《生物信息学》

作品数：1096被引量：2736H指数：19
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《生物信息学》
主办单位：哈尔滨工业大学
最新期次：2025年1期更多>>
发文主题：生物信息学生物信息学分析基因支持向量机蛋白质更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术医药卫生农业科学更多>>
发文作者：郭政刘毅慧李晓琴王立群徐德昌更多>>
发文机构：哈尔滨工业大学哈尔滨医科大学东北农业大学江南大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划黑龙江省自然科学基金更多>>
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颞下颌关节PVNS和RA共病机制及潜在治疗靶点的初步研究被引量：1
《生物信息学》2025年第1期71-80,共10页李晨曦 石婕 魏巍 李慕秋 李家宇 李梦佳 龚忠诚 
国家自然科学基金(No.82160189,82360481);口腔颌面发育与再生湖北省重点实验室开放课题基金(No.2022kqhm008);新疆维吾尔自治区科研创新项目(No.XJ2023G174)
色素沉着绒毛结节性滑膜炎(Pigmented villonodular synovitis, PVNS)是一种可累及关节的腱鞘巨细胞瘤,类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis, RA)作为一种慢性自身免疫性疾病,二者都极少发生在颞下颌关节(Temporomandibular joint, TM...
关键词：颞下颌关节 色素沉着绒毛结节性滑膜炎 类风湿性关节炎 差异表达基因 富集分析 免疫浸润分析 生物标志物 
基于联邦半监督学习的皮肤病变智能识别
《生物信息学》2025年第1期61-70,共10页段聪颖 顾敏杰 李雪 陈思光 
国家自然科学基金(No.61971235);中国博士后科学基金项目(No.2018M630590);江苏省“333高层次人才培养工程”;江苏省博士后科研资助计划(No.2021K501C);南京市妇幼保健院青年人才;南京邮电大学‘1311’人才计划资助
近年来,深度学习技术已广泛应用于皮肤病变识别。然而在实际应用场景中,单一医疗机构存在训练数据有限、有标签样本不足,以及集中式学习易泄露隐私等问题。针对上述问题,本文提出了一种基于联邦半监督学习的皮肤病变智能识别机制。具体...
关键词：皮肤病变 深度学习 图像识别 联邦学习 
柯萨奇病毒A组6型VP1的主要特性及表位预测分析
《生物信息学》2025年第1期50-60,共11页刘益文 张晓雯 高邦婷 项钦戈 张晨阳 左成 杨欢 汪大巍 张高博 
武汉华夏理工学院校级科研基金项目(No.22011)
运用生物信息学方法预测分析襄阳地区分离的柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CV-A6)病毒蛋白(Viral protein, VP)中VP1的主要特性及表位。应用ProtParam, SOPMA,Phyre 2,DNAstar v8.1.3,Mega11,ABCpred, ElliPro, NetMHCpan-4.1,Ne...
关键词：CV-A6 VP1 生物信息学 主要特性 表位 
基于迁移学习的空间转录组数据解卷积算法
《生物信息学》2025年第1期40-49,共10页陈子睿 杨博然 何田韵 李建 周光华 
空间转录组(Spatial transcriptomics, ST)测序技术可以捕获多个细胞的空间位置信息,但无法达到单细胞分辨率,阻碍了对细胞类型异质性空间模式和基因表达特异性的解析。针对ST数据,本文提出了基于DenseNet网络结构和CORAL域自适应理论...
关键词：空间转录组数据 解卷积 DenseNet CORAL 
癌症精准治疗中的合成致死互作研究
《生物信息学》2025年第1期28-39,共12页陈佳豪 黄玉娥 汪泉 姜伟 
国家自然科学基金面上项目(No.62172213,61872183)
癌症精准治疗作为当今抗癌研究的前沿,通过深入挖掘癌症的临床病理和分子特征,为患者提供个体化治疗策略。相对于传统治疗方法,癌症精准治疗极大地提高了治疗的成功率。然而,在临床实践中,精准治疗尚处于早期阶段,如何高效地为患者制定...
关键词：合成致死 癌症 精准治疗 靶向治疗 药物药效 
单细胞转录组数据分析中的数学
《生物信息学》2025年第1期1-27,共27页罗琴琴 雷锦志 
国家自然科学基金项目(No.11831015)
近年来,高通量单细胞测序技术为生物学研究带来了深刻的新发现,单细胞RNA测序技术的快速发展使得人们能够以单个细胞的分辨率定量研究细胞全基因组的转录水平。如何从高维的单细胞RNA测序数据中获取关于细胞和基因组的有用信息,是单细胞...
关键词：单细胞转录组测序数据 数据预处理 聚类分析 数学基础 
生物信息学2024年第22卷总目次
《生物信息学》2024年第4期315-318,共4页
结肠癌坏死性凋亡相关lncRNA模型建立及药物筛选
《生物信息学》2024年第4期305-314,共10页刘艳玲 谭力文 
德州学院博士科研基金项目(No.2019xgrc25)
通过构建结肠癌坏死性凋亡相关lncRNA的预后模型,进行肿瘤细胞免疫浸润分析,并筛选结肠癌潜在的治疗药物,为结肠癌患者的免疫治疗提供理论基础。从TCGA数据库中下载并整理结肠癌病人的表达和临床数据,提取坏死性凋亡基因的表达量,通过...
关键词：结肠癌 坏死性凋亡 lncRNA 药物筛选 
基于自噬相关基因表达水平的尿毒症诊断模型
《生物信息学》2024年第4期296-304,共9页马思佳 王永涛 谷劼楠 徐世杰 
中国中医科学院科技创新工程项目(No.CI2021B001)
基于生物信息方法筛选尿毒症(Uremia,UA)与自噬相关的差异表达基因(AT-DEGs),探讨自噬相关生物标志物在UA发生发展中的作用,以期为UA的诊断和治疗提供新的思路。从GEO数据库下载原始数据集并进一步整合分析。采用R软件筛选UA组与健康对...
关键词：尿毒症 生物信息学 自噬 诊断基因 GEO数据库 
基于表示学习的图神经网络模型预测化合物-蛋白质相互作用
《生物信息学》2024年第4期287-295,共9页章广能 张育芳 张宝 
化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要。本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型。首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征...
关键词：化合物-蛋白质相互作用 表示学习 图神经网络 药物发现 
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