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检 索 范 例 :范例一: (K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 范例二:J=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT M=Visual
作 者:佟平[1,2] 高金燕[3] 陈红兵[1,2] 李欣[1,2] 简姗[1,2] 张银[1,2]
机构地区:[1]南昌大学食品科学与技术国家重点实验室,江西南昌330047 [2]南昌大学中德联合研究院,江西南昌330047 [3]南昌大学生命科学与食品工程学院食品系,江西南昌330047
出 处:《食品科学》2011年第17期225-229,共5页Food Science
基 金:国家自然科学基金项目(31060215);教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-08-0704);南昌大学食品科学与技术国家重点实验室目标导向项目(SKLF-MB-201002)
摘 要:为预测鸡蛋过敏原卵转铁蛋白的B细胞线性表位,以GenBank中提供的鸡蛋卵转铁蛋白氨基酸序列为基础,分别用Jameson-Wolf法、Kyte-Doolittle法、Emini法和Karplus-Schulz法对鸡蛋卵转铁蛋白的抗原指数、亲水性、蛋白表面可及性及柔韧性进行预测,并用Chou-Fasman法和Deleage-Roux法预测其二级结构,综合分析以上预测结果,得出鸡蛋卵转铁蛋白可能的B细胞线性表位区。结果表明鸡蛋卵转铁蛋白存在7个潜在表位区,包括蛋白第174~181、215~222、231~240、288~294、332~344、415~429、547~555位可能为B细胞线性表位优势区域。该结果将有助于鸡蛋卵转铁蛋白B细胞表位的进一步精确定位。In order to predict B-cell linear epitopes of egg allergen ovotransferrin(OVT),the antigen index,hydrophilicity,and surface accessibility and flexibility of egg OVT were predicted using Jameson-Wolf,Kyte-Doolittle,Emini and Karplus-Schulz methods,respectively.The secondary structure of OVT was predicted by Chou-Fasman and Deleage-Roux methods based on the amino acid sequence of egg OVT derived from Genbank.Based on the above comprehensive analysis,7 possible B-cell linear epitope candidates in egg OVT were predicted to locate in the regions of 174-181,215-222,231-240,288-294,332-344,415-429 and 547-555.These results are useful for fine mapping of B-cell epitopes in egg OVT.
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