云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- PSSM

PSSM: 作品数：14被引量：24H指数：3; 导出分析报告; 相关领域：生物学更多>>; 相关作者：项新媛李前忠丛春雨聂仁灿周冬明更多>>; 相关机构：云南大学东北师范大学物理科学与技术学院东北大学更多>>; 相关期刊：《化工科技》《计算机科学与应用》《Quantitative Biology》《南京理工大学学报》更多>>; 相关基金：国家自然科学基金辽宁省教育厅科学基金江苏省自然科学基金江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>

RF-PSSM:A Combination of Rotation Forest Algorithm and Position-Specific Scoring Matrix for Improved Prediction of Protein-Protein Interactions Between Hepatitis C Virus and Human: 《Big Data Mining and Analytics》2023年第1期21-31,共11页Xin Liu Yaping Lu Liang Wang Wei Geng Xinyi Shi Xiao Zhang; The identification of hepatitis C virus(HCV)virus-human protein interactions will not only help us understand the molecular mechanisms of related diseases but also be conductive to discovering new drug targets.An incr...; 关键词：protein-protein interactions hepatitis C virus position specific scoring matrix two-dimensional principal component analysis rotation forest

使用核SVM和分割PSSM预测凋亡蛋白亚细胞位置: 《计算机科学与应用》2021年第3期710-719,共10页夏新男; 凋亡蛋白与人类的一些疾病密切相关。准确的获得凋亡蛋白的亚细胞位置对理解疾病的发病机制和药物研发有至关重要的作用。目前,研究者们主要是通过蛋白质序列获取特征信息,从而对蛋白质亚细胞位置进行预测定位并获得了较好的结果。在本...; 关键词：凋亡蛋白 PSSM 分割物理化学性质核SVM

WEDeepT3: predicting type Ⅲ secreted effectors based on word embedding and deep learning: 《Quantitative Biology》2019年第4期293-301,共9页Xiaofeng Fu Yang Yang; supported by the National Natural Science Foundation of China(No.61972251).; Background:The type Ⅲ secreted effectors(T3SEs)are one of the indispensable proteins in the growth and reproduction of Gram-negative bacteria.In particular,the pathogenesis of Gram-negative bacteria depends on the ty...; 关键词：typeⅢsecreted effectors word2vector PSSM feature representation

多孔壳微胶囊对硬化砂浆抗渗性的影响被引量：1: 《复合材料学报》2019年第4期982-992,共11页张力冉邢锋王芳董必钦孔祥明; 国家自然科学基金(U1301241); 采用原位聚合与水解缩聚法,以四乙氧基硅烷(TEOS)、环氧树脂(E51)、苯乙烯(St)等为主要原料,合成了一种二氧化硅多孔壳微胶囊(Porous silica shell microcapsules,PSSM)。分别采用SEM、FTIR、TGA对PSSM外观形貌、化学组分、核壳比进行...; 关键词：PSSM 交流阻抗法孔结构自修复抗渗性

自动编码器方法的蛋白质二级结构预测被引量：2: 《生物信息学》2018年第1期36-42,共7页张帅燕刘毅慧; 国家自然科学基金项目(61375013);山东省自然科学基金项目(ZR2013FM020); 蛋白质二级结构预测是进行蛋白质三级结构研究的重要基础,氨基酸的编码方式对二级结构预测有一定的影响。本文应用了一种新的组合编码方式,即将基团编码与位置特异性打分矩阵(PSSM)进行组合的编码方式。本文中提出的基团编码是针对氨基...; 关键词：蛋白质二级结构预测基团编码 PSSM 贝叶斯分类器自动编码器

基于差分进化算法的MHC-I结合亲和力预测方法: 《电子技术与软件工程》2015年第22期187-187,共1页丛春雨王忠英; 在细胞免疫反应中,抗原表位与MHCs的结合扮演着重要角色。预测多肽与MHC分子结合的准确率已有很大的进步,最近,MHC-多肽的结合预测模型趋向预测结合力亲和力的大小,代替了以前判断多肽是"结合"和"不结合"的预测结果,在本文中,使用了差...; 关键词：主要组织相容性复合体(MHC) 预测结合力差分进化算法(DE) 位置特异性得分矩阵(PSSM) 多肽

基于加权PSSM直方图和随机森林集成的蛋白质交互作用位点预测被引量：7: 《南京理工大学学报》2015年第4期379-385,共7页魏志森杨静宇於东军; 国家自然科学基金(61373062);江苏省自然科学基金(BK20141403);江苏省"六大人才高峰"项目(2013-XXRJ-022); 为了提高蛋白质相互作用位点预测的精度,该文基于蛋白质位置特异性得分矩阵(Position specific scoring matrix,PSSM),提出了一种新的加权得分矩阵直方图特征表示方法;针对训练数据的极端不平衡,结合下采样和分类器集成方法,训练随机森...; 关键词：蛋白质作用位置特异性得分矩阵加权得分矩阵直方图随机森林分类器集成

利用位点特异性打分矩阵对大肠杆菌启动子的预测被引量：2: 《生物信息学》2015年第2期125-130,共6页闫妍万平; 启动子是基因转录起始的一个关键性元件。本研究利用数据库中提供的大肠杆菌启动子数据,基于位点特异性打分矩阵(Position-specific scoring matrix,PSSM)算法建立了大肠杆菌启动子预测方法,并采用ROC曲线对预测结果进行评估。结果显示...; 关键词：大肠杆菌启动子位点特异性打分矩阵(PSSM) 预测

基于结构比对模板库的蛋白质模型评估被引量：2: 《药物生物技术》2015年第2期105-111,共7页刘冠军周莉颜思奇李娟方慧生; 蛋白质天然构象预测是计算生物学领域最具有挑战性的课题之一。基于模板的预测方法是目前最为准确的方法,该方法的预测模型的好坏很大程度上在于其模板质量的好坏。从SCOP数据库中筛选了3 867个蛋白质,通过结构比对和统计分析,建立了一...; 关键词：同源模建结构预测模型评估 TM-score RMSD PSSM

阴影绘制中的PSSM与VSM混合算法被引量：3: 《计算机工程》2015年第2期228-233,共6页刘松平肖德贵; 湖南省教育厅基金资助项目"基于多信息融合处理技术的交通隧道火灾检测研究"(13C270); 在三维阴影绘制中,平行分割阴影图(PSSM)算法存在第一个分割区域过小而导致锯齿现象的缺陷,方差阴影图(VSM)算法则会引起严重的光渗现象。针对以上不足,提出一种结合PSSM与VSM的混合算法。通过设置扩大系数解决PSSM算法首个分割区域不...; 关键词：图像区域平行分割阴影图三维阴影绘制混合算法帧率

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