国家自然科学基金(39770418)

作品数:11被引量:10H指数:2
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相关作者:刘次全黄京飞柳树群石秀凡谢君更多>>
相关机构:中国科学院复旦大学中山大学云南大学更多>>
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以Hoogsteen氢键形成的PNA(T)·DNA(AT)三螺旋更稳定被引量:2
《科学通报》2003年第20期2141-2144,共4页谢君 刘次全 屈良鹄 
国家自然科学基金(批准号:39770418,39570395);国家教育委员会博士后基金资助项目.
肽核酸(peptide nucleic acid,PNA)是一种核酸类似物,它的骨架以假肽键代替了原来的糖-磷酸骨架.PNA结合到核酸双螺旋上形成三螺旋的过程是PNA作用于核酸双螺旋最初也是最重要的一步.但到目前为止,由于缺乏PNA·2DNA三螺旋的晶体结构数...
关键词:肽核酸 三链结构 稳定性 分子动力学 氢键配对模式 
Dynamics of RNA with A6 bulge loop被引量:1
《Chinese Science Bulletin》2002年第12期1003-1006,共4页LIANG Chongrong & LIU CiquanKey Laboratory of Cellular & Molecular Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China Biology Department, Jinan University, Guangzhou 510630, China 
This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 39770418) ;the Knowledge Innovation Program of the Chinese Academy of Sciences (Grant No. KJCX1-08).
In order to understand the behavior of RNAs with large bulges in solution, molecular dynamics was performed on the RNA molecule in water with A6 bulge. The result of simulation showed that nonstacked conformation is t...
关键词:RNA large BULGE CONFORMATION BEND angle. 
The topological configuration and conformational analysis of mRNA in translation被引量:2
《Chinese Science Bulletin》2002年第5期384-389,共6页LIU Shuqun & LIU CiquanKunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China Modern Biological Center, Yunnan University, Kunming 650091, China 
This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 39770418);the Knowledge Innovation Program of the Chinese Academy of Sciences (Grant No. KJCX 1-08).
The theoretical model construction of mRNA hairpin structure and single-stranded structure as well as the simulation studies on RNA structure determined by the X-ray crystal diffraction and nuclear magnetic resonance ...
关键词:HAIRPIN structure of MRNA TOPOLOGICAL CONFIGURATION of single-stranded mRNA. 
RNA A_6膨胀环的动力学特征
《科学通报》2002年第6期431-434,共4页梁宠荣 刘次全 梁宠荣 
本工作为国家自然科学基金(批准号:39770418;39570395);中国科学院知识创新工程(批准号:KJCX1-08)资助项目。
通过对RNA A6膨胀环在水溶液中的动力学模拟发现,在A6膨胀环中,环区构象主要以非堆积构象为主,环区具有较大的构象柔性,膨胀环区链的构象波动对已形成的RNA分子弯折的影响不大,弯折角只是在小范围内变动,提示作为全局结构,带大尺寸膨胀...
关键词:RNA A6膨胀环 动力学特征 大尺寸膨胀环 构象 动力学模拟 弯折角 发夹结构 
翻译过程中mRNA的拓扑形态及其链构象分析
《科学通报》2002年第1期25-30,共6页柳树群 刘次全 
国家自然科学基金资助项目(批准号:39770418);中国科学院知识创新工程重大前沿项目(编号:KJCX 1-08).
对mRNA发夹结构和单链结构的理论模型构建,以及基于对X射线晶体衍射和NMR实验数据的模拟研究显示,在翻译过程中,核糖体上mRNA解折叠后的单链拓扑形态,与mRNA本身的发夹结构密切相关,均呈现为不同程度的螺旋与卷曲...
关键词:mRNA发夹结构 单链mRNA拓扑形态 翻译过程 发夹结构 链构象 解折叠 
A possible mode of the specific recognition of nucleic acids by proteins
《Chinese Science Bulletin》2001年第11期930-934,共5页LI Xuqing & LIU CiquanDepartment of Computer Science, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650041, China Laboratory of Cellular and Molecular Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China Yunnan Observatory, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650011, China 4. Modern Biological Center, Yunnan University, Kunming 650091, China 
the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 39770418).
Seven sets of protein target sites, which occur in several gene promoters, have been analyzed. The results suggest that there is a possible mode of specific recognition of double-helical nucleic acids by proteins. Thi...
关键词:protein nucleic ACIDS RECOGNITION base spatial pattern (BSP) target sites. 
蛋白质内含子演化分析被引量:1
《生物化学与生物物理进展》2001年第3期396-399,共4页谢君 黄京飞 石秀凡 邵丹 柳树群 梁宠荣 刘次全 
国家自然科学基金资助项目 (39770 4 1 8)&&
蛋白质内含子是能够自我剪切的一段多肽链 .它在生物三大系统中都存在 ,但它的分布在各物种间以及蛋白质种类之间极不均衡 .蛋白质内含子的演化和扩散也因此引起了人们的极大兴趣 .经过系统搜索 ,从已知的核酸序列中找到 6 9个经典的蛋...
关键词:蛋白质内含子 演化 亲缘关系 同源蛋白质内含子 
蛋白质对核酸专一性识别的一种可能的方式
《科学通报》2000年第22期2413-2418,共6页李许卿 刘次全 
国家自然科学基金!资助项目(批准号: 39770418)
对来自几种基因启动子上的7组蛋白质结合位点进行了分析, 暗示着蛋白质对双螺旋核酸专一性识别的一种可能方式. 这种识别方式涉及双链DNA的一种特别的拓扑性质, 称为DNA片段的碱基空间模式(base spatial pattern, BSP), 它是仅由双链DN...
关键词:蛋白质 识别 碱基空间模式 双螺旋核酸 专一性 
蛋白质内含子的特征序列分析及模体修正被引量:1
《科学通报》2000年第23期2525-2530,共6页谢君 黄京飞 石秀凡 刘次全 
国家自然科学基金资助项目!(批准号: 39770418; 39570395).
自从1990年在Saccharomydes cerevisiae 腺苷三磷酸核苷酸酶中发现第1个蛋白质内含子(Sce VMA)后, 蛋白质内含子的数量在不断增多. 分析这些新的蛋白质内含子序列, 对正确认识它们的序列特征是非常必要的. 通过系统搜索核酸以及蛋白质...
关键词:蛋白内含子 分布 插入位点 序列特征 
抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究被引量:1
《生物化学与生物物理进展》2000年第3期283-286,共4页杨洁 刘次全 public.km.yn.cn 
国家自然科学基金资助项目 !(3 9770 41 8)
在IRISIndigo2 (SGI公司 )工作站上 ,利用InsightⅡ /MSI软件包 ,以TAT三链DNA为模板 ,采用同源模建的方法 ,分别建立起两个含 2 1nt的脱氧寡核苷酸CP1(G3TG2TGT2G5TG2TGT )和CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)的三维结构 .采用分子力学方法进行...
关键词:三链DNA 反基因策略 同源模建 结构稳定性 HBV 
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