位置权重矩阵

作品数：21被引量：66H指数：3
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基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析被引量：1
《生物信息学》2016年第1期1-6,共6页岁品品 邢旭东 王宏 崔颖 
黑龙江省卫生厅科研课题资助(2013129)
为研究高通量的人类CD4+T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型,通过十倍交叉验证评估模型性能,并与Segal方法与弯曲度...
关键词：核小体定位 位置权重矩阵 基因功能富集分析 
基于一致序列多样性分析的启动子预测方法被引量：1
《生物信息学》2012年第3期211-216,共6页张文燕 武栓虎 王敏强 
国家自然科学基金(61070118)
基于启动子的以下特点:(1)启动子区域有一些一致序列,但对于不同的启动子,一致序列在个别碱基上会有所改变,具有多样性;(2)一致序列的位置并不固定,总是在某个范围内波动;(3)大部分的真核生物启动子都和CpG岛有关。提出了一个新的启动...
关键词：启动子预测 真核生物 CPG岛 区间位置权重矩阵 
大肠杆菌E．coli K-12转录因子结合位点的理论预测
《生物信息学》2007年第3期117-120,共4页杨科利 李前忠 林昊 
国家自然科学基金项目(No.30560039)
基于实验验证的22种大肠杆菌K12的转录因子结合位点序列,分析了转录因子结合位点每一位置的碱基保守性,提出了预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数算法(PWMSA)。利用self-consistency和cross-validation两种检验方法对此算法进...
关键词：转录因子结合位点(IFBS) 位置权重矩阵(PWM) 碱基保守性 
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