时伟

作品数:15被引量:72H指数:5
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供职机构:中国科学院南海海洋研究所更多>>
发文主题:ITS1ITS2鲽形目协同进化鱼类更多>>
发文领域:生物学农业科学天文地球更多>>
发文期刊:《中国水产科学》《Zoological Research》《海洋与湖沼》《动物学杂志》更多>>
所获基金:国家自然科学基金教育部重点实验室开放基金山东省科技计划项目中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
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长臂缨鲆核糖体RNA基因序列多态性特征分析
《热带海洋学报》2019年第1期55-66,共12页杨敏 孔晓瑜 时伟 龚理 
国家自然科学基金项目(31272273)~~
为了解鲽形目Pleuronectiformes鲆科Bothidae长臂缨鲆Crossorhombuskobensis(Jordan&Starks,1906)核糖体RNA基因的序列多态性特征,本研究共获得该鱼类包括18S、5.8S、ITS1和ITS2全长及28S部分序列的128条克隆序列。经序列比对、聚类分...
关键词:核糖体RNA 基因 长臂缨鲆 多态性 假基因 非协同进化 重组 
鲽科10种鱼类核糖体ITS2序列比较分析被引量:2
《动物学杂志》2018年第6期938-950,共13页杨敏 孔晓瑜 时伟 龚理 
国家自然科学基金项目(No.31272273).
为了解鲽科鱼类ITS2序列的多态性特征,本研究获得了鲽科10种鱼类310条ITS2序列,长度在419~486 bp之间。种内序列长度差异最小的为粒鲽(Clidoderma asperrima)(419~420 bp)和太平洋拟庸鲽(Hippoglossoides elassodon)(419~420 bp),其...
关键词:鲽科 ITS2 多态性 二级结构 协同进化 非协同进化 
11种鲈形目鱼类ITS2特征及系统应用被引量:2
《中国水产科学》2018年第6期1151-1160,共10页武宝生 司李真 孔晓瑜 时伟 龚理 杨敏 刘静 
国家自然科学基金项目(31272273)
ITS2 (Internal transcribed spacer 2)是位于核糖体5.8S和28S基因之间的非编码序列。为了探讨该片段的多样性特征以及进化模式,本研究选取了鲈形目(Perciformes) 5科11种鱼类为研究对象,共获得了444条ITS2克隆序列,其长度范围为332~51...
关键词:多态性 协同进化 非协同进化 系统关系 ITS2 鲈形目 
5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性被引量:6
《水产学报》2018年第4期465-475,共11页武宝生 司李真 孔晓瑜 时伟 杨敏 
国家自然科学基金(31272273;41276166)~~
为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442~661 bp;通过对所有序列的长度...
关键词:鲈形目 鲹科 ITS1序列多态性 系统演化 假基因 
褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)线粒体基因组特征及重排机制研究被引量:1
《热带海洋学报》2018年第1期1-11,共11页董江星 时伟 孔晓瑜 陈世喜 
国家自然科学基金项目(31471979;30870283)~~
冠鲽科(Samaridae)隶属于鲽形目(Pleuronectiformes),包含冠鲽属(Samaris)、沙鲽属(Samariscus)和斜鲽属(Plagiopsetta)。目前研究表明,冠鲽(Samaris cristatus)和满月沙鲽(Samariscus latus)的线粒体基因组结构都有重排,并且两者的基...
关键词:鲽形目 冠鲽科 线粒体基因组 基因重排 分子进化 
11种鲈形目鱼类的核糖体基因GC含量及其与硬骨鱼类的特征比较被引量:6
《中国水产科学》2017年第4期657-668,共12页司李真 武宝生 孔晓瑜 杨敏 龚理 时伟 
国家自然科学基金项目(31272273;41276166)
核糖体基因为串联重复多拷贝的基因,包括3个编码基因(18S,5.8S,28S)和两个间隔区ITS1(internal transcribed spacer 1)和ITS2(internal transcribed spacer 2)。目前,对核糖体基因的相关报道主要集中在个体内不同拷贝间的多态特征,以及...
关键词:编码基因 间隔区 18S 5.8S ITS1 ITS2 
5种鳎科鱼类核糖体ITS1序列比较被引量:4
《水产学报》2017年第3期321-329,共9页龚理 时伟 杨敏 司李真 孔晓瑜 
国家自然科学基金(31272273);广西红树林保护与利用重点实验室开放基金(GKLMC-201502)~~
核糖体基因在很长一段时间内被认为严格遵循协同进化方式,但是在很多种类中都发现了明显的序列多态性,表明其是非协同进化。为了检测鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1(ITS1)序列是否存在多态性,并探究其能否作为种类鉴定的分子标记,本研究...
关键词:鳎科 内转录间隔区 种类鉴定 分子标记 假基因 非协同进化 聚类分析 
硬骨鱼类核糖体基因间隔区的序列特征分析被引量:4
《热带海洋学报》2016年第6期74-81,共8页司李真 时伟 杨敏 龚理 孔晓瑜 
国家自然科学基金项目(31272273)~~
真核生物核糖体DNA(ribosomalDNA,简称rDNA)是由几十个甚至上万个高度串联重复序列组成的多基因家族,每个重复单元都包括编码区(18S、5.8S和28S)和非编码区(ITS1和ITS2)。间隔区ITS1和ITS2常被用于属级及以下阶元水平的系统关系研究。然...
关键词:硬骨鱼类 ITS1 ITS2 序列长度 序列保守位点比例 系统发育 
COⅠ和16S rRNA基因序列在鳎科(Soleidae)鱼类种类鉴定中的适用性研究被引量:12
《热带海洋学报》2014年第3期57-65,共9页王淑英 时伟 江金霞 苗宪广 王忠明 孔晓瑜 
中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-YW-Z-0929);国家自然科学基金项目(30870283;31071890)
文中探讨了线粒体COⅠ(线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ)和16S rRNA基因片段的遗传特性及其在鳎科鱼类种类鉴定和系统演化中的适用性。通过测序和下载GenBank中的相关数据,分别获得了鳎科14属24种鱼类的65个个体的COⅠ基因片段以及14属23种鱼类...
关键词:鳎科 CO Ⅰ16S RRNA K2P遗传距离 物种鉴定 
鱼类线粒体DNA重排研究进展被引量:13
《Zoological Research》2013年第6期666-673,共8页龚理 时伟 司李真 孔晓瑜 
国家自然科学基金项目(30870283;31071890;41206134)
一般认为鱼类线粒体基因组在结构上具有高度的保守性,但是通过分析NCBI数据库中的1 255种鱼类线粒体基因组全序列(截至2013年11月3日),发现~52种鱼线粒体基因组发生了重排。进一步的分析发现这些重排具有3种类型:滑移(shuffling...
关键词:MTDNA 移位 滑移 倒置 基因重排 系统发生 
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