陈渊

作品数：15被引量：48H指数：4
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供职机构：湖南农业大学更多>>
发文主题：支持向量回归支持向量机地统计学位点预测定量构效关系更多>>
发文领域：生物学农业科学自动化与计算机技术理学更多>>
发文期刊：《中国农学通报》《生物化学与生物物理进展》《昆虫学报》《安徽农业科学》更多>>
所获基金：国家教育部博士点基金国家自然科学基金湖南省自然科学杰出青年基金湖南省自然科学基金更多>>
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基于最大信息系数与冗余分摊的特征选择方法被引量：1
《计算机工程》2020年第8期101-105,共5页袁哲明 杨晶晶 陈渊 
国家自然科学基金(61701177);湖南省自然科学基金(2018JJ3225);湖南省作物种质创新与资源利用国家重点实验室培育基地开放课题(18KFXM08)。
特征选择是机器学习的关键环节,通常采用最小冗余最大相关法进行特征选择,但该方法存在相关性测度与冗余性测度不可比、特征引入无法自动终止等问题。为此,提出一种基于最大信息系数(MIC)与冗余分摊策略的特征选择方法(MIC-share)。以MI...
关键词：特征选择 最大信息系数 冗余分摊 分类 支持向量机 回归 
基于统计差表与加权投票的高精度剪接位点预测
《生物化学与生物物理进展》2019年第5期496-503,共8页曾莹 陈渊 袁哲明 
国家自然科学基金(61701177);湖南省自然科学基金(2018JJ3225);湖南省教育厅科学研究项目(17A096)资助~~
基于机器学习的高精度剪接位点识别是真核生物基因组注释的关键.本文采用卡方测验确定序列窗口长度,构建卡方统计差表提取位置特征,并结合碱基二联体频次表征序列;针对剪接位点正负样本高度不均衡这一情形,构建10个正负样本均衡的支持...
关键词：剪接位点 位置特征 卡方统计差表 加权投票 支持向量机 
浅谈《R语言与生物统计学》的“慕课学习+翻转课堂”教学模式被引量：8
《教育教学论坛》2019年第3期193-194,共2页李兰芝 陈渊 易图永 
本文讨论了《生物统计学》课程的重要性、难点和关键,结合R语言教学的必要性和可行性。为最大化课堂效能,探讨了《R语言与生物统计学》的"慕课学习+翻转课堂"教学模式,分析了该课程的结构与优势,并对该课程建设面临的挑战提出了一定的...
关键词：R语言 生物统计学 慕课 翻转课堂 
融合位置特征与序列进化信息的磷酸化位点预测（英文）被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2017年第12期1118-1124,共7页谭泗桥 李钎 陈渊 彭剑 
supported by a grant from Natural Science Foundation of Hunan province(14JJ2082)~~
磷酸化是蛋白质翻译后的主要修饰,可分为激酶特异性和非激酶特异性两种类型.以非激酶特异性磷酸化位点Dou数据集为基础,本文发展了一种基于位置的卡方差表特征χ~2-pos,融合伪氨基酸序列进化信息PsePSSM表征序列,构建正负样本均衡的支...
关键词：磷酸化 预测 卡方差表特征 伪氨基酸序列进化信息 支持向量机 
基于特征选择和支持向量机的HIV-1型蛋白酶剪切位点预测
《吉林大学学报（工学版）》2017年第2期639-646,共8页袁哲明 张弘杨 陈渊 
高等学校博士学科点专项科研基金项目(20124320110002);长沙市科技计划项目(K1406018-21)
为了提高HIV-1型蛋白酶剪切位点的预测准确性,提出一种基于特征选择和支持向量机的剪切位点预测模型。首先,通过对5830个样本的HIV-1型蛋白酶剪切位点数据集进行分析,根据最小冗余最大相关理念,采用可自动终止法选择剪切位点的特征向量...
关键词：生物物理学 剪切位点预测 特征选择 最小冗余最大相关 支持向量机 
醇酚类化合物毒性的QSAR研究被引量：4
《环境科学学报》2016年第12期4490-4499,共10页邓小龙 陈渊 谭泗桥 袁哲明 
教育部博士点基金(No.20124320110002);长沙市科技计划项目(No.K1406018-21)~~
化合物毒性与描述符通常呈现为非线性关系,量子化学计算的化合物分子描述符中包含诸多无关特征与冗余特征.最大相关最小冗余(m RMR)是应用较广泛的特征选择方法,但当前的m RMR对连续型因变量不适用,且存在相关性测度与冗余性测度不可比...
关键词：最小冗余最大相关 特征选择 定量构效关系 距离相关 支持向量回归 
基于三类特征融合的O-糖基化位点预测被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2016年第7期691-698,共8页向妍 陈渊 谭泗桥 袁哲明 
高等学校博士学科点专项科研基金(20124320110002);湖南省自然科学基金(14JJ2082);长沙市科技计划项目(K1406018-21)资助
糖基化是蛋白质翻译后的主要修饰,O-糖基化的固定模式未知,高精度识别O-糖基化位点是机器学习面临的挑战性问题.以迄今最大的人O-糖基化位点Steentoft数据集为基础,本文首次提出了基于位置的卡方差表特征χ^2pos,融合伪氨基酸序列进化信...
关键词：O-糖基化位点预测 卡方差表特征 伪氨基酸序列进化信息 无方向的k间隔氨基酸对组分 加权投票 
基于支持向量回归与地统计学的农民收入预测被引量：3
《安徽农业科学》2014年第30期10759-10761,10783,共4页张弘杨 陈渊 袁哲明 
农民收入既受其自身动态时序特性的影响,又与国家政策、农产品产量、天气等多种人为因素和自然因素关系密切,是一种典型的多维时间序列数据.该研究以国民总收入、乡村人口等11个可能与农民收入相关的影响因子为自变量,农村居民家庭平均...
关键词：农民收入 预测 地统计学 多维时间序列 支持向量机 
基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率被引量：1
《物理化学学报》2014年第6期1091-1098,共8页李咏 周玮 代志军 陈渊 王志明 袁哲明 
教育部博士点基金(20124320110002);国家自然科学基金(31301388);湖南省自然科学基金(14JJ3092)资助项目~~
折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残...
关键词：蛋白质折叠 折叠速率预测 高维特征 特征筛选 支持向量回归 
三代棉铃虫幼虫发生量的非线性分析——以河北、山西等六省为例
《湖南农业科学》2013年第11期62-65,69,共5页魏丽娟 李咏 陈渊 袁哲明 
湖南省杰出青年科学基金项目(10JJ1005);教育部博士点基金项目(20124320110002)
害虫发生量分析是害虫预测预报与综合防治的前提。在分析棉铃虫二代成虫来源及产卵去向的基础上,区分省份与年份,以我国6省1997~2006年玉米等4种非棉花寄主上三代棉铃虫幼虫密度为响应变量,选取棉花寄主上的二代虫卵密度、Bt棉种植面积...
关键词：棉铃虫 发生量 支持向量回归 
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