马闯

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供职机构:华中科技大学生命科学与技术学院更多>>
发文主题:启动子预测支持向量机真核生物基因真核生物MIRNA更多>>
发文领域:生物学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《武汉大学学报(理学版)》《中南林业科技大学学报》《华中科技大学学报(自然科学版)》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划国家大学生创新性实验计划教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
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黑腹果蝇miRNA前体的预测
《中南林业科技大学学报》2010年第6期127-131,共5页马闯 胡星驰 童潘 黄慧艳 
国家自然科学基金重大研究计划项目(90608020);科技部国家科技基础条件平台建设专项"人类遗传疾病相关基因的生物信息学分析与预测"(2005DKA64001);生物信息学网络计算应用系统-基因组结构自动注释系统及其应用项目;国家大学生创新实验计划项目
MicroRNA(miRNA)是一类长度约23 nt的内源性单链小分子RNA,它通过与靶标结合位点区域的碱基互补结合来调控靶标基因的表达。通过寻找潜在的miRNA结合位点预测miRNA前体,首先在黑腹果蝇mRNA的3’UTR区域中搜寻潜在的miRNA结合位点,然后...
关键词:生命科学与技术 黑腹果蝇 MIRNA 靶标基因 结合位点 
基于多软件融合方法的真核生物基因启动子预测
《武汉大学学报(理学版)》2008年第6期757-762,共6页马闯 蹇易 黄慧艳 
国家自然科学基金重大研究计划项目(90608020);科技部国家科技基础条件平台建设专项项目;国家大学生创新实验计划支持项目
基于多个软件的预测结果,提出了一种融合方法(ComPromoter)提高真核生物基因启动子的预测精度.ComPromoter以ProKey、FirstEF和Eponine等软件对启动子的预测结果为基础,融合了可用于启动子识别的多个特征(包括ProKey预测结果中真阳性和...
关键词:真核生物 启动子预测 支持向量机 
水稻基因结构分析与预测建模
《华中科技大学学报(自然科学版)》2008年第4期62-64,共3页周艳红 朱建丽 马闯 程遥 
国家自然科学基金资助项目(90203011;90608020);教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET-060651);国家科技基础条件平台资助项目(2005DKA64001)
将水稻基因结构预测问题划分为基因级、元件级和特征级等多个层次上的一系列较简单子问题,分析了各特征与序列C+G含量之间的依赖关系,通过采用从简单到复杂逐级优化的策略建立了不同序列C+G含量的水稻基因结构模型,设计了基因结构寻优...
关键词:基因结构预测 水稻基因组 C+G含量 多级优化 
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