生物合成基因簇

作品数:182被引量:366H指数:9
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青霉属真菌次级代谢基因挖掘的研究进展被引量:1
《中国海洋药物》2024年第1期74-85,共12页孙园园 于豪冰 翟祥宁 宁哲 何颖 胡波 刘小宇 
国家重点研发计划项目(2018YFC1406702)资助。
青霉属真菌是自然界中最常见的真菌,分布范围非常广泛,是最重要的药源真菌,从青霉属真菌中报道了许多具有抗菌、抗肿瘤、抗病毒等活性的次级代谢产物,是药物先导化合物的重要来源。近年来,随着微生物全基因组测序分析技术的发展以及对...
关键词:青霉属 真菌 基因挖掘 次级代谢产物 生物合成基因簇 
Difficidins生物合成基因簇中蛋白激酶基因difB功能研究
《中国海洋药物》2023年第4期19-26,共8页武强强 高宇佳 肖菲 李文利 
国家自然科学基金项目(32070054,32100051)资助。
目的对海洋芽孢杆菌Bacillus methylotrophicus B-9987 difficidins化合物生物合成基因簇中difB基因功能进行探究。方法通过生物信息学手段对difB的功能进行预测;构建difB双交换阻断突变株及高表达株;通过高效液相色谱法(HPLC)分析野生...
关键词:海洋芽孢杆菌 difficidins 生物合成 磷酸化修饰 
卡西霉素生物合成基因簇中调控基因calR1的功能
《微生物学通报》2023年第3期1195-1204,共10页苟丽霞 蔡楠 刘孟欣 汪志军 韩铁生 
国家自然科学基金(31700083);河北省自然科学基金(H2020209001)。
【背景】卡西霉素(calcimycin)是重要的离子载体抗生素,其生物合成基因簇已从教酒链霉菌NRRL3882的基因组DNA中成功克隆,但基因簇内的部分生物合成基因及调控基因的功能有待研究。【目的】研究卡西霉素产生菌教酒链霉菌NRRL3882中编码T...
关键词:卡西霉素 TylR家族 调控基因 生物合成 
一株诺西肽产生菌的发掘及发酵条件优化
《中国药科大学学报》2022年第6期725-733,共9页孙启航 徐允聪 吴羚锐 容佳乐 王彦文 曹玉丹 罗晨 吴旭日 
国家自然科学基金资助项目(No.81973214)
诺西肽是一种典型的硫肽类抗菌化合物,对多种革兰氏阳性耐药菌具有良好的抗菌活性。尽管水溶性低、体内活性差和结构类似物多等限制了诺西肽的临床应用,但糖基化类似物有望成为解决诺西肽成药难题的方式之一。基于诺西肽的生物合成基因...
关键词:诺西肽 基因组挖掘 发酵 生物合成基因簇 糖基转移酶 
一种针对多重耐药病原体的天然抗生素
《中国临床药理学杂志》2022年第20期2463-2463,共1页
革兰氏阴性菌导致越来越多的由抗生素耐药性感染引起的死亡。细菌天然产物黏菌素被认为是对抗许多革兰氏阴性病原体的最后一道防线。质粒携带的多黏菌素抗性基因磷酸乙醇胺转移酶(mcr-1)最近在全球范围内的传播威胁到多黏菌素的实用性...
关键词:天然抗生素 抗生素耐药性 多黏菌素 磷酸乙醇胺 生物合成基因簇 革兰氏阴性菌 结构多样性 天然产物 
微生物天然产物生物及化学信息学最新进展
《中国抗生素杂志》2022年第7期625-630,共6页王梦源 常珊珊 解云英 
国家自然基金面上项目(No.81973219);国家自然基金青年项目(No.82104047);中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(No.2021-I2M-1-028)。
微生物天然产物一直是药物开发的重要源泉,而且目前仍是新结构天然产物的重要来源。但随着微生物天然产物基数的增加,重复发现已经成为制约其发展的主要因素,而基于生物信息学和化学信息学建立起来的基因组挖掘技术是解决这一问题的关...
关键词:微生物天然产物 生物信息学 化学信息学 生物合成基因簇 
深海链霉菌SCSIO 1071中聚酮合酶基因簇Cluster 46编码产物探究
《中国海洋药物》2022年第3期25-33,共9页孙倩楠 张会鹏 侯路宽 肖菲 李花月 李文利 
国家自然科学基金项目(U1706206);国家重点研发计划项目(2019YFC0312501)资助。
目的 对南海深海来源链霉菌Streptomyces olivaceus SCSIO 1071中新颖I型聚酮合酶基因簇Cluster46及其编码产物进行探究。方法 通过生物信息学手段对基因簇Cluster 46的基因组成进行分析;采用PCRtargeting策略构建聚酮合酶基因orf27和L...
关键词:深海链霉菌 Streptomyces olivaceus SCSIO 1071 聚酮合酶生物合成基因簇 多重耐药菌 
锡林郭勒盟高原盐湖放线菌资源勘探及抗菌活性筛选被引量:2
《中国抗生素杂志》2022年第5期443-452,共10页赵思捷 王春苗 王聪聪 李甲 郑文 张璐 岳泽惠 李小俊 
国家自然科学基金(No.81703476);河北省自然科学基金(No.C2017405031);河北省教育厅省属高校基本科研业务费研究项目(No.JYT2020001,No.JYT2021010);河北省大学生创新创业训练计划项目(No.S202110092025)。
目的探究锡林郭勒盟高原盐湖放线菌的多样性、新颖性及抗菌活性,为新型抗菌活性产物的发掘储备菌种资源。方法采用20种分离培养基,以平板涂布法分离放线菌;依据16S rRNA基因的同源性对菌株进行分子鉴定;PCR检测代表菌株的Ⅰ型聚酮合酶(P...
关键词:盐湖 放线菌 多样性 抗菌活性 生物合成基因簇 
利普斯他汀高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA的全基因组测序与分析被引量:1
《中国抗生素杂志》2022年第1期28-34,共7页李辉 方志锴 郭霞凌 
湖南省制造强省专项(湘财企指[2018]64号);福建省公益类科研院所专项(No.2020R10050011)。
目的解析利普斯他汀(lipstatin)高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA(S.toxytricini AP617-N12CA)的基因组序列信息,为深入研究该菌株高产lipstatin的分子机理与调控机制奠定基础。方法联合应用三代单分子测序技术和二代高通量测序技术对AP...
关键词:毒三素链霉菌 利普斯他汀 全基因组测序 基因组完成图 线型质粒 生物合成基因簇 
珊瑚来源真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11中聚酮化合物的发现及其生物合成途径分析被引量:1
《微生物学报》2021年第11期3631-3641,共11页周晓雪 杨佳凡 李明哲 宋永相 鞠建华 李晓帆 王立岩 
深圳市科技计划(JCY20180305123659726)。
海洋来源真菌的天然产物因其独特的结构与生物学活性而备受关注,而利用基因组信息对其代谢产物进行深入挖掘也成为研究策略之一。【目的】本文以一株南海珊瑚来源的真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11为目标菌株,挖掘其生产聚酮类...
关键词:Parengyodontium album SCSIO SX7W11 sydowinin A 生物合成基因簇 基因组 海洋真菌 
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