国家高技术研究发展计划(2006AA02Z190)

作品数：20被引量：52H指数：4
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相关作者：王翼飞彭新俊于彬周文刘焕更多>>
相关机构：上海大学青岛科技大学上海师范大学中国科学院上海生命科学研究院更多>>
相关期刊：《数学的实践与认识》《模式识别与人工智能》《科学技术与工程》《遗传》更多>>
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小波变换在膜蛋白跨膜螺旋区段预测中的应用被引量：1
《数学的实践与认识》2010年第1期115-121,共7页于彬 
国家863高技术研究发展计划项目(2006AA02Z190);山东省教育厅科研基金项目(J06P04)
膜蛋白跨膜螺旋区段的预测是当前生物信息学研究的一个重要领域.提出了一种基于离散小波变换的预测膜蛋白跨膜螺旋区段数目和位置的方法.以PDB代码为1KQG的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程.为了测试...
关键词：离散小波变换 膜蛋白 跨膜螺旋区段 疏水性 
基于支持向量机的肿瘤基因数据挖掘被引量：1
《科学技术与工程》2009年第24期7370-7372,共3页于彬 
国家863高技术研究发展计划(2006AA02Z190);山东省教育厅科研基金(J06P04)资助
针对两种类别的肿瘤分类问题,首先运用信噪比方法筛选出表达水平发生显著性变化的特征基因,然后采用支持向量机作为分类器进行肿瘤分类,通过对两种类别的白血病DNA微阵列数据进行计算,达到了97.1%的分类准确度。
关键词：DNA微阵列 支持向量机 分类 
改进的τ-leap算法在生化反应系统随机模拟中的应用被引量：3
《应用科学学报》2009年第3期266-271,共6页刘焕 彭新俊 周文 王翼飞 
国家自然科学基金(N0.30871341);国家"863"高技术研究发展计划基金(No.2006AA02Z190)项目
提出了一种τ-选择策略,有效地反映了生化反应系统中分子数目的改变.并由此提出了改进的τ-leap(improvedτ-leap)算法,该算法对生化反应系统的随机模拟更为有效和实用.并以两个生化反应系统模型为例,分别用精确的SSA算法、改进的τ-lea...
关键词：随机模拟算法 τ-选择策略 τ-leap算法 生化反应系统 
基于禁忌搜索和遗传算法的智能化双聚类方法被引量：2
《应用科学学报》2009年第3期282-287,共6页吕玉龙 沈青松 石铁流 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30871341);国家“863”高技术研究发展计划基金(No.2006AA02Z190);上海市教委重点学科建设基金(No.J50101);上海市重点学科基金(No.S30104)资助项目
在基因表达数据中寻找重要双聚簇的难度随数据规模的增长而增长.该文讨论一种智能化的双聚类方法,充分利用禁忌搜索和遗传算法自身的爬山能力,很好地平衡了区域搜索和全局搜索的关系,并使输出结果不依赖于预先设定的阐值.实验表明,该方...
关键词：遗传算法 禁忌搜索 双聚类 基因表达数据 
双模糊渐进直推式支持向量机算法被引量：9
《模式识别与人工智能》2009年第4期560-566,共7页彭新俊 王翼飞 
国家自然科学基金项目(No.30571059);国家863计划项目(No.2006AA02Z190)资助
直推式支持向量机(TSVM)是支持向量机与直推式学习相结合的重要算法.文中为TSVM中的临时标签样本引入双模糊隶属度以及样本修剪策略,构建一种双模糊渐进直推式支持向量机(BFPTSVM)算法.该算法可有效降低TSVM的计算复杂度及核存储量.模...
关键词：直推式支持向量机(TSVM) 直推式学习 双模糊隶属度 双模糊支持向量机 样本修剪策略 
拟南芥和水稻SET结构域基因家族全基因组鉴定、分类和表达被引量：9
《遗传》2009年第2期186-198,共13页张亮生 马成荣 戢茜 王翼飞 
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(编号:2006AA02Z190);上海市重点学科建设项目(编号:J50101)资助
SET(Su(var),Enhancer of zeste(E(z)),and Trithorax)结构域基因家族是一组含有保守SET结构域的蛋白的统称,它们参与蛋白甲基化,影响染色体结构,并且调控基因表达,在植物发育中起着重要的作用。分析拟南芥和水稻中SET结构域基因家族进...
关键词：拟南芥 水稻 SET结构域基因 进化分析 
总间隔v-支持向量机及其几何问题被引量：10
《模式识别与人工智能》2009年第1期8-16,共9页彭新俊 王翼飞 
国家自然科学基金项目(No.30571059);国家863计划项目(No.2006AA02Z190)资助
提出总间隔v-支持向量机(TM-v-SVM),该算法可取得比v-SVM更好的理论分类性能.研究表明TM-v-SVM等价于求解特征空间中的两个压缩凸包的最近点对.讨论压缩凸包的相关性质,并给出对应的几何算法.数值模拟实验表明TM-v-SVM和对应的几何算法...
关键词：支持向量机(SVM) 总间隔支持向量机(TM—SVM) 总间隔v-支持向量机(TM-v-SVM) 压缩凸包(CCH) 几何算法 
基于信噪比的蛋白质相互作用的预测被引量：4
《上海大学学报（自然科学版）》2008年第6期604-610,共7页冯铁男 江浩 王翼飞 
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA02Z190)
蛋白质间的相互作用在生命体中扮演着关键的角色.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质间的相互作用,并改用信噪比为判别参数.此判别参数与之前的判别参数——峰值相比,在保证较高预测精度的基础上,还可以很好地区分阳性数据和随...
关键词：共鸣识别模型 离散小波变换 随机数据检测 酵母蛋白质 信噪比 
DC-CLUSTER软件的设计与开发
《微计算机信息》2008年第14期56-58,227,共4页李冯 沈称意 王翼飞 
国家自然科学基金(30571059);863项目(2006AA02Z190)
目前,基因芯片的信息挖掘已成为生物信息学研究的热点之一,引起了广泛的重视。特别是高密度的DNA微阵列,由于它荷载了成千上万个DNA片段,可用于高通量的生物学检测,其开发和利用已进入商业化阶段,而其信息处理和信息挖掘更受关注。本文...
关键词：生物信息学 基因芯片 聚类分析 差异基因 
改进的概率权重随机模拟算法被引量：4
《应用科学学报》2008年第4期397-402,共6页周文 刘焕 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30571059);国家“863”高技术研究发展计划(No.2006AA02Z190)资助项目
提出了一种改进的概率权重随机模拟算法(IPW SSA),该算法自适应地确定权重因子,对反应率常数跨度很大的系统的化学反应动力学的随机模拟更为有效、实用.文中以两个化学反应系统为例,分别使用原始的和改进的概率权重随机模拟算法对其进...
关键词：随机模拟算法 概率权重 化学反应系统 
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