生物序列

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优化K-MER模型对生物序列进行聚类
《福建电脑》2024年第7期58-62,共5页李莉 黄伟 赵佳旭 
福州职业技术学院校级科研项目(No.FZYKJJJYB202304)资助。
基于K-mer的生物序列聚类算法是一种基于序列特征的聚类方法。纯粹的K-mer聚类算法运行速度较慢。为解决这个问题,本文提出了对生物序列聚类的优化KMER模型。首先以生物序列的K-mer频率为基础,将每个字符(A、C、G、T)分配一个两位的二...
关键词：生物序列 聚类算法 位操作 并行化 
异构机群系统中序列比对并行算法进展
《福建电脑》2019年第4期67-69,共3页李显宁 
广西机电职业技术学院异构机群系统上序列比对并行处理研究项目(No.[2008]KY014)资助
简要介绍生物序列比对问题,生物序列比对分为双序列比对和多序列比对两大类,介绍了双序列比对并行算法和多序列比对并行算法的研究现状,并分析它们的主要设计思想及其性能。最后,对异构机群计算环境下序列比对近似并行算法的研究进行简...
关键词：生物序列比对 序列比对 双序列比对 多序列比对 并行 
生物序列比对算法的研究
《福建电脑》2003年第12期17-18,共2页陈光 郑影 
随着生物信息学数据的大量积累,通过对核酸序列或蛋白质序列进行比对,可以有效地分析和预测一些新发现基因的功能。序列比对的理论基础是进化学说,如果两个序列之间具有足够的相似性,可以推测二者有共同的进化祖先;二个具有同源性的生物...
关键词：生物信息学 生物序列 比对算法 动态规划算法 生物同源性 
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