结构模建

作品数:23被引量:44H指数:4
导出分析报告
相关领域:生物学更多>>
相关作者:刘元东刘振明邱冠周来鲁华刘楠更多>>
相关机构:中国科学院军事医学科学院北京大学复旦大学更多>>
相关期刊:《中国药物化学杂志》《计算机与应用化学》《中国应用生理学杂志》《科学通报》更多>>
相关基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程上海市教育委员会重点学科基金更多>>
-

检索结果分析

结果分析中...
条 记 录,以下是1-10
视图:
排序:
NADH荧光探针FrexH的结构模建与功能优化
《计算机与应用化学》2015年第6期651-656,共6页陈强 
国家自然科学基金(31171275)
FrexH是一种由枯草芽孢杆菌烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)感受性转录抑制因子(B-Rex)的NADH结合结构域和循环排列黄色荧光蛋白(cpYFP)结构域嵌合而成的检测活细胞中NADH的新型蛋白荧光探针,因其荧光强度受体系中pH值波动变化影响而使其应...
关键词:NADH FrexH 同源模建 分子对接 结构优化 
雌激素受体α36亚型配体结合区的结构模建、优化及验证被引量:1
《中国药物化学杂志》2013年第6期425-434,共10页王东 金宏威 刘振明 张亮仁 
国家自然科学基金项目(20972010);十二五国家科技支撑计划项目(2012BAI29B06)
目的雌激素受体(estrogen receptor,ER)参与多种重要的体内生理过程,是一个重要的受体家族。新近发现的雌激素受体α36亚型(ER-α36)通过新的作用机制调节体内功能,对其进行开拓性的研究具有重要意义。方法利用已知的ER-α36序列以及两...
关键词:雌激素受体α36亚型 同源模建 分子动力学模拟 分子对接 
CD28嵌合抗体及与抗原分子的3D空间结构模建
《细胞与分子免疫学杂志》2012年第12期1324-1327,共4页程钢 秦媛媛 程迪 陈曦 张学光 邱玉华 
国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2001CB51003)
目的:对1株嵌合抗体(antiCD28:ch-2F5)进行3D建模,并与其抗原分子进行对接,验证是否与抗原抗体结合理论相符,并提供一种抗原抗体及其识别的空间结构分析方法。方法:在http://www.ncbi.nlm.nih.gov网站提交序列进行分析,综合运用GenBank...
关键词:嵌合抗体 3D结构 CD28 模建 
葡萄血红蛋白的序列特征、结构建模及分子进化
《西北农业学报》2012年第6期58-62,共5页朱红霞 胡利宗 张家洋 李慧 
河南省政府决策研究招标课题(B578)
对葡萄血红蛋白基因的结构、进化关系、序列特征及蛋白结构进行剖析。基因结构和蛋白序列特征分析表明:尽管葡萄3个血红蛋白基因外显子个数和保守基序组织结构变异较大,但功能结构域具有高度保守性。结构模拟显示,葡萄VvHb1以单体形式存...
关键词:植物 基因 血红蛋白 结构模建 
β-苦瓜蛋白质分子结构模建研究被引量:1
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2011年第4期399-406,共8页周小东 沈富兵 郑崛村 
使用DNAMAN软件分析β-苦瓜蛋白质氨基酸组成,亲水、疏水性,用生物信息学在线网站预测其基本特性,二、三级结构,卷曲螺旋区域,PEST序列,并用生物信息学软件分析其表面电位、可及性,建立Ramachandran图对模建结果进行结构质量分析与检测...
关键词:β-苦瓜蛋白质 模建 生物信息学 
电子显微三维重构技术发展与前沿被引量:18
《生物物理学报》2010年第7期533-559,共27页张凯 张艳 胡仲军 季刚 孙飞 
科技部973"蛋白质机器与机制"(2006BC806506);蛋白质研究计划"膜蛋白和蛋白质复合体功能与结构研究"(2006CB911001);中国科学院知识创新工程重大研究项目"面向蛋白质科学的高性能计算研究"(KGCX1-YW-13);国家自然科学基金创新群体(30721003)~~
