公共数据库

作品数：134被引量：251H指数：7
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GEO公共数据库中4例多指畸形患者细胞间质和上皮细胞的单细胞转录组分析
《中国组织工程研究》2025年第20期4379-4388,共10页傅东升 艾克热木江•木合热木 
新疆维吾尔自治区自然科学基金 (2020D01C196),项目负责人:傅东升。
背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能。目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征。方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间...
关键词：多指畸形 转录因子 生物信息学 单细胞转录组分析 微环境 Heghog信号通路 大数据分析 
铁死亡相关基因在头颈癌中的表达及临床意义
《内蒙古师范大学学报(自然科学版)》2025年第2期111-119,共9页尚多 武旭 周兴安 苏尼特 德乐黑巴特尔 申铁兵 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目“LncRNA GSEC竞争性结合miR-144调控CXCL8在口腔鳞癌中的作用及机制研究”(2024QN08053);内蒙古自治区高等学校科学研究资助项目“数字化导板辅助精确治疗颧眶骨折的临床研究”(NJZY21634);内蒙古医科大学联合资助项目“血清外泌体circRNA在口腔鳞癌中的差异性表达及其功能的研究”(YKD2023LH032)。
采用生物信息学方法探索与头颈鳞状细胞癌(headandnecksquamouscellcarcinoma,HNSCC)组织中铁死亡相关的基因,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为HNSCC患者提供新的分子靶点。通过GEO数据库检索筛选得到基因微阵列数据集GSE22...
关键词：HNSCC 生物信息学 免疫浸润 铁死亡 公共数据库 
基于公共数据库RNA-seq 鉴定亚洲人种肝细胞癌自噬相关基因预后特征
《实用肿瘤杂志》2024年第6期549-560,共12页陈睿鹏 臧洪婧 龙伟 
国家自然科学基金青年项目(82102805);湖南省自然科学基金项目(2021JJ40890)。
目的基于公共数据库探究亚洲人群肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)与细胞自噬的特征关系。方法从PubMed上文献检索收集232个自噬相关基因(autuphagy-related genes,ARGs)。从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和国...
关键词：肝细胞癌 自噬相关基因 亚洲人种 预后风险模型 列线图 生物信息学 
基于公共数据库的结肠腺癌中DNA甲基化调控SLC35D1表达及临床意义
《临床误诊误治》2024年第18期44-52,共9页徐冬梅 张佳佳 宋清玲 贾克然 
国家重点研发计划项目(2022YFF0710300)。
目的探讨结肠腺癌中DNA甲基化调控SLC35D1表达及与预后的关系。方法从癌症基因组图集(TCGA)数据库下载结肠腺癌的表达和甲基化数据,分析SLC35D1在结肠腺癌组织和正常组织的表达和甲基化情况,同时从基因表达数据库下载结肠腺癌的表达和...
关键词：结肠肿瘤 腺癌 SLC35D1 DNA甲基化 预后 列线图 肿瘤微环境 
缺氧微环境对转移性皮肤黑色素瘤预后及免疫治疗的影响
《中国美容整形外科杂志》2024年第8期471-476,共6页杨文超 秦瑞宁 张俊瑕 
目的建立一种基于缺氧基因模型来评估皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)预后和免疫微环境.方法自2023年3-7月,河西学院附属张掖人民医院公卫科通过检索公共数据库(TCGA、GEO、GTEx)查找SKCM病例,Cox回归分析筛选缺氧相关性状...
关键词：皮肤黑色素瘤 缺氧 免疫治疗 公共数据库 生物信息学 
细胞外基质微环境在心脏纤维化发生发展中的作用和机制被引量：1
《医用生物力学》2024年第S01期352-353,共2页樊永亮 霍云龙 
国家重点研发计划项目,2021YFA1000200,2021YFA2000203;国家自然科学基金项目,11732001;深圳市科技研发计划项目,KQTD20180411143400981
目的心脏纤维化与细胞力学微环境关系密切,生物力学刺激通过力学信号转导调控细胞生物功能,促进心脏纤维化的发生发展。本研究的目的是研究巨噬细胞Piezo1在心脏纤维化中的功能。方法对公共数据库心力衰竭数据进行生物信息学分析,该项...
关键词：心脏纤维化 促炎性细胞因子 C57BL/6J小鼠 高代谢 细胞外基质 公共数据库 生物力学 成纤维细胞 
基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型
《四川大学学报（自然科学版）》2024年第3期335-345,共11页孙希野 蒋灿 罗旭 舒佩 王森 周科讯 黄媚娟 
四川大学华西医院临床研究孵化项目重点项目(2021HXFH055)。
为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因...
关键词：食管癌 焦亡 铁死亡 预后风险模型 公共数据库 
新型神经胶质瘤生物标志物NDUFA6-DT的发现及调控机制的研究
《医用生物力学》2024年第S01期589-589,共1页黄瑞婷 孔颖 罗芷晴 李趣欢 
国家自然科学基金项目,31870928,32271360;广东省自然科学基金项目,2021A1515010040,2023A1515010829
目的胶质瘤是脑部常见的原发性恶性肿瘤,其治疗和诊断一直是临床难题。长链非编码RNA在癌症发生发展过程中起着重要作用,但在胶质瘤中的研究尚不充分。因此,本研究旨在确定适用于不同等级胶质瘤的lnc RNA特征,并探索其临床意义和潜在机...
关键词：临床难题 生物标志物 神经胶质瘤 公共数据库 生物学机制 生存分析 基因突变 免疫反应 
基于公共数据库的胶质瘤预后相关基因筛选被引量：1
《癌变．畸变．突变》2024年第3期195-201,共7页张艺 高含 郑展越 谭启涛 杨敏丽 孙艳 
广西自然科学基金(2023GXNSFAA026035)。
目的:基于公共数据库筛选与胶质瘤临床预后相关的基因。方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中获取编号为GSE31095的基因芯片数据,利用R包“limma”筛选差异表达基因,并对其进行基因本体论(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)...
关键词：胶质瘤 生物信息学 关键基因 预后 
基于公共数据库挖掘并分析雄激素性脱发的关键基因
《蚌埠医学院学报》2024年第6期763-766,共4页董姝颖 芦桂青 
江苏省南京市医学科技发展项目(YKK20216)。
目的:利用生物信息学方法探讨雄激素性脱发(AGA)的潜在分子机制。方法:从美国国立生物技术信息中心公共数据平台的基因表达数据库中下载基因芯片数据集(GSE45512、GSE36169),利用GEO2R在线分析工具对其进行分析并获得各自的差异基因(DEG...
关键词：雄激素性脱发 公共数据库 关键基因 生物信息学 
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