生物信息工具箱

作品数：8被引量：5H指数：1
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MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用——基因表达图谱分析(4)
《现代生物医学进展》2012年第20期3938-3942,3952,共6页杨英杰 李红燕 云慧 刘新星 
国家自然科学基金(50774102)提供资助
基因表达图谱原则上可了解整体细胞基因表达的信息,是基因组功能分析的重要研究手段。MATLAB 7.X生物信息工具箱为基因表达谱数据的分析和处理提供了一个综合环境,通过众多统计函数和绘图函数的结合使用,过滤不合格的基因数据和噪声数据...
关键词：基因芯片 生物信息工具箱 聚类分析 主成分分析 
MATLAB7.X生物信息工具箱的应用——聚类分析(七)被引量：1
《现代生物医学进展》2012年第17期3259-3262,共4页刘新星 梁万洁 李红燕 杨英杰 
国家自然科学基金项目(50774102)
本文主要介绍MATLAB生物信息工具箱的数据聚类分析功能,该功能主要用于基因芯片数据的分析。将要分析的数据先转化成XLS格式的文件,通过函数xlsread读入MATLAB Workspace,存储为两个变量。对缺失数据进行估算,从而减小结果误差。函数clu...
关键词：聚类分析 电子数据表 Clustergram 基因芯片 
MATLAB7.X生物信息工具箱的应用——专用分析工具(六)被引量：1
《现代生物医学进展》2012年第15期2962-2967,2997,共7页刘新星 谢成 李红燕 杨英杰 
国家自然科学基金(50774102)
序列分析可以获取蕴藏在简单序列中的生物信息,是生物信息分析的基础。通过生物大分子序列差异分析构建的系统树则可为我们提供可视化的物种间的进化关系。MATLAB7.X生物信息工具箱包含了几个图形用户界面设计的专用分析工具,这些专用...
关键词：生物信息工具箱 序列分析工具 系统发育分析工具 
MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用--系统发生分析(五)
《现代生物医学进展》2008年第11期2112-2115,共4页刘新星 李寿朋 王婧 杨英杰 
国家自然科学基金(50774102)提供资助.
MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于系统发生分析的综合环境,它能利用数据库资源,方便获取DNA/蛋白质序列数据,所有操作简单高效,结果可视化程度高。在工具箱提供的开放环境里,用户还可以根据自己的目标来设计和利用分...
关键词：生物信息工具箱 系统发生分析 系统发生树 
MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——基因芯片分析(三)被引量：1
《现代生物医学进展》2008年第4期704-708,共5页杨英杰 李红燕 谢建平 刘新星 
国家自然科学基金(50774102)
本文主要介绍生物信息工具箱在基因芯片图像和数据处理方面的应用,通过基因芯片数据的基因表达图谱研究基因表达水平,比较健康组织和病变组织的区别,并且观察药物应用所造成的变化。以健康小鼠和帕金森疾病小鼠脑基因的表达情况和差别...
关键词：基因芯片 可视化 散点图 对数坐标图 
MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——基因序列分析(一)
《现代生物医学进展》2008年第1期118-121,共4页刘新星 李红燕 杨英杰 
国家自然科学基金(50774102)
MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于基因组和蛋白质组分析的综合环境,它利用数据库资源,使科学研究事半功倍,在工具箱提供的开放环境里,用户甚至可以按照自己的目的来设计和利用分析工具。本文主要介绍了MATLAB7.X生物...
关键词：生物信息工具箱 序列分析 开放阅读框 密码子 
MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——序列比对(二)被引量：2
《现代生物医学进展》2008年第2期351-353,350,共4页李红燕 刘新星 谢建平 杨英杰 
国家自然科学基金(50774102)提供资助
序列比对是基因序列分析中的一项重要工作。本文以人和鼠的基因为对象,介绍MATLAB 7.X生物信息工具箱中的序列比对方法,内容包括从数据库获取序列信息,查找序列的开放阅读框,将核苷酸序列转换为氨基酸序列,绘制比较两氨基酸序列的散点图...
关键词：序列比对 开放阅读框 序列散点图 同一性 
COM技术在马铃薯生物信息研究平台中的应用
《仪器仪表用户》2007年第4期62-64,共3页朱笑花 张寿明 李灿辉 
云南省自然科学基金项目(2002C0035M)
经分析表明,开发我国自己的马铃薯生物信息研究平台势在必行。为了充分利用MATLAB7．0新增加的生物信息工具籀并简化平台的开发过程,在开发马铃薯生物信息研究平台的过程中,采用了COM技术将用MATLAB生物信息工具箱实现的部分生物信息分...
关键词：COM 生物信息工具箱 马铃薯 
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