国家高技术研究发展计划(2002AA231011)

作品数：6被引量：31H指数：3
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相关作者：朱扬勇邓绪斌曹顺良李亦学张忠平更多>>
相关机构：复旦大学上海生物信息技术研究中心浙江财经学院更多>>
相关期刊：《计算机研究与发展》《计算机工程》《自然科学进展》《模式识别与人工智能》更多>>
相关主题：GENE_ONTOLOGY数据仓库正则表达式数据抽取GENE更多>>
相关领域：自动化与计算机技术文化科学更多>>
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VI-DE:DE-Wrapper的可视化编辑调试环境
《计算机工程》2006年第8期107-109,203,共4页李岱 邓绪斌 朱扬勇 
国家"863"计划基金资助项目(2002AA231011);上海市重大科技项目(02DJ14013)
介绍了VI-DE,数据抽取工具DE-Wrapper的可视化编辑调试环境。DE-Wrapper使用扩展正则表达式(ERE)描述数据源结构,根据该ERE构造数据抽取树(DE-树),然后根据DE-树生成相应的关系数据库模式,最后抽取数据。VI-DE整合了DE-Wrapper的工作流...
关键词：数据抽取 扩展正则表达式 DE-Wrapper DE-树 
基于语义路径覆盖的Gene Ontology术语间语义相似性度量方法被引量：12
《自然科学进展》2006年第7期916-920,共5页李荣 曹顺良 李园园 谭灏 朱扬勇 钟扬 李亦学 
国家"八六三"计划项目(2002AA231011);上海市科委重大项目(02DJ14013)资助
进行GO(gene ontology)语义相似性度量是解决生物学数据集成中语义异构问题的重要方法。传统方法主要是基于距离的度量和基于信息量的度量。文中提出了一种基于语义路径覆盖的度量方法,并实现了其中Combine算法。该算法首先计算出每个...
关键词：GENE ONTOLOGY 语义相似性度量 信息量 
基于与或树的正则表达式有害二义性检查算法被引量：2
《模式识别与人工智能》2006年第2期173-178,共6页邓绪斌 朱扬勇 
国家863高科技研究发展计划项目(No.2002AA231011);上海市重大科技项目(No.02DJ14013)资助
在构造面向应用的正则表达式(RE)过程中,引入有益二义性可简化 RE 构造,而将有害二义性遗留在 RE中会危害匹配结果的正确性.为区别对待这两种二义性,基于与或树提出一种检查和定位 RE 中有害二义性的算法.该算法可减轻 RE 调试的工作量...
关键词：正则表达式(RE) 匹配 二义性 与或树 
ReDE:一个基于正则表达式的生物数据抽取方法被引量：8
《计算机研究与发展》2005年第12期2184-2191,共8页邓绪斌 朱扬勇 
国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2002AA231011);上海市重大科技基金项目(02DJ14013)
从异构生物数据源抽取数据,建立查询分析平台是目前研究的热点,而抽取过程会涉及大量相互依赖的元数据,充分利用这种依赖关系可降低维护工作量·基于正则表达式(RE)提出了ReDE抽取方法:通过围绕RE组建立分析树,设计了基于RE的关系数据...
关键词：生物数据源 数据抽取 元数据 正则表达式 抽取算法 
生物语义相似性在数据仓库中的应用与实现被引量：1
《计算机应用与软件》2005年第11期5-7,共3页夏燕 张忠平 朱扬勇 
国家‘863’高技术研究发展计划(编号:2002AA231011);上海市重大科技项目(编号:02DJ14013)的支持
通过有效手段从整合的异构生物信息资源中获取高质量的生物数据,能够为生物信息的分析和挖掘提供强有力的支持。本文基于B ioDW———一个整合的生物信息数据仓库系统,以Gene Ontology作为语义模型,应用信息的语义相似度计算方法,获取...
关键词：生物语义相似性 数据仓库 生物信息资源 数据挖掘 生物特征 
Gene Ontology在生物数据整合中的应用被引量：8
《计算机工程》2005年第2期57-58,76,共3页夏燕 张忠平 曹顺良 朱扬勇 李亦学 
国家"863"计划基金资助项目(2002AA231011);上海市重大科技资助项目(02DJ14013)
异构数据的高效整合,在生物数据呈爆炸性增长、生物数据库复杂度不断增加的今天,具有重要的理论价值和实际意义。该文基于BioDW——一个整合的生物信息学数据仓库平台,利用统一的GeneOntology语义模型,建立异构数据库之间的语义链接,在...
关键词：生物 整合问题 实际 检索 数据整合 层次 联系 异构数据库 语义模型 数据仓库 
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