赵毅

作品数：12被引量：65H指数：4
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供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
发文主题：高性能计算机集群MPIMPI并行容错更多>>
发文领域：自动化与计算机技术自然科学总论文化科学更多>>
发文期刊：《计算机研究与发展》《计算机应用》《云南民族大学学报（自然科学版）》《科研信息化技术与应用》更多>>
所获基金：国家高技术研究发展计划中国科学院战略性先导科技专项中国科学院知识创新工程国家自然科学基金更多>>
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超大规模药物虚拟筛选的实现与应用被引量：1
《计算机科学与探索》2023年第5期1049-1056,共8页张宝花 李辉 刘倩 高美娜 黄荷 赵毅 于坤千 金钟 
国家重点研发计划(2020YFB0204802)。
基于分子对接的药物虚拟筛选技术通过评估多个配体化合物与受体的结合强度来筛选最强结合的分子。在新冠病毒疫情全球蔓延形势下,超大规模快速药物虚拟筛选对于从海量配体结构中筛选出潜药分子至关重要。超级计算机的强大算力为药物虚...
关键词：药物虚拟筛选 分子对接 并行分发 容错管理 动态负载均衡 
超大规模计算集群监控系统的设计与实现被引量：1
《数据与计算发展前沿》2023年第1期97-103,共7页彭亮 牛铁 魏宝亮 赵毅 
中国科学院战略性先导科技专项项目(A类)(XDA19020101)。
【背景】传统集群监控软件在性能、灵活性、可扩展性上无法满足超过10000节点的超大规模计算集群以及多集群系统的监控管理需求。【目的】亟需设计研发新型集群监控系统,提升超大规模计算集群和多集群的运行管理能力与效率。【方法】本...
关键词：超大规模 计算 集群 HPC 监控 
IB网上CPU-GPU异构超算平台容器性能评估及优化被引量：1
《计算机工程与应用》2021年第18期82-85,共4页胡鹤 赵毅 王宪贺 
中欧非跨洲际开放科学云建设(Z201100008320027);中国科学院战略性先导科技专项(XDC01000000)。
为了实现资源和系统环境的隔离,近年来新兴了多种虚拟化工具,容器便是其中之一。在超算资源上运行的问题通常是由软件配置引起的。容器的一个作用就是将依赖打包进轻量级可移植的环境中,这样可以提高超算应用程序的部署效率。为了解基...
关键词：容器 超算 性能 基准测试 优化 
GPU加速高性能计算平台上容器性能评估被引量：1
《云南民族大学学报（自然科学版）》2021年第1期58-62,共5页胡鹤 赵毅 庞飞 
中国科学院战略性先导科技专项(XDC01000000).
容器是近年来新兴的虚拟化工具,可以实现资源和系统环境的隔离.容器能够帮助高性能计算应用程序将依赖打包进轻量级可移植的环境中,解决因软件配置无法在高性能计算资源上运行的问题.容器在虚拟化宿主机过程中具有性能开销,为了解GPU加...
关键词：虚拟化 容器 基准测试 性能开销 
面向集群服务器系统的监控平台综述被引量：4
《科研信息化技术与应用》2018年第1期79-88,共10页胡鹤 赵毅 牛铁 曹荣强 
国家重点研发计划项目(2016YFB0200300)
为保证云计算、高性能计算集群服务器系统的服务能力,需构建监控平台对各种来源数据的实现统一管理、统计分析和展现。本文面向集群服务器系统监控平台的搭建方式,综述当前各种常见的监控平台架构和组件,分析各类平台在部署、数据规模...
关键词：监控 索引 大数据 报警 ELK MAP-REDUCE SPARK 
美国科学基金会大力支持数据密集型科学计算被引量：2
《科研信息化技术与应用》2013年第3期91-93,共3页赵毅 
近年来，美国国家科学基金（National Science Foundation，NSF）为超级计算机的研发与应用提供了大量经费资助，用以促进如环境、基因、容灾和流行病学等以人为本的科学研究。包括资助Cray和伊利诺伊大学合作研发“蓝水”超级计算机；...
关键词：美国科学基金会 密集型 超级计算机 国家科学基金 经费资助 州立大学 科学研究 以人为本 
不同层次MPI并行程序容错的比较被引量：2
《科研信息化技术与应用》2011年第6期14-21,共8页赵毅 曹宗雁 朱鹏 迟学斌 
中国科学院知识创新工程青年人才领域资助项目(CNIC_QN_10004);中国科学院"十一五"信息化专项资助项目(INFO-115-B01);国家863计划资助项目(2011AA01A205)
随着超级计算机系统规模的不断扩大和系统结构的日益复杂,系统容错已经成为大规模超级计算机系统必须解决的一个关键问题。MPI并行程序的容错也日益受到关注,其中检查点设置和回卷恢复是MPI并行程序容错中一种重要的容错技术。本文对MP...
关键词：MPI 容错 检查点设置 回卷恢复 
基于通信优化的Infiniband集群MPI作业加载被引量：1
《计算机应用研究》2011年第11期4256-4259,共4页曹宗雁 牛铁 赵毅 朱鹏 迟学斌 
国家"863"计划重点资助项目(2010AA012301);中国科学院"十一五"信息化专项资助项目(INFO-115-B01);中国科学院知识创新工程青年人才领域项目(CNIC_QN_10004)
针对如何缓解Infiniband集群中因通信冲突引起的MPI程序性能下降问题进行了研究,从系统管理的角度出发,提出了通过改变进程映射来优化MPI作业加载方案从而优化应用程序通信性能的方法,设计了用于评价MPI作业加载方案的通信性能损失系数(...
关键词：高性能计算机 INFINIBAND 集群 MPI 作业加载 通信优化 
基于用户评价的集群作业优先级调度被引量：2
《华中科技大学学报（自然科学版）》2011年第S1期134-138,共5页曹宗雁 赵毅 牛铁 朱鹏 迟学斌 
国家高技术研究发展计划资助项目(2006AA01A116;2006AA01A117);中国科学院"十一五"信息化专项资助项目(INFO-115-B01);中国科学院知识创新工程青年人才领域资助项目(CNIC-QN-10004);中国科学院知识创新工程领域前沿资助项目(0815011103)
从超级计算中心建设和服务的实际需求出发,设计并实现了基于用户评价的集群作业优先级调度策略,从而为科学研究计算提供更多有效机时.从用户基本属性、行为特征以及用户作业的类别、规模、运行时长估算和容错性等几个方面对用户评价的...
关键词：高性能计算机 集群 作业调度 优先级 用户评价 
超级计算环境计算配额系统设计和实现被引量：6
《计算机应用》2010年第12期8-9,39,共3页牛铁 朱鹏 赵毅 曹宗雁 
国家863计划项目(2006AA01A116);中国科学院信息化专项(INFO-115-B01)
在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配...
关键词：超级计算环境 LSF 计算配额 计算机时 深腾7000 
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