基因共表达

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激素性股骨头坏死免疫诊断标志物的鉴定与药物筛选
《中国组织工程研究》2025年第35期7690-7700,共11页韩杰 潘成镇 尚昱志 张驰 
国家自然科学基金项目(82260858,82460872),项目负责人:韩杰;广西自然科学基金项目(2024GXNSFAA010243),项目负责人:韩杰;广西高水平中医药重点学科建设试点项目(桂中医药科教发[2023]13号),项目负责人:韩杰;广西中医药重点研究室建设项目(桂中医药科教发[2023]9号),项目负责人:韩杰;广西青年岐黄学者培养项目(桂中医药科教发[2022]13号),项目负责人:韩杰;广西中医药大学“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(桂中医大党[2024]3号),项目负责人:韩杰。
背景:激素性股骨头坏死的发病机制尚未完全明确,深入了解激素性股骨头坏死的病理及分子机制,寻找高特异性和高灵敏性诊断标志物对于防治激素性股骨头坏死至关重要。目的:筛选激素性股骨头坏死的免疫诊断标志物,并通过药物富集分析和分...
关键词：生物信息学分析 孟德尔随机化 免疫相关基因 激素性股骨头坏死 加权基因共表达网络分析 工程化组织构建 
线粒体自噬视域下的类风湿关节炎:基于多机器学习算法的互作分析
《中国组织工程研究》2025年第26期5595-5607,共13页李加根 陈跃平 黄柯琪 陈尚桐 黄川洪 
国家自然科学基金项目(82360937),项目负责人:陈跃平;广西自然科学基金项目(2023JJA140318),项目负责人:陈跃平;广西中西医结合骨与关节退行性疾病多学科交叉创新团队(GZKJ2310),项目参与人:陈跃平;广西中医药大学研究生教育创新计划项目(YCSY2023040),项目负责人:李加根。
背景:类风湿关节炎发病机制至今尚未完全清晰,近来有研究表明线粒体自噬与类风湿关节炎存在关联性,但关键机制有待深入探究。目的:利用多机器学习算法鉴定和验证类风湿关节炎中线粒体自噬过程的核心互作基因并解析其免疫调控过程。方法:...
关键词：线粒体自噬 类风湿关节炎 机器学习算法 加权基因共表达网络分析 预测模型 外部验证 免疫细胞 生物学功能 
骨关节炎中枢纽基因及在免疫浸润中作用的生物信息学分析与鉴定
《中国组织工程研究》2025年第18期3747-3757,共11页蔡溦 朱御坤 许建中 
背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚。目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况。方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55235和G...
关键词：骨关节炎 滑膜组织 枢纽基因 免疫浸润 生物信息学 加权基因共表达网络分析 
基于加权基因共表达网络分析探讨急性胰腺炎相关脓毒症潜在的关键基因
《安徽医药》2025年第5期940-944,I0002,I0003,I0004,共8页桑珍珍 冯顺易 李勇 
河北省科技厅医学科学研究重点计划项目(182777156)。
目的旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因。方法2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集。采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因。采用R软件筛选出急性胰腺炎和...
关键词：急性胰腺炎 脓毒症 关键基因 加权基因共表达网络分析 基因本体论 
加权基因共表达网络分析结合机器学习筛选糖尿病心肌病中与Th17细胞相关的核心基因
《现代医学》2025年第4期546-558,共13页秦冲 王振辉 王越 董健 赵娜 刘擎 张洪亮 
目的:探讨免疫细胞相关基因在糖尿病心肌病(DCM)中的作用,并探讨其潜在机制。方法:采用单样本基因集富集分析探讨样本的免疫浸润情况。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘与免疫浸润相关的基因。通过富集分析,分析这些基因的功能。...
