崔颖

作品数:6被引量:3H指数:1
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基于支持向量机的蛋白质相互作用识别
《生物信息学》2009年第4期255-257,共3页陆林英 魏雅卓 崔颖 孙平平 马雅楠 马志强 
教育部应用统计重点实验室资助
支持向量机(SVM)是广泛应用于各个领域的分类算法,包括生物信息学。本研究应用SVM作为蛋白质相互作用的分类算法,所用蛋白质相互作用数据下载于墨尼黑生物信息学中心的酿酒酵母数据集,包含有6 736条蛋白质,其中相互作用的有4 837对,不...
关键词:蛋白质相互作用 SVM 序列主要结构 
改进的系统发育谱算法在蛋白质功能注释中的应用
《生物信息学》2009年第1期44-46,51,共4页马雅楠 孙平平 魏雅卓 陆林英 崔颖 马志强 
教育部应用统计重点实验室资助
系统发育谱方法是目前研究较多的一种基于非同源性的生物大分子功能注释方法。针对现有算法存在的一些缺陷,从两个方面对该方法做了改进:一是构造基于权重的系统发育谱;二是采用改进的聚类算法对发育谱的相似性进行分析。从NCBI上下载10...
关键词:系统发育谱 参照基因组 权值 聚类 
遗传算法在转录因子结合位点识别中的应用
《生物信息学》2009年第1期72-74,77,共4页马志强 魏雅卓 崔颖 马雅楠 孙平平 陆林英 
教育部应用统计重点实验室和东北师范大学青年自然科学基金项目(20061003)资助
遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法。将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif序列与待测序列的比对问题进行编码,将其转化成搜索空间中...
关键词:遗传算法(GA) 转录因子结合位点(TFBS) 一致性序列模型 
基因非编码区与转录调控元件的识别研究被引量:3
《生物信息学》2008年第4期187-189,共3页马志强 崔颖 马雅楠 陆林英 魏雅卓 孙平平 
国家自然科学基金;项目号为(90304010)
随着后基因组时代的到来,非编码区的研究已经成为科学家面临的挑战,对基因非编码区的一个主要研究方向就是对调控元件的研究。识别转录调控元件是理解基因转录机制和表达模式的关键。较全面地介绍了基因非编码区以及调控元件,包括功能...
关键词:非编码区 调控元件 识别算法 数据库 
基于统计建模的系统发育谱方法研究
《生物信息学》2008年第4期176-177,182,共3页马志强 马雅楠 孙平平 魏雅卓 陆林英 崔颖 周春光 
教育部应用统计重点实验室资助
系统发育谱算法作为一种有效的大规模基因组功能注释方法,已经被成功的应用到原核生物基因组的功能注释中去。通过对系统发育谱方法中的一个关键环节——相似谱的聚类进行分析,提出了一种基于统计建模的方法来对相似的系统发育谱进行聚...
关键词:系统发育谱 功能相关性 参照基因组 统计建模 聚类 
改进的K-mean聚类算法在基因系统发育谱分析中的应用
《生物信息学》2008年第2期82-84,共3页马志强 孙平平 马雅楠 魏雅卓 陆林英 崔颖 周春光 
教育部应用统计重点实验室和东北师大青年自然科学基金(20061003)资助
简要介绍了系统发育谱法的原理,着重阐述了K-mean聚类算法在对基因系统发育谱分析中的改进,并与传统的K-mean聚类算法进行比较。实验结果表明,改进的K-mean聚类算法在运用系统发育谱法进行基因功能注释上是快而有效的,可以快速收敛到近...
关键词:系统发育谱 基因功能注释 K—mean聚类 
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