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作品数：601被引量：2524H指数：21
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锥栗优良无性系遗传多样性的EST⁃SSR分析
《森林与环境学报》2024年第5期484-491,共8页杨金辉 王一帆 李颖林 江锡兵 陈辉 李煜 
福建农林大学林学高峰学科建设项目(72202200205);福建农林大学科技创新专项基金项目“锥栗疫病抗性的多群体遗传解析与分子标记辅助选择”(KFB23048)。
为促进锥栗新品种的选育、种质资源的鉴定和锥栗产业的健康发展,以福建省建瓯市栽培的22个锥栗优良无性系为研究对象,利用开发的6对多态性表达序列标签-简单重复序列(EST⁃SSR)引物对其遗传多样性进行研究,并构建指纹图谱。结果表明,22...
关键词：锥栗 表达序列标签-简单重复序列 无性系 遗传多样性 指纹图谱 
基于EST-SSR标记的沙棘品种鉴定及指纹图谱构建被引量：3
《生态与农村环境学报》2024年第3期374-385,共12页赵雨欣 张哲文 考惠霞 孙永江 辛智鸣 赵喆 董树斌 程瑾 
国家重点研发计划政府间国际科技创新合作专项(2019YFE0116500);国家林业和草原局林业行业标准制修订项目(2020-LY-062);高等学校学科创新引智计划111项目(B13007)。
以沙棘(Hippophae rhamnoides)优良品种“实优1号”为材料,对其叶片进行转录组测序,利用微卫星识别软件(microsatellite identification tool,MISA)和Primer 3(version 2.3.4)对获得的序列进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR...
关键词：沙棘 表达序列标签微卫星 指纹图谱 遗传多样性 
美洲鲥脑转录组多态性EST-SSR的规模化开发与利用被引量：1
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2023年第11期1-12,共12页于爱清 施永海 徐嘉波 刘永士 
上海市科技兴农重点攻关项目(2021-02-08-00-12-F00788)。
【目的】挖掘美洲鲥脑组织转录组数据中的EST-SSR,规模化开发多态性较好的EST-SSR,为美洲鲥种质资源评估提供分子标记。【方法】采集2龄美洲鲥雌雄个体(各3尾)的脑组织,提取其RNA,构建cDNA文库,进行高通量转录组测序。用MISA软件进行脑...
关键词：美洲鲥 高通量测序 脑组织转录组 微卫星标记(SSR) 表达序列标签SSR(EST-SSR) 
延胡索转录组表达序列标签微卫星标记的开发及其功能分析
《华西药学杂志》2023年第4期399-404,共6页张琪 李浩玲 王春花 史若彤 蒋雪梅 祁俊生 周浓 石汝杰 
重庆三峡学院青年项目基金(20200081);三峡库区道地药材绿色种植与深加工重庆市工程实验室开放基金(061800107);重庆市渝东北特色生物资源开发利用工程技术研究中心开放基金(20200115)。
目的研究延胡索块茎和叶转录组水平上表达序列标签微卫星(EST-SSR)的分布规律,分析其差异性,并探索含EST-SSR基因的生物学功能,为延胡索遗传多样性评估和遗传育种提供方法和依据。方法利用生物信息学方法构建延胡索块茎和叶的转录组EST-...
关键词：延胡索 块茎 叶 转录组 表达序列标签微卫星 单基因 碱基 重复 功能分析 
上海药物所等解析人源松弛素/胰岛素样肽受体4复合物三维结构
《高科技与产业化》2023年第2期86-86,共1页
人源松弛素/胰岛素样肽受体4(Relaxin family peptide receptor4,RXFP4)为A类G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR),2003年首见于人类基因组数据库,2005年被证实为胰岛素样肽5(Insulin-like peptide 5,INSL5)的内源性受体。I...
关键词：上海药物所 肠道蠕动 内源性配体 G蛋白偶联受体 松弛素 三维结构 表达序列标签 胰岛素样 
基于EST-SSR标记鉴别人参、西洋参和三七的研究被引量：6
《药物分析杂志》2022年第3期394-401,共8页范馨元 王添琦 惠赫童 武伦鹏 林成日 刘丽梅 
吉林省科技发展计划项目(20190304108YY)资助。
目的:应用简单重复序列(SSR)标记对人参属植物人参、西洋参和三七进行鉴别。方法:利用EGassembler对NCBI的EST数据库进行预处理,SSRIT网站寻找SSR位点后用Primer3设计特异性引物。采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳2种方法筛选...
关键词：表达序列标签(SSR) 人参 西洋参 三七 鉴别 
基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源被引量：9
《核农学报》2021年第4期780-788,共9页叶新如 刘建汀 李永平 朱海生 温庆放 
福建省属公益类科研院所基本科研专项(2018R1026-2);福建省农业科学院科技创新团队建设项目(STIT2017-1-2);国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站(CARS-23-G-53);国家特色蔬菜产业技术体系福州综合试验站(GARS-24-G-07)。
种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进...
关键词：冬瓜 表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR) 人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法 多态性 
草石蚕块茎膨大相关SSH文库构建及分析被引量：2
《分子植物育种》2020年第17期5650-5657,共8页耿广东 杨祎 张素勤 
贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑(2018)2330号);贵州省科技厅重大专项计划(黔科合重大专项字(2016)3002号)共同资助。
为挖掘草石蚕块茎膨大的关键基因,研究其分子机理,以快速膨大的草石蚕块茎为测验方,幼嫩块茎为驱动方,构建了草石蚕块茎膨大相关正向SSH文库。从文库中随机挑选阳性单克隆,利用引物Nest-1和Nest-2R对其进行验证,获得400个克隆,插入片段...
关键词：草石蚕(Stachys sieboldii Miq.) 块茎膨大 SSH文库 表达序列标签 
日本落叶松种子园群体遗传多样性评价被引量：10
《森林与环境学报》2020年第4期406-411,共6页杜超群 许业洲 孙晓梅 
湖北省自然科学基金项目(ZRMS2018001925)。
利用16个表达序列标签简单重复序列(EST-SSR)标记对日本落叶松种子园遗传多样性进行分析评价,旨在明确该种子园的遗传基础,为后期育种策略的制定和遗传改良的可持续发展提供参考依据。结果表明:群体平均有效等位基因数(Ne)为2.542,平均...
关键词：日本落叶松 种子园 表达序列标签 简单重复序列标记 遗传多样性 
牛樟芝菌丝体全长cDNA文库构建及EST序列分析被引量：1
《中草药》2020年第4期1052-1059,共8页李晶 陈莉 刘朋虎 夏舒宁 刘艳玲 林占熺 
福建省教育厅中青年科技项目“牛樟芝深层发酵及其三萜成分差异研究”(JT180121)。
目的为了更好地挖掘牛樟芝Antrodiacinnamomea菌丝体三萜合成和代谢相关基因、筛选互作蛋白和牛樟芝指纹图谱分析,构建了牛樟芝菌丝体cDNA文库并分析其表达序列标签(EST)序列。方法以牛樟芝菌丝体为材料,采用Gateway法构建其cDNA文库,...
关键词：牛樟芝 CDNA文库 表达序列标签 GO功能注释 SSR 
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