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作品数：226被引量：464H指数：10
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结合分子图与分子指纹对比的分子性质预测
《网络新媒体技术》2025年第2期40-49,共10页慈磊 蒋林华 
国家自然科学基金(编号:62175037)。
分子性质预测已经成为新药研发过程中十分重要的一个过程,然而还存在单一分子表示信息不完全、标签分子数量稀缺的问题。为了解决这些问题,提出一种结合分子图与分子指纹的对比学习框架。根据拓扑信息将无标签分子进行聚簇,得到这些簇...
关键词：分子性质预测 预训练 对比学习 分子指纹 多种表示学习 
基于分子指纹与量子化学描述符预测聚酰亚胺玻璃化转变温度的机器学习模型
《高等学校化学学报》2025年第4期114-122,共9页詹森华 石彤非 
国家自然科学基金(批准号:2247030172)资助。
基于聚酰亚胺重复单元获得了分子访问系统(MACCS)指纹图谱和9种量子化学密度泛函理论(DFT)描述符,构建了MACCS,DFT和两者集成的3类预测模型.通过比较分析随机森林(RF)、支持向量回归(SVR)、极致梯度提升(XGB)和梯度提升回归(GBR)等4种...
关键词：机器学习 量子化学 分子指纹 聚酰亚胺 
藻源性溶解性有机物分子指纹解析和消毒副产物形成潜势
《环境科学研究》2025年第4期840-851,共12页陈晶 周永强 张运林 何晨 史权 郭全忠 张淑兰 葛光环 
安康市科学技术研究发展计划项目(No.AK2023-RK-03);安康学院高层次人才科研专项经费项目(No.2023AYQDZR20);安康市2024年主导产业重大科研攻关项目(No.AK2024-JBGS-03)。
在富营养化水体中由藻类代谢或死亡后释放的藻源溶解性有机物(ADOM)是自来水厂消毒副产物生成的主要前体物质,其对水源地水质安全构成潜在威胁。为探究蓝藻水华消退期ADOM在湖泊微生物作用下的释放和转化规律,以太湖处于衰亡期的蓝藻作...
关键词：太湖 藻源溶解性有机物(ADOM) 溶解性有机物(DOM) 分子组成 傅里叶变换离子回旋共振质谱(FT-ICR MS) 消毒副产物(DBPs) 
基于Bert+GCN多模态数据融合的药物分子属性预测
《生物化学与生物物理进展》2025年第3期783-794,共12页闫效莺 靳艳春 冯月华 张绍武 
国家自然科学基金(62173271);陕西省自然科学基础研究计划(2023-JC-YB-591);西安石油大学研究生创新与实践能力培养计划(YCS23213171),西安石油大学研究生精品案例库建设(2024-X-YAL-003)资助项目。
目的药物研发成本高、周期长且成功率低。准确预测分子属性对有效筛选药物候选物、优化分子结构具有重要意义。基于特征工程的传统分子属性预测方法需研究人员具备深厚的学科背景和广泛的专业知识。随着人工智能技术的不断成熟,涌现出...
关键词：Bert预训练 注意力机制 分子指纹 分子属性预测 图卷积神经网络 
基于图注意力网络的抗癌药物组合协同性预测方法
《南通大学学报(自然科学版)》2025年第1期10-17,共8页秦伟琦 包欣 陈晓 邱建龙 王东琳 
国家自然科学基金面上基金项目(62173175,61877033)。
抗癌药物组合的协同性筛选对于临床治疗具有重要意义,但随着药物组合数量的爆炸式增长,传统检测方法存在耗时长、成本高等问题,难以有效发现新的协同药物组合。针对上述问题,提出一种基于图注意力网络的抗癌药物组合协同性预测模型(mult...
关键词：抗癌药物联合治疗 分子指纹 图注意力神经网络 深度学习 
291个葡萄品种SSR分子指纹数据集被引量：1
《农业大数据学报》2025年第1期112-117,共6页武亚敬 冀晓昊 于祎飞 时梦 王孝娣 王宝亮 刘凤之 李明亮 王贺 刘俊 王海波 
国家重点研发计划(2023YFD1200100);国家农业科技园区专项(2021C-01);山东省重点研发计划(2022TZXD0010);中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2021-RIP-02);怀来葡萄与葡萄酒产业科技特派团。
中国在全球葡萄产业中占据重要地位,栽培面积和产量均居世界前列。作为果树产业的关键分支,葡萄产业对于农民的增收和乡村振兴起到了支柱作用。国外品种的引进和自主培育极大地丰富了我国的葡萄品种储备,为产业发展奠定了基础。但品种...
关键词：葡萄 品种鉴定 SSR分子标记 遗传多样性 
基于分子指纹构建细菌回复突变性预测模型
《中国现代应用药学》2024年第22期3153-3157,共5页胡笑文 赵文慧 张才煜 陈华 
目的构建一个精准的致细菌回复突变性预测模型,用于评估药物及其杂质的致突变性。方法从文献中收集细菌回复突变数据,按4∶1随机分割为训练集和测试集。采用扩展连通性指纹作为化合物特征,在训练集上优化指纹和算法参数,建立QSAR模型。...
关键词：遗传毒性 杂质 构效关系 分子指纹 评估方法 
基于ECFP指纹和决策树的重要分子片段识别研究
《现代计算机》2024年第16期1-9,共9页李柏易 许振军 尹祚德 谢良旭 许晓军 
国家自然科学基金项目(22003020、12074151)。
基于片段的药物设计是一种新兴药物研发技术。如何实现分子片段的识别和定量表征是该技术的核心关键之一。提出了基于分子指纹和决策树的重要分子片段识别策略,利用扩展连通指纹对蛋白质-配体复合物进行分子片段编码,采用Random Forest...
关键词：蛋白质-配体 重要分子片段 分子指纹 决策树 结合亲和力 
用于含能分子性质预测的分子描述符增强图神经网络被引量：1
《Science China Materials》2024年第4期1243-1252,共10页高天宇 纪玉金 刘成 李有勇 
supported by the National Key Research Program of China (2022YFA1503101);the National Natural Science Foundation of China (22173067);the Science and Technology Development Fund, Macao SAR (FDCT, 0024/2022/ITP);the Collaborative Innovation Center of Suzhou Nano Science & Technology, Priority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education Institutions (PAPD);the 111 Project;the Joint International Research Laboratory of Carbon-Based Functional Materials and Devices。
含能分子在军事和民用应用中都发挥着重要作用.传统上,确定含能分子的物理化学参数需要实验工作量且具有风险,而新兴的机器学习方法有望解决这一问题.在这项工作中,我们报道了一种分子描述符增强的图神经网络(MD增强的GNN)模型,该模型...
关键词：神经网络 模型集成 分子描述符 物理化学参数 机器学习方法 爆轰参数 分子指纹 关键领域 
机器学习预测有机水污染物光催化降解速率被引量：1
《纺织高校基础科学学报》2024年第1期26-33,共8页朱炜 王嘉伟 张梦源 杨旭东 宋振阳 李庆 
陕西省自然科学基础研究面上项目(2022JM-092);西安市科技计划先进制造业技术攻关项目(21XJZZ0015);西安市碑林区应用技术研发项目(GX2212)。
为了预测有机污染物的光催化降解速率,探究污染物分子结构与其降解速率之间的构效关系,设计了一种基于分子指纹的机器学习模型。该模型使用81种有机污染物的523条记录作为模型数据,将污染物MACCS分子指纹与5种实验条件(辐照度、温度、...
关键词：有机污染物 光催化 分子指纹 构效关系 机器学习 轻量级梯度提升 
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