崔颖

作品数：11被引量：15H指数：2
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供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
发文主题：生物信息学核小体定位核小体医学院校教学方法更多>>
发文领域：生物学医药卫生文化科学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《哈尔滨医科大学学报》《数理医药学杂志》《科技创新导报》《生物信息学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金哈尔滨市科技创新人才研究专项资金黑龙江省卫生厅科研项目黑龙江省自然科学基金更多>>
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卷积神经网络在核小体定位识别中的应用被引量：1
《哈尔滨工程大学学报》2021年第5期751-758,共8页崔颖 施丹丹 徐泽龙 张兆功 李建中 
国家自然科学基金重点项目(61832003).
为更准确识别核小体定位,本文提出一种基于Z曲线理论(Z-Curve)的卷积神经网络(CNN)方法,称为ZCN方法。ZCN方法以Z曲线三维坐标矩阵表示核小体序列特征,通过十倍交叉验证,进行卷积神经网络方法进行模型训练和验证,使用标准评估指标进行...
关键词：计算生物学 卷积神经网络 Z曲线理论 核小体 DNA序列 连接区 
基于综合DNA序列特征的支持向量机方法识别核小体定位被引量：3
《生物医学工程学杂志》2020年第3期496-501,共6页崔颖 徐泽龙 李建中 
国家自然科学基金资助项目(61832003)。
本文基于Z曲线(z-curve)理论和位置权重矩阵(PWM)提出一种构建核小体DNA序列的模型。该模型将核小体DNA序列集转换成三维空间坐标,通过计算该序列集的位置权重矩阵获得相似性权重得分,将两者整合得到综合序列特征模型(CSeqFM),并分别计...
关键词：序列特征 支持向量机 核小体 Z曲线 位置权重矩阵 欧氏距离 
生物信息学专业Java语言课程的教学方法初探被引量：1
《黑龙江科技信息》2016年第18期183-183,共1页崔颖 史庆春 徐建凯 李孔宁 
Java语言是一门面向对象的编程语言,功能强大,在工业界和学术领域具有广泛的应用。本文针对生物信息学专业的Java语言课程教学提出了几点教学建议,注重理论基础、实践基础的学习,采用项目驱动教学方法和引入PBL教学方法,使学生掌握Java...
关键词：生物信息学 JAVA语言 PBL教学方法 
基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析被引量：1
《生物信息学》2016年第1期1-6,共6页岁品品 邢旭东 王宏 崔颖 
黑龙江省卫生厅科研课题资助(2013129)
为研究高通量的人类CD4+T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型,通过十倍交叉验证评估模型性能,并与Segal方法与弯曲度...
关键词：核小体定位 位置权重矩阵 基因功能富集分析 
生物信息学专业MySQL数据库课程教学方法探讨
《科技创新导报》2016年第5期141-141,143,共2页崔颖 史庆春 徐建凯 李孔宁 
该文根据My SQL数据库特点,结合生物信息学专业特色,提出了理论与实践结合、项目与任务结合、考核与教学反思结合的教学方法,调动学生的学习主动性,使学生充分认识到My SQL数据库课程在生物信息学数据存储、数据处理等方面的重要作用,...
关键词：MYSQL 数据库 生物信息学 
基于ChIP-seq的差异组蛋白修饰区域的筛选被引量：1
《生物信息学》2014年第2期151-156,共6页祝让飞 刘洪波 苏建忠 王芳 崔颖 张岩 
黑龙江省大学生创新创业训练计划(201210226010)资助
组蛋白修饰是在基因组水平上起到重要调控作用的表观遗传修饰,随着ChIP-Seq的广泛使用,高通量数据的积累,为从全基因组研究组蛋白修饰模式奠定了基础。但目前缺乏在多样本间筛选疾病相关的调控区域的方法,因而本文开发了一种多细胞系的...
关键词：组蛋白修饰差异 高通量数据处理 表观遗传修饰 
人类CD4^+T细胞核小体定位模式及其与TFBS分布特征关系研究被引量：1
《哈尔滨医科大学学报》2014年第1期36-39,共4页蓝贤梅 黄艳 崔颖 
哈尔滨医科大学大学生创新基金项目校B级
目的研究人类CD4+T细胞全基因组核小体抑制和激活状态下的定位模式,转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)分布特征以及两者之间的关系。方法采用生物信息学软件R、Java等通过编写比对算法进行统计学分析。结果人类...
关键词：核小体定位 CD4+T细胞 转录因子结合位点 定位模式 
组合数学在生物信息学教学中的应用被引量：1
《科技创新导报》2012年第6期142-142,共1页苏建忠 张岩 刘洪波 王芳 崔颖 
从试验中获取的生物信息进行储存、检索和分析是生物信息学研究的基本工作,所得的生物信息往往是离散的数据,而组合数学研究的对象就是离散数据,并有成熟的理论体系和组合算法思想,因此可以利用组合算法模型,以计算机为工具研究生物信...
关键词：组合数学 生物信息学 序列比对 
医学院校生物信息学专业《数据库原理与技术》教学方法研究与实践被引量：1
《数理医药学杂志》2011年第4期499-500,共2页崔颖 王芳 苏建忠 刘洪波 张岩 史庆春 
根据医学院校生物信息学专业数据库教学的现状及普遍存在的问题,深入研究PBL教学法,将该方法引入到数据库教学中,以传统教学方法为辅,理论与实践相结,应用多种数据库软件,强调生物信息专业的数据库知识学习和应用的专业特点,促使学生在...
关键词：医学院校 生物信息学 数据库 教学方法 
基于模糊理论预测CpG岛新方法被引量：1
《生物信息学》2009年第2期91-94,共4页王金龙 苏建忠 王芳 崔颖 张岩 
黑龙江省自然科学基金(D2007-35);黑龙江省教育厅海外学人科研资助基金(1152hq28);哈尔滨市科技创新专项基金(RC2007LX003004)
启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一。目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点,基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛,能更容易地找到被以往方法所忽略的具有更多生物学意义的CpG岛。...
关键词：CPG岛 模糊理论 隶属函数 截集 
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