张岩

作品数:18被引量:27H指数:3
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供职机构:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
发文主题:生物信息学DNA甲基化教学方法癌症组合数学更多>>
发文领域:生物学医药卫生文化科学理学更多>>
发文期刊:《临床皮肤科杂志》《生物信息学》《课程教育研究(学法教法研究)》《数理医药学杂志》更多>>
所获基金:国家自然科学基金哈尔滨市科技创新人才研究专项资金黑龙江省自然科学基金广西研究生教育创新计划项目更多>>
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医学院校生物信息学专业《组合数学》教学方法浅谈
《课程教育研究(学法教法研究)》2015年第28期26-27,共2页刘洪波 王芳 苏建忠 张岩 
组合数学可以培养学生的逻辑思维能力用于解决医药学科的实际问题,但是也正是因为其高度的抽象性和严密的逻辑推理正远离学生的兴趣。本文从组合数学在医学院校课程开设的特点和现状出发进行探讨,加深学生理解组合数学在生物医学中的...
关键词:组合数学 教学方法 生物医学 生物信息学 
癌症DNA甲基化调控位点的识别被引量:3
《生物信息学》2015年第3期170-178,共9页韦云真 刘晓娟 王芳 苏建忠 张岩 刘洪波 
国家自然科学基金项目(61403112;31371334)
DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰,在基因的转录调控方面具有重要的作用。异常的DNA甲基化可以导致癌症等复杂疾病发生,癌基因相关的DNA甲基化调控位点的识别对于解析癌症的发生发展机制及识别新的癌症标记具有重要意义。本研究通...
关键词:DNA甲基化 基因表达 转录调控 癌症 
表观基因组研究揭示23个由 DNA 甲基化异常介导的乳腺癌致病基因的研究被引量:1
《实用肿瘤学杂志》2015年第4期299-304,共6页刘晓娟 陈文杰 刘洪波 张锦明 张岩 
国家自然科学基金项目(61403112;31371334)
目的:筛选并系统分析由DNA甲基化介导的乳腺癌致病基因。方法本研究利用国际癌症基因组计划提供的表观基因组数据,通过生物信息学方法筛选并系统分析了乳腺癌中异常表达的基因及其表观遗传调控机制。结果通过t检验筛选了428个乳腺癌...
关键词:乳腺癌 DNA甲基化 差异表达基因 
基于denovo测序分析Bt菌株S3299-1基因组特征被引量:2
《基因组学与应用生物学》2015年第6期1232-1238,共7页黄飞燕 李莉 周燕 魏艳军 刘盼盼 李有志 张岩 方宣钧 
"中国Bt菌收集鉴定计划"项目;广西研究生教育创新计划项目(YCBZ2014006)共同资助
分离菌株S3299-1是从海南省吊罗山热带雨林自然保护区土壤中分离保存的对小菜蛾具有杀虫活性的苏云金芽孢杆菌,但目前尚未明确该菌株的杀虫蛋白基因。本研究主要采用Illumina Hiseq2000二代测序平台对分离菌株S3299-1基因组进行Survey...
关键词:苏云金芽孢杆菌 de novo测序 基因组 毒蛋白 生物信息学分析 
高等学校生物信息学专业《组合数学》的创新性教学方法浅谈被引量:2
《课程教育研究》2015年第25期132-133,共2页刘洪波 王芳 苏建忠 张岩 
组合数学可以培养学生的逻辑思维能力,用于解决医药学科的实际问题,但是也正是因为其高度的抽象性和严密的逻辑推理正远离学生的兴趣。本文从组合数学在高等学校课程开设的特点和现状出发进行探讨,加深学生理解组合数学在生物医学中的...
关键词:组合数学 教学方法 生物医学 生物信息学 
癌症中DNA甲基化基因模块筛选被引量:2
《生物信息学》2014年第3期189-195,共7页张淑梅 张彬 刘军厚 刘洪波 苏建忠 王芳 张岩 
黑龙江省大学生创新创业训练计划(201210226050)资助
肿瘤的发生受遗传学和表观遗传学修饰的共同影响。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,在癌症的发生与发展中起着重大的作用。因此找到癌症的甲基化标记物在癌症的诊断和治疗中具有重大意义。本文利用权重基因共表达网络分析的方法(WGC...
关键词:表观遗传修饰 肿瘤 甲基化 WGCNA 基因模块 
癌症相关的DNA甲基化连锁区域
《生物信息学》2014年第3期213-217,共5页王丽波 王芳 张岩 
哈尔滨医科大学大学生创业基金资助
DNA甲基化是重要的表观遗传标记之一,在转录调控中起直接作用。DNA甲基化的异常与癌症的发生发展密切相关。高通量测序使得在单碱基分辨率下检测全基因组的DNA甲基化水平成为可能。本文基于临近CpGs位点甲基化水平的相关性挖掘DNA甲基...
关键词:DNA甲基化 连锁不平衡 癌症 相关系数 
基于ChIP-seq的差异组蛋白修饰区域的筛选被引量:1
《生物信息学》2014年第2期151-156,共6页祝让飞 刘洪波 苏建忠 王芳 崔颖 张岩 
黑龙江省大学生创新创业训练计划(201210226010)资助
组蛋白修饰是在基因组水平上起到重要调控作用的表观遗传修饰,随着ChIP-Seq的广泛使用,高通量数据的积累,为从全基因组研究组蛋白修饰模式奠定了基础。但目前缺乏在多样本间筛选疾病相关的调控区域的方法,因而本文开发了一种多细胞系的...
关键词:组蛋白修饰差异 高通量数据处理 表观遗传修饰 
生物信息学专业《组合数学与图论》实验教学改革探索与实践
《课程教育研究(学法教法研究)》2014年第17期20-20,共1页刘洪波 苏建忠 王芳 张岩 
组合数学与图论是生物信息学专业本科生必修课。结合组合数学与图论的特点和现状出发,探讨实验教学在组合数学与图论理论知识学习及应用能力培养中的作用,通过改进课题教学内容与实验课程相结合的策略,提高学生的学习兴趣,培养学生...
关键词:组合数学图论 实验教学 生物信息学 
高通量DNA甲基化数据的处理和分析方法被引量:3
《生物信息学》2014年第1期72-76,共5页王心宇 许颖出 刘洪波 王芳 张岩 苏建忠 
黑龙江省大学生创新创业训练计划(201210226018);国家自然基金青年项目(61203262)
DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用。不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题。在本文...
关键词:DNA甲基化 高通量 二代测序 BS-Seq 
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