抗原表位预测

作品数：100被引量：233H指数：7
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人乳头瘤病毒39型遗传变异分析及T细胞与B细胞抗原表位预测
《中华实验和临床病毒学杂志》2025年第1期9-17,共9页张誉小 杨一娟 王丽 蓝锶菡 俞晶 何洁 张红平 冯敏 
中国医学科学院医学与健康科技创新工程-重大协同创新项目(2021-I2M-1-004);云南省兴滇英才支持计划-名医项目(XDYC-MY-2022-0056);云南省创新团队(202305AS00020)。
目的分析人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)39基因组遗传变异特征,并对病毒早期蛋白(E1、E2、E6、E7)和晚期蛋白(L1、L2)的T、B细胞优势抗原表位进行预测和筛选。方法从临床样本和NCBI数据库中共获取70条HPV39全长序列构建进化树...
关键词：人乳头瘤病毒39型 遗传变异分析 T细胞 B细胞 抗原表位预测 
结核分枝杆菌Phage蛋白的抗原表位预测及生物信息学分析
《医学理论与实践》2025年第1期14-19,共6页黄和明 张娟 李高驰 周海金 
广东省深圳市科技创新计划基础研究(No.JCYJ20180305125647151)。
目的:应用生物信息学软件对结核分枝杆菌Rv1579c基因编码的Phage蛋白结构和功能进行预测分析。方法:从NCBI Gene数据库中获取Rv1579c编码的氨基酸序列;通过ProtParam、ProtScale、NetPhos、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL在线网站分别对Phag...
关键词：结核分枝杆菌 焦亡 PHAGE 生物信息学 
HPV53进化关系分析及B细胞与T细胞抗原表位预测
《协和医学杂志》2024年第6期1364-1371,共8页蓝锶菡 冯敏 
中国医学科学院医学与健康科技创新工程⁃重大协同创新项目(2021⁃I2M⁃1⁃004);云南省卫生健康委员会医学学科带头人培养计划(D⁃2019023)。
目的基于全长序列分析人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)53不同分离株的进化关系,并对代表性分离株病毒蛋白(E1、E2、E4、E6、E7、L1和L2)的理化性质、二级结构及B细胞与T细胞抗原表位进行预测。方法检索美国国立生物技术信息中心...
关键词：人乳头瘤病毒53型 进化分析 B细胞 T细胞 抗原表位预测 
湖南一株猪非典型瘟病毒的鉴定及其NS5B和E2基因序列分析
《湖南农业大学学报（自然科学版）》2024年第5期98-103,共6页柳泰 胡兴业 毛婉 谢邵波 尹德明 余兴龙 
湖南省重点领域研发计划项目(2022NK2049)。
随机挑选湖南某规模化猪场出现“抖抖病”的新生仔猪,采集血清样本,用可扩增猪非典型瘟病毒(APPV)的NS5B基因和E2基因引物进行RT-PCR鉴定,对PCR扩增产物测序。随后利用MegAlign软件分析NS5B和E2基因序列的同源性,预测E2蛋白部分结构,并...
关键词：猪非典型瘟病毒 NS5B基因 E2基因 抗原表位预测 湖南 
抗原表位预测工具的研究与发展现状
《生物化学与生物物理进展》2024年第10期2532-2544,共13页李梓豪 汪源 毛甜甜 曹志伟 裘天颐 
国家自然科学基金(32370697)资助项目。
适应性免疫在抗原识别和人体免疫过程中起到十分重要的作用。本文综述了抗原表位预测工具的研究进展及其在疫苗设计和免疫治疗策略中的应用,突出了其重要性。通过分析B细胞和T细胞抗原表位的识别机制,本文阐释了表位的种类及其在免疫反...
