国家自然科学基金(10974008)

作品数:3被引量:8H指数:2
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相关机构:北京工业大学乐山师范学院华南农业大学清华大学更多>>
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蛋白质-蛋白质分子对接方法中分子柔性处理与近天然结构筛选的研究被引量:2
《生物物理学报》2012年第1期15-22,共8页杨峰 曹立彬 龚新奇 常珊 陈慰祖 王存新 李春华 
国家自然科学基金项目(10974008);北京市自然科学基金项目(4102006);教育部博士点基金项目(200800050003);科技部国际科技合作项目(2010DFA31710);北京市教委科技创新平台-自然基础研究基金资助项目~~
蛋白质-蛋白质分子对接方法是研究蛋白质分子间相互作用与识别的重要理论方法。该方法主要涉及复合物结合模式的构象搜索和近天然结构的筛选两个问题。在构象搜索中,分子柔性的处理是重点也是难点,围绕这一问题,近年来提出了许多新的方...
关键词:蛋白质-蛋白质分子对接 分子柔性处理 结合位点信息 结构聚类 打分函数 
病毒末端DNA与不同长度HIV-1整合酶四聚体的对接研究(英文)被引量:3
《生物物理学报》2010年第10期902-906,共5页柯国涛 李平 胡建平 谭建军 陈慰祖 王存新 
supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(10974008);"973" Program(2009CB930200);Beijing Natural Science Foundation(5072002 and 7082006);Research Fund for the Doctorate Program of Higher Education of China(200800050003);Research Fund for the Doctorate Program(X0015001200801)~~
整合酶(integrase,IN)是HIV病毒复制周期中的一个重要酶,一般认为,IN是以四聚体形式发挥其生物活性。本文用DOT软件包研究了IN四聚体与8个不同长度病毒末端DNA的结合模式,以及病毒DNA长度对二者识别的影响。结果表明,IN有3个DNA结合区域...
关键词:分子对接 HIV-1整合酶 DNA 
Network analysis of protein-protein interaction被引量:3
《Chinese Science Bulletin》2010年第9期814-822,共9页Shan Chang XinQi Gong Xiong Jiao ChunHua Li WeiZu Chen CunXin Wang 
supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 20773006, 30670497, 10974008);Beijing Natural Science Foundation (Grant No. 4102006) ;Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education (Grant No. 200800050003)
Residue networks are constructed by defining the residues as the vertices and atom contacts between them as the edges. The residue network of a protein complex is divided into two types of networks, i.e. the hydrophob...
关键词:interface CHARACTERISTIC PATH LENGTH RESIDUE network SCORING FUNCTION 
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