基因注释

作品数：184被引量：584H指数：12
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茶树炭疽菌N425全基因组测序与基因功能注释被引量：2
《福建农业学报》2023年第12期1437-1444,共8页张承康 周子文 郭田龙 彭成彬 陈美霞 刘伟 
国家自然科学基金项目(32001853);生物农药与化学生物学教育部重点实验室开放课题(Keylab2020-05);宁德师范学院科研项目(2020Y02、2022T01)。
【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结...
关键词：茶树炭疽病 基因组测序 基因注释 致病相关基因 
油茶优良无性系‘闽60’叶绿体基因组数据分析
《福建热作科技》2023年第1期1-4,共4页王小薇 范敦锦 陈世品 
福建省种业创新与产业化工程项目资助(ZYCX-LY202103)。
研究油茶优良无性系‘闽60’Camellia oleifera‘Min60’叶绿体基因组信息,对其叶绿体基因组进行测序、组装、注释和分析。结果显示,叶绿体全长156,975 bp,GC含量37.28%,包括一个大的单拷贝区(LSC)86,658 bp,一个小的单拷贝区(SSC)18,40...
关键词：油茶 ‘闽60’ 叶绿体基因组 基因注释 系统发育 
三种蚜虫的线粒体基因组数据
《生物多样性》2022年第7期233-238,共6页卢聪聪 刘倩 黄晓磊 
国家自然科学基金(31970446)。
完整的线粒体基因组已被广泛应用于分子进化、基因组学、系统发育等方面的研究。蚜虫是一类重要的农林业害虫,但目前公开报道的蚜虫完整线粒体基因组非常有限,因此获得更多的基因组数据对相关研究具有重要价值。本文报道了榕毛管蚜(Gree...
关键词：蚜虫 线粒体基因组 基因注释 基因组数据 
基于RNA-seq的番茄青枯病响应基因鉴定与表达分析被引量：1
《华北农学报》2022年第2期171-182,共12页史建磊 熊自立 苏世闻 王克磊 宰文珊 
浙江省农业新品种选育重大科技专项子课题(2021C02065);温州市基础性科研项目(N20180003);温州国家农业科技园区开放性项目(K20200006);温州市农业新品种选育协作组项目(2019ZX007)。
为了挖掘番茄青枯病抗性基因,对青枯菌侵染前后的不同番茄自交系进行转录组测序(RNA-seq)。结果发现,在12个样本中共获得75.02 Gb的高质量数据,以差异倍数(FC)≥2且错误发现率(FDR)<0.01为标准,在抗、感番茄中分别获得970,695个差异表...
关键词：番茄 青枯菌 转录组 差异表达基因 基因注释 定量表达 
南亚实蝇转录组及嗅觉相关基因的初步分析被引量：5
《热带作物学报》2019年第9期1796-1803,共8页杜迎刚 季清娥 赖钟雄 
山东省高等学校科技计划项目(No.J15LF62);潍坊科技学院三大平台科研项目(No.2018YY010);山东省本科高校教学改革研究项目(No.2015M198)
南亚实蝇Bactrocera tau(Walker),是葫芦科、茄科蔬菜和多种热带、亚热带果树上的主要害虫,抗逆性强,繁殖速度快,防治难度大。为挖掘可用于生物防治的分子靶标和探讨副信息素类引诱剂对其作用的分子基础,本研究采用Illumina HiSeq2500 P...
关键词：南亚实蝇 转录组分析 高通量测序 基因注释 嗅觉基因 
濒危珍稀植物半枫荷的转录组分析被引量：10
《植物研究》2019年第2期276-286,共11页叶兴状 刘丹 罗佳佳 范辉华 张国防 刘宝 陈世品 
福建省第三轮种业创新与产业化工程-特色树种香叶树;半枫荷种质创新与产业化工程项目(ZYCX-LY-2017002)~~
为加强中国特有濒危植物半枫荷资源的保护与利用工作,采用高通量测序平台Illumina HiSeq 2500对其进行转录组测序,将得到的数据过滤后进行de novo组装并聚类去冗余,获得77 629个Unigenes,通过九大功能数据库比对、分析、注释,最终有45 ...
关键词：半枫荷 转录组分析 基因注释 药用活性成分 代谢通路 
西方蜜蜂的基因注释信息优化及新基因鉴定被引量：5
《上海交通大学学报（农业科学版）》2018年第3期39-44,共6页郭睿 张璐 熊翠玲 郑燕珍 付中民 陈大福 
国家自然科学基金(31702190);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2017342;CXZX2017343)
西方蜜蜂(Apis mellifera)全基因组序列早在2006年就已公布,但其基因注释信息并不完善。本研究利用前期获得的意蜂幼虫肠道RNA-seq数据对西方蜜蜂基因组的已知基因进行结构优化,对新基因进行预测、鉴定和分析。利用Cufflink软件进行转...
关键词：西方蜜蜂 意大利蜜蜂 幼虫肠道 基因结构优化 新基因鉴定 
草珊瑚叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析被引量：2
《中草药》2016年第23期4235-4241,共7页谢德金 沈少炎 姚旺 荣俊冬 何天友 陈礼光 郑郁善 
福建省科技重大专项资助(2004YZ02-05);福建省科技创新平台资助(2008Y2001)
目的构建草珊瑚Sarcandra glabra叶片全长c DNA文库,进一步发掘与草珊瑚代谢及抗逆相关的基因,为草珊瑚功能基因的发现提供实验基础。方法以草珊瑚的嫩叶为实验材料,利用SMART法(即Clontech公司SMARTer试剂盒)构建草珊瑚全长c DNA文库...
关键词：草珊瑚 全长CDNA 表达序列标签(EST) 基因注释 GO功能注释 
稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析被引量：1
《福建农林大学学报（自然科学版）》2011年第6期570-575,共6页翟焕趁 连壁 王杏杏 王宝华 鲁国东 王宗华 
国家公益性行业计划(200803008);国家自然科学基金(30400260;3000111)
对稻瘟病菌菌株FJ81278进行基因组和转录组分析,发现一个新的特异基因MoHsbA编码的蛋白具有疏水表面结合蛋白A(HsbA)结构域和一个信号肽.进一步的生物信息学分析发现,该基因组中另外7个基因编码的蛋白也具疏水表面结合蛋白结构域.稻瘟...
关键词：稻瘟病菌 疏水表面结合蛋白A 转录组 表达分析 
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