石秀凡

作品数：26被引量：137H指数：5
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供职机构：中国科学院昆明动物研究所更多>>
发文主题：同义密码子内含子蛋白质结构蛋白质二级结构蛋白质内含子更多>>
发文领域：生物学更多>>
发文期刊：《生物化学与生物物理进展》《Zoological Research》《科学通报》《生物物理学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划教育部科学技术研究重点项目更多>>
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酵母内含子在基因序列中的分布对基因转录效率的影响被引量：10
《生物化学与生物物理进展》2003年第6期945-949,共5页张静 石秀凡 杨恒芬 
国家自然科学基金资助项目( 30 36 0 0 27);云南大学理 (工 )科校级科研项目资助 ( 2 0 0 2T0 0 9XX )~~
对酵母中高效转录和低效转录基因内含子序列寡核苷酸使用情况的对照分析 ,显示两类内含子的序列结构有差异 ,并且高效转录基因内含子序列含有较多潜在的转录因子结合位点 ,由此推测内含子可能参与基因转录的调控 .这个结论有待更多的数...
关键词：酵母 基因转录频率 内含子长度 内含子位置 基因序列 基因转录 
酵母基因中转录正调控内含子序列特征的统计分析被引量：11
《生物化学与生物物理进展》2003年第2期231-238,共8页张静 石秀凡 
教育部科研重点基金资助项目 (0 0 2 46)~~
大量实验研究显示 ,真核基因的许多内含子具有调控转录的功能 ,但是对此问题尚缺乏全面的研究 .观察一些酵母基因的转录频率与基因的内含子序列后 ,发现一个值得注意的现象 :转录频率高的基因内含子序列一般都比较长 ,而转录频率低的基...
关键词：酵母基因 转录 正调控 内含子 序列特征 基因转录频率 寡核苷酸出现频率 
人类基因同义密码子偏好的特征以及与基因GC含量的关系被引量：63
《生物化学与生物物理进展》2002年第3期411-414,共4页石秀凡 黄京飞 柳树群 刘次全 
对人类的 72 8个基因 ,按其编码区中GC的含量分成四组 (从GC <0 4 3到GC >0 5 8) ,分别考察了这四组样本对同义密码子偏好的特征 ,发现在全部样本中都呈现NTG (N代表四种碱基中的任一种 )特受偏爱和NCG尽量避免的特征 .基因环境中GC...
关键词：C结尾密码子 NTG密码子 GC含量 人类基因 同义密码子偏好 
不具有3-碱基周期性的编码序列初探被引量：7
《生物化学与生物物理进展》2002年第2期267-272,共6页张静 石秀凡 
国家教育部科研重点基金资助项目 ( 0 0 2 46 )~~
对 12 0个较短编码序列 (<12 0 0bp)的Fourier频谱进行分析表明 ,3 碱基周期性在短编码序列中并不是绝对存在的 .统计分析提示 ,编码序列有无 3 碱基周期性与序列的碱基组成和分布、所编码蛋白质氨基酸的选用和顺序以及同义密码子的使...
关键词：编码序列 FOURIER分析 3-碱基周期性 非3-碱基周期性 
Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号被引量：3
《生物化学与生物物理进展》2001年第4期523-527,共5页张静 石秀凡 刘次全 
形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷 (poly (A) )作用涉及前体mRNA下游的三个元件 :效率元件(EE)、定位元件 (PE)以及实际的剪切和 poly (A)作用位点 ,实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成 .对 180个Yeast基因下游 (终止密码子后 2...
关键词：Yeast基因 多聚腺苷作用信号 MRNA二级结构 蛋白质合成 
蛋白质内含子演化分析被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2001年第3期396-399,共4页谢君 黄京飞 石秀凡 邵丹 柳树群 梁宠荣 刘次全 
国家自然科学基金资助项目 (39770 4 1 8)&&
蛋白质内含子是能够自我剪切的一段多肽链 .它在生物三大系统中都存在 ,但它的分布在各物种间以及蛋白质种类之间极不均衡 .蛋白质内含子的演化和扩散也因此引起了人们的极大兴趣 .经过系统搜索 ,从已知的核酸序列中找到 6 9个经典的蛋...
关键词：蛋白质内含子 演化 亲缘关系 同源蛋白质内含子 
大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构被引量：6
《生物物理学报》2001年第1期174-180,共7页张静 顾宝洪 石秀凡 刘次全 
对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明 ,E.c...
关键词：蛋白质二级结构 MRNA 密码子 前后碱基 使用偏向 同义密码子 大肠杆菌 基因 
蛋白质内含子的特征、转移和演化被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2001年第2期184-187,共4页谢君 刘次全 黄京飞 石秀凡 邵丹 
自从 1990年发现第一个蛋白质内含子 ,就引起了有关专家的高度重视 ,蛋白质内含子不仅在理论上丰富了遗传信息翻译后加工的内容 ,而且实践上在蛋白质纯化方面有着广泛的应用前景 .鉴于蛋白质内含子的不断发现 ,有必要对其在自我剪切 ,传...
关键词：蛋白质内含子 自我剪切 传递 演化 
人类基因中同义密码子的偏好与密码子-反密码子间的结合强度密切相关吗?被引量：39
《科学通报》2000年第23期2520-2525,共6页石秀凡 黄京飞 梁宠荣 柳树群 谢君 刘次全 
国家自然科学基金资助项目!(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目.
分析了78个人类基因(19 967个密码子)中同义密码子的偏好使用情况, 计算了同义密码子的相对使用度和各种二核苷酸在密码子2,3位和3,4位的相对出现频率. 同时计算了密码子-反密码子碱基以Watson-Crick 配对时的堆积能. 结果显示人类基因...
关键词：密码子偏好 同义密码子 人类基因 结合强度 密码子-反密码子 
蛋白质内含子的特征序列分析及模体修正被引量：1
《科学通报》2000年第23期2525-2530,共6页谢君 黄京飞 石秀凡 刘次全 
国家自然科学基金资助项目!(批准号: 39770418; 39570395).
自从1990年在Saccharomydes cerevisiae 腺苷三磷酸核苷酸酶中发现第1个蛋白质内含子(Sce VMA)后, 蛋白质内含子的数量在不断增多. 分析这些新的蛋白质内含子序列, 对正确认识它们的序列特征是非常必要的. 通过系统搜索核酸以及蛋白质...
关键词：蛋白内含子 分布 插入位点 序列特征 
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