PMMASLH,针对F2作图群体,通过基于消息传递接口并行最大最小蚂蚁系统求解连锁的多个分子标记位点排序,使用隐马尔可夫模型计算一列有序标记位点所...
关键词:分子标记排序 并行计算 最大最小蚂蚁系统 隐马尔可夫模型 F2群体 
多序列的近似LCS改进算法被引量:4
《计算机工程》2011年第2期166-168,171,共4页胡婕 业宁 罗晓波 崔静 董程玲 
江苏省自然科学基金资助项目(BK2009393)
提出2种针对3条源序列的近似LCS算法,近似因子均为1/|∑|。其中,线性近似LCS算法的时空复杂度均为O(n),n为最长源序列的长度,适于解决大规模问题。递归近似LCS算法时空复杂度均为O(nlogn),适于要求高精度问题。同时,这2种算法都能用于...
关键词:生物信息学 最长公共子序列 近似因子 约束 
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