关键词：抗原表位预测 适应性免疫 B细胞 T细胞 机器学习 深度学习 
酿酒酵母液泡电导1的抗原表位预测及抗原编码基因的克隆
《生物加工过程》2024年第3期278-288,共11页董晓宇 邱宇 曹钧雄 
国家自然科学基金(21476032)。
为了制备酵母菌液泡电导1(Yvc1)的抗原蛋白,本文首先通过生物信息学方法预测Yvc1抗原表位,并克隆其抗原编码基因。利用NCBI GenBank数据库、ORP Finder、EXPASY ProtScale、SOPMA、IEDB和NetMHCⅡpan等生物信息学工具对酿酒酵母S288c的Y...
关键词：酿酒酵母 Yvc1 生物信息学 抗原表位 基因克隆 
生殖支原体MG_095蛋白的生物信息学分析及抗原表位预测
《中国病原生物学杂志》2024年第4期411-416,423,共7页陈列松 易希阳 曾麒霖 吴移谋 
国家自然科学基金青年科学基金项目(No.81902077);湖南省自然科学基金青年基金项目(No.2020JJ5476);湖南省教育厅优秀青年项目(No.20B498)。
目的本研究旨在应用生物信息学方法对生殖支原体MG_095蛋白的理化性质进行分析,并预测其结构和表位,以探讨其作为潜在疫苗候选抗原的可能性。方法首先,利用DEG数据库分析MG_095基因是否为生殖支原体必需基因;其次,采用Prot-Param、ProtS...
关键词：生殖支原体 MG_095 生物信息学分析 抗原表位 
鹅星状病毒辽宁株分离鉴定及遗传变异分析与抗原表位预测
《中国兽医学报》2023年第11期2243-2250,共8页周慧 高慎阳 李冰 董筱萍 孙弋雅 刘英姿 甄志刚 赵岩 刘丽颖 车立忱 周铁忠 
辽宁省民生科技计划资助项目(2021JH2/10200009);辽宁省教育厅高等学校基本科研资助项目(202202006,202203001)。
从辽宁某鹅场无菌采集病死雏鹅肝脏、肾脏等病料,通过鹅胚接种、核酸检测、电镜观察等方法进行病原的分离鉴定,并对所分离的毒株进行遗传变异分析和抗原表位预测。经过接种病料鹅胚的病变特征观察、病毒PCR核酸扩增和序列分析以及透射...
关键词：鹅星状病毒 辽宁分离株 变异分析 抗原表位 
非洲猪瘟病毒B646L基因序列分析及p72蛋白质结构与细胞抗原表位预测被引量：2
《江苏农业科学》2023年第16期141-146,共6页罗世民 李中波 
湖南省怀化市科学技术局项目(编号:2020R3107);湖南省教育厅项目(编号:21C1443);湖南省科技厅项目(编号:2022JJ50319)。
为探究非洲猪瘟病毒B646L基因序列的碱基组成特点,及预测该基因所编码的p72蛋白质结构与细胞抗原表位,利用PCR技术对非洲猪瘟病毒B646L基因ORF框的序列进行扩增、测序及碱基组成分析;运用软件EXPASY、PRABI与SWISS-MODEL对p72蛋白质进...
关键词：非洲猪瘟病毒 B646L基因 p72蛋白 序列分析 结构预测 抗原表位预测 
新疆和田地区1株小鹅瘟病毒分离鉴定及VP基因的克隆分析
《黑龙江畜牧兽医》2023年第15期84-89,共6页刘建华 孙文程 胡月 吴桂灵 马彩红 撒瑞雪 阿力米古丽·乌米尔哈孜 
新疆维吾尔自治区重点研发计划项目(2020B01004-2)。
为了找到新疆和田地区某鹅场雏鹅大量死亡的原因,试验采用PCR方法及琼脂扩散试验检测了病死鹅组织,将阳性病料经无菌处理后接种无免番鸭胚,盲传3代,进行病毒分离;设计GPV VP基因特异性引物对其尿囊液进行扩增,构建重组质粒和测序,分析V...
关键词：小鹅瘟病毒 分离 鉴定 VP基因 进化分析 抗原表位预测 
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