本文对电子显微三维重构技术(也称电镜三维重构,electron microscopy 3D reconstruction)进行简要介绍,并在此基础上对该技术当前研究的发展和前沿进行综述,包括高分辨率电镜三维重构、仪器设备性能突破、自动化数据收集和处理、高性能...
关键词:电子显微学 三维重构 自动化 高性能计算 图像处理 结构模建 
麻黄属rbcL基因的适应性进化检测与结构模建被引量:6
《科学通报》2010年第14期1341-1346,共6页刘念 王庆彪 陈婕 朱勇 扎西次仁 胡祎瑶 陈凡 钟扬 
国家自然科学基金(2005DKA21403);科技基础性工作专项基金(2007FY110100);上海市重点学科基金(B111);国家大学生创新性实验计划(J0630643);复旦大学研究生创新基金(EYH1322098)资助项目
采用PAML程序检测麻黄属14种及其他9种裸子植物rbcL基因的适应性进化.以"分支"模型检测到该属植物RbcL蛋白催化活性区先后经历了3次大范围的选择;以"分支-位点"模型检测出在该基因第365位密码子位点存在正选择的物种;计算机三维结构模...
关键词:麻黄属 裸子植物 rbcL适应性进化 三维结构模建 
蛋白质结构比较模建的研究进展
《药物生物技术》2009年第4期380-384,共5页胡健 方慧生 陈凯先 
比较模建也叫同源模建,其原理是蛋白质三级结构远比一级结构保守,因此即使蛋白质序列有明显差别,它们的功能仍然可能非常相似。由于实验方法得到目的蛋白的结构困难较多而且需要较长时间,比较模建可构建实验需要的结构模型用于提出关于...
关键词:比较模建 环结构模建 侧链模建 虚拟筛选 
甲型H1N1流感病毒HA蛋白结构模建与构象表位分析被引量:6
《科学通报》2009年第12期1642-1644,共3页流感研究上海协作组 吴迪 徐天磊 孙静 戴建新 丁国徽 何云刚 周正峰 熊慧 董辉 金维荣 边超 金力 王红艳 王小宁 杨忠 钟扬 王皓 车小燕 黄忠 蓝柯 孙兵 吴凡 袁政安 张曦 周晓农 周佳海 马志永 童光志 郭亚军 赵国屏 李亦学 曹志伟 
国家重点基础研究发展计划(编号:2004CB720103,2006AA02312);上海市教育基金(批准号:2000236018,2000236016)资助项目
最近几个月来,一种新型流感病毒H1N1在全球流行.本文运用生物信息技术,从NCBI发布的新型AH1N1流感病毒基因序列出发,通过同源模建方法构建了HA蛋白三维结构,利用自主开发的蛋白抗原空间表位预测程序SEPPA预测了HA蛋白潜在空间表位氨基酸...
关键词:甲型H1N1流感病毒HA蛋白 空间表位 生物信息学 
嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶的结构模建和底物分子对接(英文)
《现代生物医学进展》2009年第3期401-406,共6页刘元东 曾乐平 邱冠周 
supported by the National Natural Science Foundation of China(50321402);the National Basic Research Program of China(2004CB619201);the Mittal student Foundation of Central South University(No.07MX27);the post-graduate foundation of Hunan province(No.2340-74236000003)~~
极端环境微生物嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶(GR)可能在它的抵抗极端酸性,有毒和氧化性的生物浸出环境中发挥至关重要的作用。通过同源模建技术和分子动力学模拟,它的一个三维结构被构建,优化和检验了。获得的结构被进一步用于...
关键词:谷胱甘肽还原酶 嗜酸氧化亚铁硫杆菌 同源模建 分子动力学 分子对接 黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD) 氧化型谷胱甘肽(GSSG) 
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部