徐文韬

作品数:2被引量:2H指数:1
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供职机构:中国计量学院生命科学学院更多>>
发文主题:核心启动子基于支持向量机支持向量机SVMSPWMS更多>>
发文领域:生物学更多>>
发文期刊:《安徽农学通报》更多>>
所获基金:浙江省教育厅科研计划中国计量学院校立基金更多>>
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基于支持向量机(SVMs)的人类核心启动子的识别被引量:2
《安徽农学通报》2006年第13期64-66,76,共4页徐文韬 叶子弘 俞晓平 
浙江省教育厅项目(No.20060522);中国计量学院自然科学基金项目(No.0100802-0040);中国计量学院第十届学生科研计划项目
本文采用基于支持向量机(SVM s)的方法预测了4类含有核心启动子元件的启动子和含有CCAAT-box的启动子。4类核心启动子元件分别是DPE,BRE,TATA-box和Inr。特征提取采用基于位点权重矩阵(PWM s)的程序Promoter C lassifier进行。本文预测...
关键词:人类核心启动子 支持向量机(SVMs) 位点权重矩阵(PWMs) 预测 识别 
基于支持向量机(SVMs)的核心启动子识别方法
《安徽农学通报》2006年第13期71-74,200,共5页徐文韬 叶子弘 俞晓平 
浙江省教育厅项目(No.20060522);中国计量学院自然科学基金项目(No.0100802-0040);中国计量学院第十届学生科研计划项目
本文介绍了TATA-box和GC-box等4类常见的核心启动子元件,并提出了结合位点权重矩阵的基于支持向量机的核心启动子识别方法。正确识别核心启动子的一个决定因素是找到一个最优的判别函数使得测试样本尽可能被正确分类,本文从测试样本的...
关键词:支持向量机 位点权重矩阵 核心启动子 识别 
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