童春发

作品数：27被引量：132H指数：6
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供职机构：南京林业大学森林资源与环境学院更多>>
发文主题：林木遗传力方差分量杉木遗传连锁图谱更多>>
发文领域：生物学农业科学理学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《南京林业大学学报（自然科学版）》《计算机应用研究》《林业科学》《分子植物育种》更多>>
所获基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金江苏省自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
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林木多地点半同胞子代测定遗传分析R语言程序包及其应用被引量：12
《南京林业大学学报（自然科学版）》2015年第5期45-51,共7页王德源 童春发 
国家自然科学基金面上项目(31070601);江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
子代测定是林木育种中的关键环节,有关子代测定的遗传参数和统计量计算还存在不少问题。用于计算多种遗传参数的R语言程序包Halfsib MS,可以对多地点或单地点的半同胞子代测定遗传统计模型进行分析计算,并且可以处理平衡数据或不平衡数...
关键词：R语言程序包HalfsibMS 半同胞子代测定 配合力 方差分量 遗传力 
分子标记多位点排序的并行计算
《计算机应用研究》2015年第1期75-79,84,共6页蒋安纳 徐逸卿 董程玲 童春发 
为了对一组连锁的分子标记位点获得正确的排序进而构建生物遗传连锁图谱,提出了并行算法PMMASLH,针对F2作图群体,通过基于消息传递接口并行最大最小蚂蚁系统求解连锁的多个分子标记位点排序,使用隐马尔可夫模型计算一列有序标记位点所...
关键词：分子标记排序 并行计算 最大最小蚂蚁系统 隐马尔可夫模型 F2群体 
WinNC2:因子交配设计遗传分析软件被引量：3
《林业科学》2014年第1期55-62,共8页童春发 蒋安纳 杨立委 施季森 
国家自然科学基金面上项目(31070601);江苏省高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
因子交配设计在林木遗传育种研究中已经得到广泛应用,然而有关该设计的遗传参数和统计量计算还存在不少问题,这在数据不平衡情况下尤为突出。WinNC2是一个新开发的用于计算因子交配设计遗传模型参数的Windows软件,不但可以处理平衡数据...
关键词：因子交配设计 配合力 方差分量 遗传力 
不平衡巢式设计遗传模型分析被引量：5
《林业科学》2013年第3期1-8,共8页童春发 杨立伟 蒋安纳 施季森 
国家自然科学基金面上项目(31070601);江苏省高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
虽然巢式试验设计在动植物育种中得到广泛应用,但是在不平衡数据条件下有关遗传参数估计和假设检验统计量的计算还存在着很多问题。文中针对不平衡数据条件下的巢式试验设计,使用固定效应模型和随机效应模型估计相关的遗传参数并进行相...
关键词：巢式设计 一般配合力 方差分量 遗传力 
ASReml及其在林木遗传分析中的应用前景被引量：17
《林业科技开发》2012年第4期9-12,共4页边黎明 施季森 童春发 郑仁华 
国家"十二五"科技支撑课题(编号:2012BAD01B05);江苏高校优势学科建设工程资助项目;国家林业局林业科学技术推广项目(编号:2012[50]号)
介绍了当前用于林木遗传分析的主要方法和统计软件,详细阐述了ASReml软件的基本原理、功能、特点、操作步骤以及在当前林木育种中的应用情况和在方差分量估计、育种值预测、多变量分析和基因型与环境互作等领域的应用前景,以此为基础开...
关键词：ASReml 混合线性模型 林木遗传分析 应用前景 
林木半同胞子代测定遗传模型分析被引量：26
《林业科学》2010年第1期29-35,共7页童春发 卫巍 尹辉 施季森 
福建省重点公关项目"杉木纸浆材选育研究"(021010314);国家"十一五"科技支撑育种工程项目"速生优质杉木新品种"(2006BAD01A14)
针对林木单地点半同胞子代测定试验,给出遗传模型不同形式的表达式,采用方差分析法推导平衡数据和不平衡数据条件下方差分量估计式,并给出方差分量估计的抽样方差以及方差分量假设检验统计量的计算方法。在此基础上,给出不平衡数据条件...
关键词：子代测定 方差分量 遗传力 遗传相关 不平衡数据 
基因芯片筛选差异表达基因方法比较被引量：4
《遗传》2008年第12期1640-1646,共7页单文娟 童春发 施季森 
江苏省自然科学基金“重要模式树种(杨树和杉木功能基因组学研究)”项目(编号:BK2003213)资助~~
使用计算机模拟数据和真实的芯片数据,对8种筛选差异表达基因的方法进行了比较分析,旨在比较不同方法对基因芯片数据的筛选效果。模拟数据分析表明,所使用的8种方法对均匀分布的差异表达基因有很好的识别、检出作用。算法方面,SAM和Wilc...
关键词：基因芯片 杨树 差异表达 
杨树部分基因起始密码子AUG侧翼序列特征分析被引量：2
《南京林业大学学报（自然科学版）》2008年第5期61-64,共4页单文娟 周猛 卫巍 童春发 施季森 
江苏省自然科学基金资助项目(BK2003213)
对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析。结果表明:紧邻起始密码子5′端的-1、-2、-3、-4...
关键词：杨树 “AUG”侧翼序列 保守性 关联性 AUGCAI值 
杉木CCoAOMT蛋白的生物信息学分析与同源模建被引量：5
《生物信息学》2008年第2期62-64,74,共4页周猛 洑香香 童春发 施季森 杨立伟 王桂凤 
国家重点基础研究规划"973"项目(TG1999016004);江苏省科技厅课题(No.BK2003213)
利用生物信息学方法分析了杉木CCoAOMT蛋白的氨基酸组成、等电点、疏水/亲水区、二级结构等蛋白质性质,并同欧洲云杉、拟南芥和水稻的蛋白进行了对比,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,同时对模建结果进行了结构质量的分析与...
关键词：杉木 CCoAOMT蛋白 生物信息学 同源模建 
充分利用Bioperl加速生物信息学的研究被引量：4
《生物信息学》2008年第1期43-45,共3页周猛 童春发 施季森 
国家重点基础研究规划"973"项目(TG1999016004)
Bioperl是Perl语言专门用于生物信息的工具与函数模块集,是世界各地的Perl开发人员在生物信息学、基因组学以及其他生命科学领域的智能结晶,服务于研究生物学问题的生物学家或计算机专家。通过对Bioperl进行了详细的介绍,并利用几个研...
关键词：Bioperl 生物信息学 
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