基因表达芯片

作品数:41被引量:70H指数:4
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相关机构:南京医科大学东南大学复旦大学中山大学更多>>
相关期刊:《湘南学院学报(医学版)》《东南大学学报(自然科学版)》《中国实验血液学杂志》《现代妇产科进展》更多>>
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基于基因表达芯片和实验验证葛根素降低膀胱尿路上皮癌T24细胞IL6表达及抑制细胞增殖的作用
《中南药学》2024年第5期1186-1193,共8页马雨阳 许浩 潘登 王海跞 徐鹏 王靖凯 庞昆 韩从辉 
国家自然科学基金项目(No.82004110);中国博士后科学基金面上项目(No.2022M722674);徐州市医学后备人才项目(No.XWRCHT20220009);蚌埠医学院2022年度研究生科研创新计划150项资助立项项目(No.Byycx22129)。
目的探讨葛根素抑制膀胱尿路上皮癌T24细胞增殖的作用机制及潜在作用靶点。方法CCK8实验验证葛根素对T24细胞的增殖抑制作用。火山图和热图对芯片数据进行质量控制。对基因表达芯片实验得到的差异表达基因列表进行KEGG、GO通路富集分析...
关键词:膀胱尿路上皮癌 葛根素 IL6 T24细胞 细胞增殖 
生物信息学视角下抑郁及运动干预机制关键基因的研究进展被引量:1
《中国体育科技》2023年第3期37-43,共7页刘文彬 漆正堂 刘微娜 
国家自然科学基金项目(31871208);上海市自然科学基金项目(18ZR1412000);中央高校基本科研业务费专项资金项目(40500-21203-542500/006/004);华东师范大学优秀博士生学术创新能力提升计划项目(YBNLTS2021-022)。
应激会导致抑郁,而运动对治疗抑郁是有益的,但这些作用的机制尚未被阐明。随着大数据时代的到来和生物信息技术的革新,通过比较基因的表达差异揭示疾病发生的分子机制逐渐成为高通量研究的常用策略。基因表达芯片可帮助研究者获取大量...
关键词:基因表达芯片 差异表达基因 生物信息学 抑郁 运动干预 
采用主成分分析方法处理基因表达芯片的教学探讨
《中国科技期刊数据库 科研》2022年第7期115-118,共4页张燕 
广东省普通高校特色创新类项目(2021KTSCX155);广州工商学院校级科研项目(KAZX2021004);广东省高等学校教学管理学会2021年度课程思政建设项目(X-KCSZ2021230);广东省高等教育学会“十四五”规划2022年度高等教育研究课题(22GQN65)。
多元统计分析是解决实际问题的一种非常重要的处理数据的方法。其理论基础是由多维随机向量及相应的多元统计量、多维正态随机向量及相应的多元统计量组成的。常见的多元统计分析方法有主成分分析、因子分析等方法。本文研究通过主成分...
关键词:主成分分析 基因 教学 
基于类风湿关节炎的基因表达芯片的差异分析
《广西中医药大学学报》2021年第1期122-126,共5页陈璞 
[目的]寻找类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)新的特异性表达标记物,探索RA的发病机制。[方法]从NCBI上的GEO数据库下载GSE55235数据集,然后通过预处理以及R语言limma分析后得出表达差异基因。通过cluster Profile包对表达差异基...
关键词:类风湿关节炎 富集分析 蛋白质互作网络 
基于R语言的基因表达芯片注释流程被引量:1
《生物加工过程》2021年第1期17-22,共6页孙小洁 郑方强 曾健明 
基于R语言,将R程序包Rsubread、Rsamtools、refGenome和GenomicRanges整合为一个完整的流程,实现了基因表达芯片探针序列的自主注释。以应用范围最广的GPL570,GPL10558和曾使用的GPL21163芯片平台为测试数据进行重注释,并将GPL570的新...
关键词:基因表达芯片(GEO) 数据挖掘 R语言 
狼疮肾炎中基因表达芯片的生物信息学分析
《临床肾脏病杂志》2020年第10期775-779,共5页姜秋竹 杨会 周晓霜 
山西省自然科学基金青年基金(NO.2018D31151)。
目的采用生物信息学方法探讨狼疮肾炎(lupus nephritis,LN)发生的潜在机制。方法通过GEO数据库获得正常肾组织和LN肾组织的基因表达谱,分析二者基因表达情况,寻找差异基因,利用DAVID数据库对LN发生发展过程中的差异基因进行富集分析,使...
关键词:狼疮肾炎 生物信息学 基因 
利用基因表达芯片探索多发性硬化的关键基因和通路
《安徽医科大学学报》2019年第7期1009-1015,共7页黄帆 唐玉兰 廖韦静 邝慧敏 蓝岚 
国家自然科学基金(编号:81260188、81460194);广西自然科学基金(编号:2012GXNSFAA053082、2015GXNSFAA139212)
目的以GEO数据库中GSE21942系列芯片数据为分析对象,分析多发性硬化(MS)中的高通量基因表达来获得差异表达的基因,筛选出与多发性硬化相关的关键基因和通路。方法利用R语言与DAVID、STRING等方法对差异表达的基因进行GO和KEGG富集分析,...
关键词:多发性硬化 基因芯片 差异表达基因 生物标志物 
葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析被引量:10
《园艺学报》2019年第7期1257-1269,共13页卢世雄 王萍 何红红 梁国平 马宗桓 乔亚丽 吴玉霞 陈佰鸿 毛娟 
甘肃省委组织部陇原青年创新团队项目(LQ2018091801);甘肃省现代水果产业体系项目(GARS-SG-3);甘肃省科技重大专项(18ZD2NA006)
利用生物信息学分析、预测葡萄Trihelix转录因子家族基因的特性与功能,为葡萄抗逆基因的挖掘和利用提供理论依据。以‘红地球’葡萄(Vitis vinifera)试管苗为试验材料,对葡萄Trihelix转录因子家族进行理化性质、染色体定位、二级结构预...
关键词:葡萄 非生物胁迫 基因家族 生物信息学分析 基因表达芯片 QRT-PCR 
基因表达芯片技术筛选转移性卵巢癌相关性基因被引量:2
《现代妇产科进展》2018年第7期494-497,共4页刘贵芬 孙蓬明 阮冠宇 
2014年福建省自然科学基金项目(No:2014J01278);2015年福建省卫生系统中青年骨干人才培养项目(No:2014-ZQN-ZD-5)
目的:利用基因表达谱芯片筛选转移性卵巢癌相关性基因,对卵巢癌转移过程中可能参与的基因间的信号转导通路进行分析。方法:选取6例不同病理类型的转移性卵巢癌组织和2例正常卵巢上皮组织,提取DNA。采用CytoScan HD芯片检测,筛选卵巢癌...
关键词:卵巢癌 基因表达谱 基因本体 信号转导 转移 
通过基因表达芯片数据库研究PRAM1基因表达特征及其临床意义
《中国实验血液学杂志》2018年第2期368-374,共7页吕娜 钱坤 刘静 王莉莉 李永辉 于力 
国家自然科学基金(81400135;81370635;81570137;81470010;81670162);北京市自然科学基金(7151009)
目的:研究PRAM1基因在急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中的临床表型及其预后价值。方法:以486例急性髓系白血病患者的基因表达芯片为研究平台,结合临床资料总结PRAM1基因在多种AML亚型中的表达特征。利用正常人干细胞表达芯...
关键词:PRAM1 急性髓系白血病 t(15 17)M3 西达本胺 
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