关键词：糖尿病心肌病 辅助性T细胞17 加权基因共表达网络分析 机器学习 核心基因 
基于单细胞核测序的共表达网络分析人静脉畸形发生与侵袭相关的内皮细胞关键基因
《中华预防医学杂志》2025年第4期458-467,共10页刘文博 林俊杰 张媚娟 苑春杰 冯小娟 焦文婷 乔军波 王雯秋 方斌 陈长宽 
河南省重点研发专项(231111311400)。
目的利用生物信息学分析筛选内皮细胞(endothelial cell,EC)中与人静脉畸形(venous malformations,VMs)发生、侵袭相关的关键基因,为VMs早期筛查和靶向干预提供依据。方法采用病例对照研究方法,收集2021年9月至2023年9月郑州大学第三附...
关键词：静脉畸形 单细胞核转录组测序 高维加权基因共表达网络分析 关键基因 
基于转录组和WGCNA筛选小麦籽粒蛋白质累积相关调控基因
《中国农业科学》2025年第6期1065-1082,共18页潘丽媛 王永军 李海军 侯富 李菁 李丽丽 孙苏阳 
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS[2021]051);淮安市农业科学研究院发展基金(HNY202007);淮安市农业科学研究院高层次引进人才科研启动发展基金(0052023016B);生物育种钟山实验室项目(ZSBBL-KY2023-02-4)。
【目的】小麦作为重要的粮食作物,鉴定参与籽粒蛋白质合成的基因调控网络,并确定关键候选基因,为小麦品质育种和改良提供理论依据。【方法】以淮麦48的6个发育时期(花后5、10、15、20、25和30 d)的籽粒为研究材料,总结小麦籽粒蛋白质累...
关键词：普通小麦 籽粒发育 蛋白质含量 加权基因共表达网络分析 转录因子 
基于生物信息学方法挖掘调控肾透明细胞癌发生的分子生物标志物
《现代泌尿外科杂志》2025年第3期215-222,共8页郭峰 王晨宇 史振峰 赵建华 樊文龙 艾合买提·卡德尔 倪泽称 
新疆维吾尔自治区自然科学基金面上项目(No.2021D01C189)。
目的采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因(DEGs),并对...
关键词：分子生物学 生物信息学 表观遗传学 差异表达基因 肾透明细胞癌 加权基因共表达网络分析 淋巴细胞胞质蛋白2 
基于WGCNA和LASSO分析的膀胱癌生物学标志物鉴定
《医学研究杂志》2025年第3期54-61,89,共9页王书恒 刘薇薇 李九智 
新疆维吾尔自治区科技厅自然科学基金青年基金资助项目(2022D01C823)。
目的膀胱癌(bladder cancer,BLCA)是常见的疾病,其发病机制不清楚,本研究旨在发现膀胱癌的关键基因,为今后的预防和治疗提供依据。方法从美国生物技术信息中心NCBI的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中获取膀胱癌数据集GSE121711,对...
关键词：膀胱癌 生物信息学 加权基因共表达网络分析 生物学标志物 
基于WGCNA联合Lasso回归构建结直肠癌ICI治疗预测标志物并验证
《中国老年学杂志》2025年第6期1296-1302,共7页张虎 吴红雁 赵小芳 杜欣娜 
国家自然科学基金面上项目(82274339);江苏省青蓝工程(2021);江苏省产学研合作项目(FZ20210156);江苏省教育厅科研项目(22KJD310001);盐城市工程中心(YC2022808);江苏医药职业学院校企横向合作项目(2021320906000215,2023320906000197);江苏医药职业学院校院横向合作项目(2021320906000004);江苏医药职业学院校级科研项目(20214401)。
目的构建一种结直肠癌(CRC)免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的预测标志物并验证。方法首先利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得CRC免疫浸润相关基因模块。然后,利用单因素生存分析和Lasso-Cox回归构建CRC预后标签及其风险分数的计算公式,...
关键词：结直肠癌(CRC) 加权基因共表达网络分析(WGCNA) Lasso-Cox回归 免疫检查点抑制剂(ICI)治疗 
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