陈越

作品数：4被引量：8H指数：2
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供职机构：复旦大学更多>>
发文主题：数据挖掘DNA序列序列挖掘算法多支持度前缀树更多>>
发文领域：自动化与计算机技术医药卫生环境科学与工程理学更多>>
发文期刊：《计算机研究与发展》《计算机工程》《计算机科学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
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一种基于前缀树的增量序列挖掘算法被引量：2
《计算机工程》2007年第19期69-71,共3页张坤 陈越 朱扬勇 
国家"973"计划基金资助重点项目(2005CB321905)
在已有模式的基础上,该文挖掘出了新的模式,减少了挖掘原始数据库次数,指出了IncSpan+算法存在的问题,说明了基于半频繁模式的增量挖掘算法的缺陷,提出了一种增量序列模式挖掘算法。该算法构造了前缀树表示序列模式,并用广度剪枝和深度...
关键词：增量序列模式挖掘 广度剪枝 深度剪枝 前缀树 
ProFaM:一个蛋白质序列家族挖掘算法被引量：2
《计算机研究与发展》2007年第7期1160-1168,共9页熊赟 陈越 朱扬勇 
国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2006AA02Z329);国家自然科学基金项目(60573093)
有效分析蛋白质家族是生物信息学的一项重要挑战,聚类成为解决这一问题的主要途径之一.基于传统序列比对方法定义蛋白质序列间相似关系时,假设了同源片断间的邻接保守性,与遗传重组相冲突.为更好地识别蛋白质家族,提出了一种蛋白质序列...
关键词：蛋白质序列 蛋白质家族 序列模式 聚类 数据挖掘 生物信息学 
Cla_Factor:一个基于支持向量机的人类转录因子分类方法
《计算机研究与发展》2007年第z3期279-283,共6页周强 陈越 熊赟 朱扬勇 
国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2006AA02Z329);国家自然科学基金项目(60573093)
转录因子识别对于理解转录机制起着重要作用,转录因子根据DNA绑定域的结构可以分为四大类.随着数据库中新蛋白序列的快速增加,设计一个高通量、高准确率的分类器来预测新蛋白是否转录因子及其类别是非常重要的,提出了一个基于支持向量...
关键词：转录因子 支持向量机 蛋白质功能域 分类 
DnaReSM:一个基于多支持度的DNA重复序列挖掘算法被引量：4
《计算机科学》2007年第2期211-212,F0004,共3页熊赟 陈越 朱扬勇 
国家自然科学基金项目(60573093)
DNA序列分析研究是生物信息学的重要内容之一。基因组的基因相关区域和基因外区域中含有大量重复序列,尽管目前大多数重复序列的功能还没能肯定,但它们在遗传分析中已起重要作用。挖掘DNA重复序列成为DNA序列分析的关键。自底向上的挖...
关键词：数据挖掘 DNA序列 重复序列 序列模式 
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