基因结构分析

作品数：52被引量：130H指数：6
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黑漆实蝇线粒体基因组基因结构分析
《安徽农业科学》2024年第19期77-80,共4页黄振 郭琼霞 
福建省自然科学基金项目(2011J01066,2012JO1061);福州海关科研项目(FK2022-09)。
为探究黑漆实蝇线粒体基因组基因结构,基于测定的黑漆实蝇的线粒体全基因组,采用DNAMAN V6软件测算线粒体全基因组13个蛋白编码基因(PCGs),22个trnA基因AT skew=(A-T)/(A+T)、GC skew=(G-C)/(G+C)的值,分析黑漆实蝇核苷酸的偏移率;使用W...
关键词：黑漆实蝇 线粒体全基因组 相对密码子使用频率 trnA基因二级结构 
甜瓜AMS基因结构分析及基因编辑载体构建被引量：1
《新疆农业科学》2023年第1期61-68,共8页才羿 戴冬洋 谭海 王迪 杨芬 王岭 盛云燕 
国家自然科学基金“花药发育关键转录因子AMS调控甜瓜雄性不育机理研究”(31772330)。
【目的】研究鉴定甜瓜雄性不育候选基因ABORTED MICROSPORES(AMS)的基因家族,分析CRISPR基因编技术并构建其敲除载体,为甜瓜雄性不育基因AMS功能验证提供依据。【方法】采用生物信息学技术鉴定甜瓜雄性不育候选基因ABORTED MICROSPORES(...
关键词：甜瓜 ABORTED MICROSPORES(AMS) 生物信息学 载体构建 
牛PAX3基因结构分析及蛋白功能预测被引量：2
《中国草食动物科学》2021年第5期8-11,共4页赵拴平 金海 徐磊 李默 贾玉堂 
国家自然科学基金青年项目(32002162);国家肉牛牦牛产业技术体系—合肥综合试验站(CARS-37);安徽省科技重大专项(18030701207,S202003b06020001)。
试验旨在探究PAX3蛋白的结构和功能,对后期研究其参与的生理机制提供理论依据。利用生物信息学技术对牛PAX3基因结构、蛋白保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性和亚细胞定位进行分析,并对其二级三级结构进行预测。结果显示,...
关键词：牛 PAX3 蛋白 生物信息学 
高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴转录组分析:基因结构分析与新基因发掘注释被引量：2
《中国畜牧杂志》2021年第8期131-137,共7页吴盈萍 古力娜·巴克 李海英 赵晓钰 马晨 姚莹莹 曹妍 梅志勇 潘璐 
国家自然科学基金项目(31960648)。
本研究旨在探究高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴组织的转录组差异表达基因,为完善新疆伊犁鹅基因结构和发掘新基因提供参考。实验选取健康状况良好、饲养条件一致的3岁龄高、低产蛋量新疆伊犁鹅各4只,利用高通量测序技术对高、低产蛋量新...
关键词：伊犁鹅 性腺轴 转录组 SNP 新基因 
大麻GRAS转录因子家族的全基因组鉴定及镉胁迫下表达分析被引量：6
《作物学报》2021年第6期1054-1069,共16页尹明 杨大为 唐慧娟 潘根 李德芳 赵立宁 黄思齐 
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-16-E02)资助。
GRAS转录因子在植物生长发育及抗逆境胁迫中具有重要作用。本文对大麻GRAS转录因子家族进行了全基因组鉴定,对其理化性质、系统进化发育、基因结构、基因间的共线性关系进行了分析,并利用云麻1号及内蒙古小粒大麻的转录组数据分析其在...
关键词：大麻 GRAS转录因子 系统发育分析 基因结构分析 表达分析 
苦茶全长转录组测序及基因结构分析被引量：7
《西北农业学报》2021年第4期563-571,共9页庞丹丹 刘玉飞 孙云南 田易萍 宋维希 陈林波 
国家茶叶产业技术体系(CARS-19);国家重点研发项目(2019YFD1001601)。
为进一步探究苦茶特异性状形成的遗传基础,基于PacBio对苦茶进行Iso-Seq,最终得到Polished consensus序列132334个,其中有26184个为已知基因的新转录本,7115个为新基因,同时鉴定得到21106个SSR位点;基因结构分析结果中,4892个基因发生...
关键词：苦茶 全长转录组测序 LncRNA 可变剪切 
沙雷菌CRISPR-Cas系统的基因结构分析被引量：3
《中国病原生物学杂志》2020年第4期396-401,共6页王梦园 毕春霞 兰蕾 张蒙蒙 秦江楠 罗玮 朱元祺 闫志勇 
目的CRISPR-Cas系统是细菌中的适应性免疫防御系统,能特异性阻止噬菌体、质粒等外源基因的侵袭从而维护自身基因组的完整性。本研究在基因组水平对沙雷菌属CRISPR-Cas系统的整体结构及主要特征进行分析。方法利用CRISPRfinder、BLAST在...
关键词：CRISPR-Cas 沙雷菌属 免疫防御 前噬菌体 
小麦热激蛋白转录因子C家族基因的结构及其在干旱胁迫中的表达被引量：1
《麦类作物学报》2020年第4期416-424,共9页王付娟 李宗震 仝胜利 李淑梅 
小麦热激蛋白转录因子在热胁迫和耐热性产生的过程中发挥重要作用。为进一步了解小麦热激蛋白转录因子C亚家族,本研究采用全基因组信息保守结构域比对和进化聚类分析,共鉴定了24个小麦TaHsfC基因,并对TaHsfC亚家族成员染色体定位、基因...
关键词：热激蛋白转录因子C 干旱胁迫 基因结构分析 表达模式分析 小麦 
雷蒙德棉第Ⅲ类过氧化物酶全基因组鉴定和表达分析被引量：3
《生物技术进展》2019年第5期490-501,共12页高正银 孙文杰 宋晓云 胡轼 左开井 
国家自然科学基金项目(31071458)资助
第Ⅲ类过氧化物酶(Class Ⅲ Peroxidases,Prxs)是植物特有的过氧化物酶家族,存在于植物细胞外空间或液泡中,参与了植物抗逆和生长发育等多个过程。为了分析过氧化物酶基因在棉花纤维发育过程中的功能,利用蛋白保守结构域分析方法,对雷...
关键词：棉花纤维发育 第Ⅲ类过氧化物酶 基因结构分析 基因表达分析 
胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析被引量：2
《甘肃农业科技》2019年第8期35-40,共6页齐燕妮 李闻娟 王利民 赵玮 党照 谢亚萍 张建平 
国家自然科学基金（31760426）资助
利用多个物种的SUC基因蛋白序列在胡麻基因组内进行BlastP分析,通过Pfam确认结构域,获得胡麻SUC基因家族成员,并进行基因结构分析;对蛋白分子量、等电点、信号肽、跨膜结构域、糖基化修饰位点、亚细胞定位、Motif及二级结构进行预测。...
关键词：胡麻 SUC基因家族 基因结构分析 系统进化分析 
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