密码子使用

作品数:201被引量:716H指数:19
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秋茄叶绿体基因组密码子使用偏好性分析被引量:54
《森林与环境学报》2020年第5期534-541,共8页赵森 邓力华 陈芬 
广西高校中青年教师基础能力提升项目(KY2016YB496,2018KY0621);广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室项目(2019ZB01)。
为了确定秋茄叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因,以筛选到的50条蛋白质编码序列为研究对象,利用CodonW 1.4.2和CUSP在线程序对其密码子使用偏好性进行分析。结果表明:秋茄叶绿体基因组密码子第3位的GC含量(GC 3)较低,平均值为27.62%...
关键词:秋茄 叶绿体基因 密码子偏好性 最优密码子 
灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子使用特征分析被引量:20
《森林与环境学报》2020年第2期195-202,共8页原晓龙 王毅 张劲峰 
国家自然科学基金项目(31860177);云南省林业和草原科学院热带亚热带珍贵用材树种研发创新课题(2017HC024)。
通过分析灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子的使用特征,探讨影响其密码子使用偏性的主要因素。从灰毛浆果楝叶绿体基因组中筛选出54条编码序列(CDS),利用Codon W 1.4.2和CUSP软件计算不同基因密码子各位置的GC含量,以明确灰毛浆果楝叶绿体...
关键词:灰毛浆果楝 叶绿体基因组 密码子 偏好性 最优密码子 
酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量:51
《森林与环境学报》2019年第6期621-628,共8页胡晓艳 许艳秋 韩有志 杜淑辉 
山西省高等学校科技创新项目(2019L0369);山西农业大学博士科研启动项目(2017YJ22);山西省优秀博士来晋工作奖励项目(SXYBKY201742)
通过分析枣属植物酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响其密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:酸枣叶绿体基因组有效密码子数(N ec)为47.72,密码子使用偏性较弱;中性绘图分析和使用的有效密码子数绘图分析(N ec-plot绘图分析)...
关键词:酸枣 叶绿体基因组 密码子 使用偏性 
竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析被引量:42
《森林与环境学报》2019年第1期9-14,共6页吴妙丽 陈世品 陈辉 
中国科学院科技服务网络计划资助项目(KFJ-3W-No1)
以3种竹亚科植物的叶绿体基因组编码基因为研究对象,分析基因的密码子偏性形成的主要因素。结果显示:3种竹子具有相似的密码子使用模式,均偏爱以A或T结尾的密码子。奇偶偏好性分析进一步证实密码子第3位T的出现频率高于A。通过中性分析...
关键词:竹亚科 叶绿体基因组 密码子使用偏性 
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