张宝花

作品数：14被引量：15H指数：2
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供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
发文主题：并行计算性能分析计算化学基于网格化学信息学更多>>
发文领域：自动化与计算机技术理学文化科学动力工程及工程热物理更多>>
发文期刊：《科研信息化技术与应用》《计算机系统应用》《计算机科学与探索》《数据与计算发展前沿（中英文）》更多>>
所获基金：国家高技术研究发展计划中国科学院信息化专项项目国家自然科学基金更多>>
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基于高性能计算环境的科学应用平台工作流设计与实现
《数据与计算发展前沿（中英文）》2024年第4期150-162,共13页武傲 李天颜 张宝花 徐顺 刘倩 
国家重点研发计划课题“多物理复杂体系科学计算应用平台”(2020YFB0204802);甘肃省科技计划项目“甘肃省生物医药高性能计算示范平台”(21YF5GA005)。
【目的】为了有效解决领域科学应用计算中的复杂多步计算及高通量计算流程繁琐、低效的问题,本文研究科学应用平台工作流的关键技术。【应用背景】本文将基于高性能计算环境的科学应用平台与工作流的理念相结合,同时适用于多领域、多体...
关键词：高性能计算应用服务 工作流 科学应用平台 
eMD:基于异构计算的大规模分子动力学模拟软件被引量：1
《数据与计算发展前沿》2024年第1期21-34,共14页徐顺 张宝花 刘倩 金钟 
国家重点研发计划课题“多物理复杂体系科学计算应用平台”(2020YFB0204802);甘肃省科技计划项目“甘肃省生物医药高性能计算示范平台”(21YF5GA005)。
【目的】异构计算已经成为高性能计算的重要组成部分,GPU异构计算可显著提速计算密集型的分子动力学模拟应用,本文介绍自研分子动力学模拟软件eMD的系统设计及其异构计算应用。【方法】首先介绍eMD软件的目标定位,包括应用功能和计算性...
关键词：分子动力学 GPU异构计算 并行计算 国产超算 
薄膜生长数据自动化采集技术研究被引量：1
《数据与计算发展前沿》2023年第3期29-38,共10页王丹 周明波 李云龙 何露 孙伟轩 林泽丰 李佳豪 竺云 陈其宏 张宝花 袁洁 翁红明 
中国科学院科学网信专项2022年度应用示范项目(CAS-WX2021SF-0102)。
[目的]本研究旨在通过自动化采集薄膜生长数据,从而提高薄膜数据采集的效率,大幅加快薄膜研究及工艺摸索。[应用背景]随着薄膜技术的不断发展和应用,需要对薄膜生长过程进行深入的研究,以便更好地理解薄膜生长的机制。然而,目前的薄膜...
关键词：薄膜生长 数据采集 电子实验记录本 
超大规模药物虚拟筛选的实现与应用被引量：1
《计算机科学与探索》2023年第5期1049-1056,共8页张宝花 李辉 刘倩 高美娜 黄荷 赵毅 于坤千 金钟 
国家重点研发计划(2020YFB0204802)。
基于分子对接的药物虚拟筛选技术通过评估多个配体化合物与受体的结合强度来筛选最强结合的分子。在新冠病毒疫情全球蔓延形势下,超大规模快速药物虚拟筛选对于从海量配体结构中筛选出潜药分子至关重要。超级计算机的强大算力为药物虚...
关键词：药物虚拟筛选 分子对接 并行分发 容错管理 动态负载均衡 
燃烧动力学平台设计
《计算机系统应用》2022年第5期75-84,共10页张宝花 任海生 王静波 徐江 李象远 金钟 
国家自然科学基金(91841301)。
燃料的相关研究在发动机研制中扮演着重要角色,数据是燃烧模型耦合的基础,反应机理是燃烧数值模拟的关键.针对我国在燃烧数据库建设方面的短板问题和个性化燃烧反应机理构建的迫切需求,本文设计了燃烧动力学平台,包括燃烧数据库和燃烧...
关键词：航空燃料 机理生成 热力学数据 反应机理数据 输运数据 动力学数据 
基于Intel MIC平台大规模耗散粒子动力学模拟的设计与优化
《计算机工程与科学》2017年第8期1391-1396,共6页徐顺 刘倩 张宝花 何连花 金钟 
国家重点研发计划"高性能计算"重点专项项目(2016YFB0201700);中国科学院-英特尔并行计算中心项目(902016000200);中国科学院青年创新促进会(2016156)
耗散粒子动力学(DPD)模拟是一种重要的研究流体动力学特性的计算模拟方法,基于Intel MIC平台设计实现了面向大规模耗散粒子动力学模拟,充分结合了DPD模拟本身的特性和MIC平台的特征。对DPD模拟中的近邻列表构建和短程作用力关键代码实...
关键词：耗散粒子动力学 众核 图像处理单元 分子动力学 
GROMACS软件并行计算性能分析被引量：4
《计算机系统应用》2016年第12期16-23,共8页张宝花 徐顺 
中国科学院青年创新促进会(2016156);"一三五"规划重点培育方向专项项目(CNIC_PY_1404)
分子动力学模拟是对微观分子原子体系在时间与空间上的运动模拟,是从微观本质上认识体系宏观性质的有力方法.针对如何提升分子动力学并行模拟性能的问题,本文以著名软件GROMACS为例,分析其在分子动力学模拟并行计算方面的实现策略,结合...
关键词：分子动力学模拟 GROMACS 并行计算 
小分子配体模仿结合位点水分子:相同配体与不同蛋白靶点之间作用模式的计算研究
《科研信息化技术与应用》2016年第5期36-42,共7页户忠哲 徐顺 张宝花 房森彪 金钟 
在计算化学和药物设计领域中,精确预测小分子配体的蛋白质靶标是一件极具挑战性工作,特别是那些与相同小分子配体相互作用,但蛋白间并不具有显著序列或结构相似性的靶标蛋白。为了研究相同小分子配体与不相关的蛋白质靶标之间的结合特性...
关键词：蛋白水合效应分析 水化位点 结合模型 结合亲和力 分子模拟 
基于高性能计算环境的科学计算应用平台设计与实现被引量：6
《科研信息化技术与应用》2016年第5期43-51,共9页陈新宇 刘倩 张宝花 金钟 
科技部国家重点研发计划项目(2016YFB0201700)
为了提升高性能计算环境的易用性并降低使用门槛,本文提出了一种基于高性能计算环境的通用科学计算应用平台构建方案,旨在为用户提供更便捷、体验更友好、简单高效的科学计算服务。用户通过访问网页即可输入计算参数、提交任务、查看执...
关键词：高性能计算应用 超级计算环境 计算平台 
一种生物大分子自动分片程序设计技术
《科研信息化技术与应用》2016年第1期15-23,共9页邱英秋 索兵兵 张宝花 金钟 
国家自然科学基金(21203147);中国科学院信息化专项项目(XXH12503-05-06);中国科学院信息化项目专项"面向云服务的超级计算环境建设与应用"(XXH2503-02)
为了解决蛋白质等大分子无法使用量子化学的方法精确计算的难题,化学工作者们提出了多种解决方案,其中一个就是分子划片。基于已有的分子划片方法的分片原理,我们实现了一种通用的自动划片技术,能够对分子进行不同划分。这一方法不仅提...
关键词：分子划片 自动划片 并行计算机 MFCC FMO 
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