李江域

作品数：13被引量：35H指数：4
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供职机构：军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所更多>>
发文主题：生物信息学高通量测序微生物检测GPU计算云计算更多>>
发文领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
发文期刊：《军事医学》《解放军医院管理杂志》《生物技术通讯》《生物信息学》更多>>
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Docker技术在生物信息学中的应用被引量：4
《军事医学》2016年第7期614-616,F0003,共4页佟凡 王小磊 李江域 屈武斌 赵东升 
军队后勤科技"十二五"重点资助项目(BS212J009)
随着高通量测序、蛋白质组学等生物技术的迅猛发展,生物医学数据、生物信息学工具及分析应用需求均呈现出多样性和复杂性的特点。传统的生物信息计算环境如专用工作站、虚拟机等已无法较好地适应这一情况。Docker作为一种新兴的容器技术...
关键词：DOCKER 云计算 生物信息学 标准化 复用性 
军人健康评估标准流程研究被引量：5
《人民军医》2016年第7期682-685,共4页孟海滨 李立 李江域 迟晨阳 赵东升 
军队科技计划青年培育项目(14QNP114)
制定军人健康评估标准流程,可以统一规范各类军人健康评估的实施流程和步骤,有利于将军人健康评估纳入标准化轨道,提高军人健康管理水平。本文通过抽取各类军人健康评估的共性要素,观察各流程的关键环节,探讨了军人健康评估标准流程的...
关键词：军人 健康评估 标准流程 
网络医疗设计现状与发展被引量：4
《解放军医院管理杂志》2016年第2期192-194,共3页周登峰 贺祯 邵壮超 李江域 张立国 
系统分析国内外网络医疗发展现状,将国内网络医疗的发展归纳为网站咨询、虚拟医院、移动互联三个阶段,针对网络医疗在专业性、正确性、可靠性等方面带来的新问题,深入探讨未来中国网络医院模式、网络医疗的发展前景及对现行医疗模式的...
关键词：网络医疗 大数据 物联网 
RNA-Seq本地分析平台的构建被引量：2
《生物技术通讯》2015年第2期211-214,共4页李江域 陈胜 王小磊 赵东升 王玉民 
全军医学科技青年培育项目(13QNP142)
目的:构建一个本地化的RNA-Seq数据处理分析平台,为RNA-Seq研究人员提供数据分析平台。方法:在调研现有的RNA-Seq数据分析研究成果的基础上,构建一套本地化的RNA-Seq分析平台,平台首先将测序数据中的低质量数据进行过滤,然后使用Top Ha...
关键词：RNA-SEQ 高通量测序 生物信息学 分析平台 
基于高通量测序数据的微生物检测算法研究进展被引量：3
《军事医学》2015年第1期71-74,共4页李江域 王小磊 毛逸清 赵东升 
全军医学科技青年培育资助项目(13QNP142)
新一代高通量测序技术的发展,推动了多个相关研究领域的发展。国际上许多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生物检测算法流程设计成功并公开发布。该文通过调研利用高通量测...
关键词：高通量测序 微生物检测 生物信息学 算法 
电子健康档案数据分析应用总体框架研究被引量：9
《医学信息学杂志》2014年第11期2-7,共6页孟海滨 李立 王惠淑 尉景辉 李江域 毛华坚 迟晨阳 赵东升 
全军后勤科技"十二五"重点项目(项目编号:BS211R008)
梳理电子健康档案数据分析应用的内涵,在对国内外电子健康档案数据分析应用现状进行总结的基础上,构建包含业务领域、分析主题、分析指标3个层次的电子健康档案数据分析应用总体框架,归纳出数据统计、数据分析、综合报告3种数据展现方式...
关键词：电子健康档案 数据分析 总体框架 
基于高通量测序数据的微生物检测算法被引量：2
《北京生物医学工程》2013年第5期463-466,496,共5页李江域 王小磊 刘阳 毛逸清 赵东升 王玉民 
目的设计一种基于高通量测序数据的功能强大、处理速度快且不依赖于运行环境的本地化的微生物检测算法。方法对微生物基因组进行分组,每次使用一组微生物基因组提取映射到其上的测序数据并滤除数据中的人类基因组数据,然后对序列进行拼...
关键词：高通量测序 微生物检测 序列比对 序列拼接 算法 
基于CUDA的BLASTN加速研究
《军事医学》2013年第10期774-779,共6页刘阳 王小磊 毛逸清 李江域 赵东升 
军队后勤科技"十二五"重点资助项目(BWS11J070;BS212J009)
目的利用图形处理器(graphic processing unit,GPU)计算技术对广泛使用的生物信息学序列比对工具BLASTN加速,服务于新一代测序技术条件下海量生物序列数据分析任务。方法采用计算统一设备架构(compute unified device architecture,CUDA...
关键词：序列比对 CUDA BLASTN 并行计算 
利用Galaxy与高性能计算集群构建本地化一站式生物信息学平台被引量：1
《军事医学》2013年第10期780-783,共4页王小磊 李江域 毛逸清 刘阳 王玉峰 赵东升 
军队后勤科技"十二五"重点资助项目(BWS11J070;BS212J009)
目的构建本地化的高性能一站式数据分析平台,为生物医学研究的相关科研人员提供便捷高效的计算分析服务。方法将Galaxy软件部署在计算集群上,集成工具软件和数据集;利用分布式资源管理应用接口(DRMAA)实现与Sun Grid Engine的协同运作,...
关键词：本地化 一站式 生物信息学 GALAXY 在线分析 高性能计算 
局部序列比对算法及其并行加速研究进展被引量：3
《军事医学》2012年第7期556-560,共5页刘阳 王小磊 李江域 毛逸清 赵东升 
随着新一代测序技术的发展,传统的序列比对工具已无法满足测序产生的海量生物学数据分析处理的需求,研究如何利用最新的计算技术加速序列比对过程具有十分重要的意义。本文回顾了常用的局部序列比对算法,介绍了基于并行计算原理的序列...
关键词：序列比对 并行计算 云计算 HADOOP GPU计算 
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