生物信息学研究

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基于生物信息学研究“续断-女贞子”药对通过铁死亡途径治疗失用性骨质疏松的作用机制
《医学综述》2025年第9期1133-1143,1148,共12页李远志 黄江海 迟敬轩 李志文 方志远 王慧明 
北京中医药大学青年教师项目(2017-JYB-JS-091)。
目的基于生物信息学研究“续断-女贞子”药对通过铁死亡途径治疗失用性骨质疏松(DOP)的药效物质基础与潜在的分子作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台检索并筛选续断、女贞子的关键活性成分和靶点,通过高通量基因表达数...
关键词：失用性骨质疏松 生物信息学 续断 女贞子 铁死亡 
阔叶十大功劳治疗肝癌作用机制的生物信息学研究
《云南民族大学学报(自然科学版)》2025年第2期133-143,共11页杨霞 杨凯平 张学武 林登梅 张楠楠 李军 
国家自然科学基金(82060797);贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目(贵中医大创合字(2022)135号).
基于网络药理学和生物信息学探讨了阔叶十大功劳(Mahonia bealei(Fort.)Carr,MB)治疗肝癌的作用机制.首先,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取MB的靶点,并通过基因表达综合数据库(GEO)数据库下载肝癌数据集GSE45267....
关键词：网络药理学 生物信息学 阔叶十大功劳 肝癌 作用机制 
肥胖基因及其互作microRNA与疾病发生关联的生物信息学研究
《生物医学》2025年第1期159-170,共12页李智瑞 张雪梦 林姣妍 曹胜 赵泽燕 周学 
江苏省自然科学基金面上项目“CG18262通过转录调控Imd通路与MAPK通路交互参与先天免疫稳态维持的分子机制”(项目编号:BK20211128);江苏省大学生创新创业训练计划项目“肥胖基因及其互作小RNA与疾病发生的关联性研究”(项目编号:202413843030Y)。
目的:基于生物信息学探讨肥胖与疾病发生的关联。方法:分别以“肥胖”、“心血管疾病”、“心脏病”、“癌症”、“肝脏代谢失调”为关键词,在相关疾病数据库(Genecards、TTD、OMIM、Uniprot)中获取关键靶点。基于STRING数据库构建疾病...
关键词：肥胖 MICRORNA 心血管疾病 癌症 生物信息学 
基于GEO数据库的不完全射频消融后肝细胞癌关键基因的生物信息学研究
《岭南现代临床外科》2025年第1期12-18,共7页张舟 黄碧 赵慧英 
国家自然科学基金面上项目(82371482)。
目的本研究旨在通过比较不完全射频消融(IRFA)处理肝细胞癌(HCC)患者与HCC的基因表达谱,识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因,并提供潜在治疗靶点。方法从GEO数据库中下载GSE212604数据集,根据是否接受IRFA治疗分为IRFA组和对照组,分...
关键词：肝细胞癌 不完全射频消融 差异表达基因 加权基因共表达网络分析 
基于网络药理学和生物信息学研究莪术有效成分及治疗慢性胰腺炎的潜在靶点
《南京中医药大学学报》2025年第1期78-85,共8页吴飏 张纯 施润 孙婧 张自力 郭玫 徐冬 涂敏 蒋奎荣 
国家自然科学基金青年科学基金项目(82474164,82305046,82304902);江苏省双创博士计划(JSSCBS20220472,JSSCBS20221832);江苏省卫健委医学科研项目(215);江苏省中医院优秀博士培育计划(2023QB0124)。
目的采用网络药理学和生物信息学结合的方法探索莪术有效成分以及治疗慢性胰腺炎(CP)的潜在价值。方法网络药理学方法筛选出莪术的有效活性成分及CP潜在治疗靶点,结合公开数据库中CP组织测序和单细胞测序数据,进一步分析这些靶点在CP中...
关键词：莪术 慢性胰腺炎 胰腺星状细胞 网络药理学 分子对接 单细胞测序分析 
莽草酸合酶基因aro家族的生物信息学研究
《中国兽药杂志》2025年第1期46-55,共10页赵振宇 马春霞 顾进华 
“十四五”国家重点研发计划项目(编号:2022YFD1801105;2022yfd1802104)。
为挖掘莽草酸合成途径关键酶基因aro家族高效生物元件,本研究梳理了莽草酸生物合成途径及其可能的衍生化,对莽草酸合成的关键酶基因aro家族进行进化分析,三级结构建模及与底物分子对接分析,为进一步的莽草酸生物合成酶筛选奠定基础。本...
关键词：莽草酸 aro家族 分子对接 进化 生物合成 
急性心肌梗死诊断标志物IL-17RA和IRAK3的表达及其与免疫细胞浸润相关性的生物信息学研究
《浙江医学》2025年第2期132-138,I0003,共8页赵伟钢 卢汉龙 
目的应用生物信息学方法探讨急性心肌梗死(AMI)诊断标志物白细胞介素17受体A(IL-17RA)和白细胞介素1受体相关激酶3(IRAK3)的表达及其与免疫细胞浸润的相关性。方法从基因表达综合数据库中下载AMI相关的表达矩阵GSE123342,筛选差异表达基...
关键词：急性心肌梗死 免疫 诊断 标志物 
ZFHX4突变与肿瘤免疫治疗疗效相关性的生物信息学研究
《浙江医学》2025年第2期139-145,I0004,共8页李德周 舒鹏 张永虎 李红山 
宁波市省市共建医学重点学科项目(2016-S04);浙江省中医药创新团队建设项目(2022-16)。
目的探究锌指同源框蛋白4(ZFHX4)突变与肿瘤免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗反应及肿瘤免疫微环境的关系。方法登陆cBioPortal数据库获取8组公开的ICIs治疗患者全外显子组测序队列,包含膀胱癌、头颈癌、黑色素瘤、非小细胞肺癌4种癌症共769...
关键词：免疫检查点抑制剂 锌指同源框蛋白4 基因突变 生物标志物 
T细胞参与慢性阻塞性肺疾病潜在机制的单细胞转录组生物信息学研究
《中国医学工程》2024年第12期29-36,共8页冯倩 孙岩 
目的利用单细胞转录组生物信息学方法探讨T细胞参与慢性阻塞性肺疾病发病的潜在机制。方法从高通量基因表达数据库下载单细胞转录组数据集GSE173896,利用R语言的Seurat数据包对数据进行过滤和标准化;将具有相似特征基因的细胞进行聚类...
关键词：慢性阻塞性肺疾病 单细胞转录组 T细胞 生物信息学 
探究3种缺血性脑卒中危险因素的基因关联:一项整合生物信息学研究
《中华高血压杂志(中英文)》2024年第12期1140-1140,共1页袁源(译) 练桂丽(审校) 
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)是全球致残和致死的主要原因。越来越多的证据表明,血压、血糖、血脂和IS存在关联。然而,这3种危险因素与IS的基因关联仍不明确。方法:该研究筛选血压、血糖和血脂的相关基因工具变量,并将其与IS全基...
关键词：综合数据库 差异表达基因 孟德尔 全基因组关联研究 缺血性脑卒中 基因关联 列线图 生物信息学 
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